Ciona intestinalis - RPS5


SpeciesCiona intestinalis
Gene NameRPS5
5' Upstream
tggtttcatacaccttgttcccgcttacgagttaccacgtatgtaacttgtttatcctgg
cgtggcgggcaactgcagccgttataaaacaggcgttctgtttcataccaccttgtgccc
gcttacgagttaccatgtgtgtaacttatttatccttgcttggcggggcaacgacaggtg
ttataaaacaggtgttttgtttcatacaactcgcaccgctaagtctgcgataacagataa
cgtttaacgcctggagcatcaaagtattttgtaaacaattctatgaattcgctgtattta
ctcctctttataagcctgactaaaactagagagttgtaggcgaacaccttccatacaaaa
gaacgacctacctagattaggaaatttgatatcccaaccagatttataattgttaattgt
taccttttgtacagaaacatatgtgccctatcgtgtctagcacggcactttacattttaa
attacctctatcgttcgcatgctgtcgaagtcggctgtattgatttggctgtgaggtaaa
atatatagtgctagtaacgttacaggaggccggattcgaattctataattgtttcctgtt
tcaacttttactgaactttatttcagcaactggaaagcgagctacgtcattcctactcat
gtttccttatcggcacaaataccaatattgttttgattttatttttcgggtcgatagcaa
aatttataatacggcatagcggcctccgctaaaacaatcgctaaaacacagagcatgtat
tgaccataatgggtaattggttattctatttggtttatatacctagtaatggcaaacata
acgctagaattagtaaataaatattacgttttctttttcaaaaagtgattctaagtcaaa
tttaggttatctaactttgtaagtggtgtaaaggtgtgtagtttagttaaaaaacgaaca
acctcaaaacccttattttgttttcaaatgcagattatat
Exon 1
GTTTTATTTAACCATACTACTCCCCTATGAGATTTACCATTTAGCGCCGGCAGTGGTGGA
AAATCGCGTGTAGTTTCTCTTTTTTAAGTCGTCATTTCCCTTTTCAGAAAAGTCGCCACG
AAAAT
Intron 1
gtaagtttgatgtattttggacgtttttagctaaattaacacccatttttttagtatttt
ttgttaaaaacgatgaccagatagtgtaggggtaatttacatagtttttaaagccaaatg
gacgccataaacgtatcctaaatcggcgaaacacttttgacgttagttttaacttaattt
ttgattttcgatagctacaacgccgctatacgttcgtaaaacattggtttaaactatgtc
ctgtcttttctattttaaaataataccttattattgaaaaaatagtgtttatttaaagta
cagtatgtaaccttgtctttgtacacccgttttatatcgactgtgtttgccttgctatgc
gaggataaacatcaattcaaataaaattatttctaatgacatacaatgcatagtcaagta
aaaaacaaaactacacaactcgtattcaagtaaaattacttataatttgtagttacaagt
ttaaaattacataccaattcttcacaatcccattcattaccaaacaatccccattatggc
atcatcag
Exon 2
ATGGAGGAAGACTACGAAGCAGACGTTATCGTAGCTGAAGCACCCGAGGTGAAATTGTTC
GGACGATGGACAACAAGTGATGTTCAGATCAATGACATCTCACTCACG
Intron 2
gtaagcatgtgctggattgtgcttgcttaatttaatttctgtatatcatgtatacagtca
gtcgccatggcaaattggtgagccctacttgtaattaaaagtaatgggttcaaagctgct
accattgtggatgtatgtgaccttgggcaagacacttgacagaaactgctccaatccagt
ggcccctaataacttgacagtgagcatgagctgtatgcatacaccatgtgtgtctggtgt
ataagaaaacacccatgttatacctcaacagtgagcataaggtgtatgaatacaccatgt
gtgtcttgcatacaaagaagagagcattttctttagcaattgctataccaatatgtaaat
ctaattgaccaaccgtgtttttttttatacaagtctggtccgtaagaataaagcatttgg
tatcacctcataattatttagattataacaccacatataaaaactaaccaccttttccta
cag
Exon 3
GACTACTTACCCGTGAAGGACAAATACTCCAAGTATCTTCCTCACAGCTCCGGTCGTTAC
CAGATCAAACGCTTCCGTAAAGCACAATGTCCCATTGTGGAGCGCTTGGTTAACTCCATG
ATGATGCATGGACGAAACACTGGCAAGAAACTGCTGACTGTTCGAATCATCAAACATGCG
TTTGAGATCATCCATCTTTTGACTGGTGAA
Intron 3
gtgagtgattgtactttgatattatttgtttgctgttttgcttatacggtaagaactaaa
aaggcaatatgtttttgcctcgtcatgcatatttagcgtgtatgcctgactctgagaagt
gcctgcttacaagttgccacgtgtacaacattgtgtgtatatcagcataccaatcataca
aaaagtgaaaacgtgtaagcttgtatgaggtgtatgaaacagaacacctgtgttataact
actgttaataccccaccgcgtaaagatataaagttgcatctatggttacttgtaaaaagg
cacaaaagtgcaagatacaaaatacccattttataaggtctgtcgttacctataattaag
ttttattccattatatcaaatacattcaatacatatacctccttctag
Exon 4
AATCCACTTCAAGTTTTGGTGAATGCTATTATCAACAGTGGTCCACGTGAAGATTCCACT
CGTATTGGTCGTGCGGGTACAGTAAGAAGACAG
Intron 4
gtacaaatacatatattcatgttgtgttaattttaaatattttcatgttgtattccttat
gtctataaatacttgcttcagtacttgactggtttaatctgttaatgtgtacaaagtttt
aacctgtttttgtgttatttgttattttagttacaaactgatgtaactgctatggtttta
atttttcaaactgcgaactacttatttgtttcacatttttacatataaaagtttttagtg
tatacaggtttgtggtgccaaagtatattgtgctggttacctgcattttttgttattaat
cattaactgcatttatatgtcaccccagattttttgtaaaatgaaagttgtgacacttac
ggcatggaaaaacagtagaaaagttgtaatttctgtgctacatattatacaaaacactaa
tagtaccatgcatatacaaaactacatattacacaccaccaatatattttaatacattac
acaacactaattctgtaattcattacttttgttgtactgtttcctacatattatattgta
tatctctttaccttacag
Exon 5
TCTGTGGACGTATCACCATTACGTCGAGTCAACCAAGCTATCTGGTTATTGTGCACCGGT
GCACGCGAGGCTTCTTTCCGTAACATTAAGACGATTGCTGAGTGTTTGGCTGATGAACTC
ATTAACGCTCATAAG
Intron 5
gtgaatattgctgcgtggttctaaatttgtagcagagtgaaaaacttctgagatatatgc
cgcctaatggcctaattgtttttgagagtttagactacagtgagttttgaatgtatatct
cctcccag
Exon 6
GGCTCATCTAACTCGTATGCCATCAAGAAGAAGGATGAACTTGAGAGAGTCGCAAAATCC
AACCGTTAAAATGCATCGGCAATAATGGAAATAAAATCTCAAACCAAT
3' Downstream
ttgtggatttctagtttaaatgcacaccaatgactatagtgtaggttggggtatatagta
gggtgggggaagatggggcacatttcctgatcgtgttttaaacaattaacaacggtctat
gggagttgtgaggagacggtttaataagtctttgaatcttctttgtttactaccaaatgg
gacaagacaatagagtgaaacagtgtcccatcttttctaccctactatatataactccac
ttaaagtattattttgaccacatacttagagtcaaacagtggatatgttctattatattt
aactaacttttattgttttaattcggcagcacaaacttttaaaggtataatgcttaagtc
ttccagcattgttagatttagtcaagagttagcccattacagtatgggttgcagtataac
aggtagtagtatatttagaccaggatggtttctaacagtagtaattgttagttttatagt
ccagccagcttaaactattgcagtcttctattctatacgggttagggagaagaaatgaga
tttaatccatagatgttttttactgttaaagttatagtagtcagtttagataggattatg
ctgtacttacttactctcagtccaaaagttctattgataaaactagcttagctacctaaa
aaaagtccaagatttcagctgcttttgaagtgttggtatattaaatacagccttgtaaat
tcttgcagctaactttacgaatgcaacaacagcataaaatattcaattattggtctatgt
gaaagtacaacttaaatattacatgagttacattcatacgatgctatgttatatagtagg
gtggggaaagacaggacacctttagcacataatatccaaatattcggatcgtgctttcaa
cagttaacaacggtctatgagagtagtaaggatatggttttataattctttgaatgtttt
ttttgcttactactaaatgggacgaggaaaacagaataaa