Ciona intestinalis - RPS6


SpeciesCiona intestinalis
Gene NameRPS6
5' Upstream
tagactattgcaatgtagaatgccatgcaacattagtgaagaatcctctgttgatggatt
acacggctgctcagtggttagcatatgaaacagggttgttcaccagtgtcgtgattttaa
actcaaacaaactttctaaaggtgtagcatgtgttggaaaaaacttgtttcgtatcactc
gtacgaccatctacaagttaccatgtatgtgaccgtgtgtgggattgtttttctgcatga
ctgacaatttaaggcgattggttaagtgtcttacccagagataaacaagccttggtccga
ttacctctgtattggcaccaggcgtgccaatcactcccaaaaacatatttttaataaaaa
tacagtcatagcaatgttgggggaacaacaataatgttgcatcacaaacaaagtatttga
ttaaataaacaaaacataaacaactcactgacgatgctggtgaatttgaagcgcttgaat
ctctttgcacagttaccaacgccatgatcttaacacaacatatccatatattgcaacaac
aacgatttcataagcattgcactaagacacctaatattgaaataaagttggaatattaat
atatctattcatatttatatgctggtaaacaacaataaaatgaatataacttaactttta
ctgaatcactaactaatacgggccaaaacattgcaactgttcagttgatatttatgcaga
acgacgcccacccaaacctcacaacaaccataaacacaagtaagtttgcgacgatacgca
aaagtgggcatgcaaaatactccccaatggtttaacagatgatttattttttatattaat
caaaataaaatttacttgtaaatttaaaaataagatattttttgtggtaaaatatacgta
aaattttcctttacagctatttatttttaggtaatagaaaatatcgctggcaacactgtt
gtgacttttggttatggcgtggagatttcagttcttttta
Exon 1
CGCAGTGATGTCTAGCGTTCAGTAGTTTGGGGTGAAATATGAAG
Intron 1
gtaaatctacttttatttgattataaacaacagttttgggaaacctttgcattttttcga
cagacgacgttttacttcaagtacatttaggctttattttaagaatactgacagaataaa
gcagattaattcggataaaactcgactctcgtcgacagtttagaaacacatattgcctgg
atagaccgttacttttatccatttaccagaaggaccgtttacattgataaaagcaagaag
tttaaattagcagaatatttgacagaaaccatattttgcag
Exon 2
TTGAACATATCTTTCCCCGCAACGGGGTGTCAGAAAGTATTCGAAGTCGACGATGAACAA
AAACTTCGCGTCTTCTACGACCGACGTATGTCACAAGAAGTGTCCGCTGATGGCTTGGGA
GACGAGTGGAAG
Intron 2
gttagtggattggacttgataacatgacatgttatttgatatcaaaagttttaatatttt
tttccccag
Exon 3
GGCTACATAGTTCGAATCACTGGAGGTAATGATAAACAAGGCTTCCCGATGAAACAGGGT
GTGCTTACTGCTGGTAGAGTTCGATTGCTACTTGGAAAG
Intron 3
gttggttaatatacaacatgttgagttatatttgccccattgcttgcattattaattata
atacattatacag
Exon 4
GGCCACTCATGTTACCGTCCCCGACGAACTGGCGAACGTAAACGTAAATCTGTCAGAGGT
TGCATCGTTGATGCCGGTCTCAGTGTGCTTAGTTTGGTTATTGTGAAGAGAG
Intron 4
gtgaggggaatatcactttgtgtaaatttggtgaatcggcgcacttgttttgccactgtg
ttcgttatgaaccattattaacacagttttcccagtgttgccagattattaaggcggcta
attaacaggaaacactgttcgttgtttcactgtcagtctccgccttacatttactaattc
aaccactgttttgcgtcctacttcatgattaacacctgattaacctaccag
Exon 5
GTGAGAAGGAGATCCCCGGTCTCACCGACAACACAATCCCAAAACGACTCGGTCCAAAAC
GTGCGAGTAAAATCCGCAAGTTGTTCATGTTGGGACCGGATGATGATGTGAGAAAGTATG
TGGTGCGACGTCCACTACCAGCTAAAGAAG
Intron 5
gtacttgtttgttgggttggtacatggtgcatatgatggataactgtgagctgatgttat
aaatgctgacgtatctcactagatagtatctgatgcaccaacaaccagtttttttgatta
gctgtttatggatttaaattcaataaccttggcgtcgaactgcttattgttgctagttat
gccaatgtataccaaagtgaagtttaattcttaatccccccag
Exon 6
GAAAGCCACCAAAGACGAAAGCTCCCAAGATCCAGCGACTCGTGACGCCACAAAGTGTGC
AGAGAAAGAGACATCGTATTGCGATCAAAAGAAGACGAACTGAACGCGGTCTTCAGGAGG
AAGCTGAGTATAAGAAGCTTCTCGCTAAACGACTCAAA
Intron 6
gtgagtgctgtccaaattatgtgtgataacattcattcattgtaactaggcacacatttg
ccactatgcaagtctttatatacttgtatggttttttcccagtgttgccagattactatt
tgacggttaattaactgaaaactttgccggttgttttcagtcagtccccgtcatacattt
gtagatttcctatttttgtaagcataaagtttaggaagtgttttgtttaactcccattct
cttttag
Exon 7
GAACAAAAAGAGAAGAAGGCAGAAGCTCACAAGAAGCGACGTCTCTCCAGTTTACGTGCG
TCACAATCGCAATCTGTGTCATCACAGTAAAGTCGTTTATTTCGACCAAACAGAAAAATA
ATAAATTAGAAATGAAA
3' Downstream
catcttgacctcattcttgctttttagttatatatgtatatatccaggtaactgcagtcg
ttataacacaggtgtaaactattagtctattcaagccaaccaaggcaccgaacaaatcac
cagataaaaaatcaaatgagtgtcaagtgtcttaatctgaattagtgcagtggggaagat
ggggcacttatgcatataccctgatacatcgtatttttggataatacctatgcatatacc
ctgatacatcgtatttttggataataccacgaattagtattattattccattattaattg
acaacaattcaaaaaaatacaacaaaacacacggggagttatttagcaattcgcacaaca
ggtgaaacaaattaaaatacaggcaggacagtttaaaatcattgttaattttaagagaat
ttattacaaaacattcgtttccttgccgtattgctatatatattatggaaattgctattg
tttgaatgataataagtattgttcgaacatcaattgataaatattgtacctgtaataaca
gaaaatagataataactataaataaagtttacatttttgtcacaaatttggtattcttac
aatacttttcgtacaagatacttctcataatttattattaagtgcgaatgactgaccttc
gaatatattttccatattttatcctgttattgtatcggtatcttatatttgaataacccg
taaggtatataccaaaaagtaaaacatgttgtgattgtattgaataaattaacctttaca
gcaccaatattgaatggtaatacccaacaactctagtattgcacaaaacaaagcggtgat
ttaagattggcatcgtgattcacattttaacaaaaatctgggatgacgtaattaaaatgc
aatcacagcttgaaacataaacaaactttattgaatggtatgattcgagtagggtttggg
cctgattgtttctatagacacttaacagcaggacctgtaa