| Species | Ciona intestinalis |
| Gene Name | RPL3 |
| 5' Upstream | gtttacatttatagtttatacacacttctattaatcattttaaagtttttattaccattt
gtttcatttgcactgtatattattgtgccttaccttattcttaaaccaaagtgtttcaga
tatatacaaagactaaatatttatgcacttttgtacaagttagcactaaatccaaaccat
tccaataacaaagtaatatattttcattttttttatcaattaacaactcgtttaaaactt
ctacctttaacacaaaccgtgccttaacccgttattgaaactcctactttcacacaaatc
gttttaaatattggtgtgttttgtttgtcgaggtgggtgaagaggattttttgaagatgt
aattagctcgcaatatttctaacagaaattcctaaacttttggcaatggaaccatctgac
cctaaaataaaacttgtaatcgttttctgttggttatcaaggccgcactagcaaggaatt
ataaaacccattgtagtaaaaataaccgtcacctatataagtttgcttatatactaactc
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cccctaagatcgtctgaacgtcacgcatgaacattggtcacgtggttcgtagacgtaata
taacgtgcgagattttagaaatctttccttttctcagcgc |
| Exon 1 | TGTTGAAATG |
| Intron 1 | gtaggttggtgtgtttttatcttcaggaatctgcttctatacatgctgcattttgtttaa
atatttgactagacatattcggagcatggtgctttaagttggttaggttaatatggagaa
caagtgcaattactggtgtaattactagcttttgaaaatgttcttacttgcag |
| Exon 2 | TCTCATCGAAAGTTTTCTGCGCCACGTCACGGCTCTTTGGGGTTCTTACCTCGTAAGCGG
TCGTCCCGTCATCGTGGAAAAGTTAAGGCTTTTCCCAGAGATGACCCATCTAAACCATGC
CATTTAACGGCTTTCATCAGCTACAAAGCTGGCATGACCCACGTTGTTCGTGAAGTTGAC
CGACCAGGGTCAA |
| Intron 2 | gtaagtagattatccatattttgtctacactatagtaaaaagcaatgctgttatatcggt
actgtggatatgcctaataactttaagcaatacgtgccgaaaaatatactaaaatatttt
ttcctgaaaaccaactgaatattttcctttggctgtgattatgaaaagttatccctgtct
gatgactattgagtcatgacgataacaaccgcatcgctatgagccaaacactaataaaat
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agtgaattttattaagaatttaaaggaaaaactgtaccgtttaaagcttttttatattat
agtaaagaatttatggtaattaataatcctaaaatgctaattctcctgcag |
| Exon 3 | AGGTTAACAAGAAAGAAGTTGTGGATGCCGTAACCATCTTGGAAGCGCCACCCATGATAG
TGGTTGGTGTGATCGGTTACATCGAAACCCCTCGTGGTCTACGAACTTTGAAAACCTTGT
TTGCCGAACATCTGAGCGACGAATGCAAACGCCGATTCTACAAAAACTG |
| Intron 3 | gtgtgtttttttttagcttaggatttaaaatgtgatgaaaatttagacgggcggtctgat
ataaagtgctgattcgtcttttttctgattttacattagtttaccaaaagttctttaaat
tctatgatattttggaactcgtctggtctgtggttaatcatgtgtataccatgtagtttt
caatcatgatttctaaccaaactttcccattctgctcctctcagtaattcatctgacgag
cttcgaatgcctggatgcgataagtggatgtgccatagacaaccatgtctggtcgcgtaa
ccacttccatcctctcccactagtctcctctcagtgttaactgatgagccggtgtggttt
cccatctcatctgtcttttgtctccctccctaccccccaccccaccatag |
| Exon 4 | GTACGCATGCAAAAAGAAGGCCTTCACCAAATCGTGCCGAAAATGGCAAGACGAAGAAGG
CAAGCGTCAAATCGACCGCGATTTCAACCAGATGAAGAAATACTGCAAAGTGATCCGTGT
TATCGCACACACCCAG |
| Intron 4 | gttggtgtggtaatctaaatgtcgcttctcagctactacagttgatgatttgctggcacc
tcttgtatgagagttcttaagaacccattgaacggattaagcaagcgtctgatgtataac
atacacacagctaaatccactgtaataaacccttcattttctctgaactgaagtatttcc
acag |
| Exon 5 | ATGAAACTTCTCCCAATCACCCAGAAGAAGTCCCACATCATGGAGATCCAAGTGAATGGT
GGAACCATTCCAGAGAAGGTTGACTACGCACGAGACTTGCTGGAGAAACCAGTCCCAGTC
TCAAACATTTTCGCCAAGGATGAAATGATTGATATCATTGGTGTGAACAAGGGGCATGGA
GAGAAAG |
| Intron 5 | gtatattttcattacagacccattattccttcattacaccaaaggtttatgatgaaagca
ttgctttgcccttgccggggcaacctgaataatactgtagataacaacaatgctgccttc
cttctgaaacagttttctgccacccttcatttacaataaagttttagacccctttttaaa
ctcattctttacacag |
| Exon 6 | GTGTTACTTCTCGTTGGCATACAAAGAAACTTCCACGAAAAACCCACAAGGGTTTGAGAA
AGGTTGCTTGTATTGGTGCGTGGCATCCAGCCAGAGTTGCTTATTCTGTTGCAAGATCAG
|
| Intron 6 | gtcagtatatgttacttaaacattatgcaaatgatgattctctggaagtgccgtctgacc
gatagaatgacgtctgattcctaatctgatgcgaaaaaaatactattttcaaataaaatc
aacagaaaaaacataattttcaaatctgcggagtgccaaaattatcaaaaaattaacctc
attttattaccttctag |
| Exon 7 | GTCAAAAGGGTTACCATCACCGAACTGAGGTGAACAAGAAGATCTACAGATTAGGAGCTG
GTATCCATAAAGAGGGTGGCAAGCTCATTAAGAACAATGCTGCTACTGAGACTGATATTA
CAGATAAGAGCATCACCCCTATG |
| Intron 7 | gtaagatttcgtatcttggaattattaatttagttcttaatgggtaaccacttcgtataa
agtttgcaatgaaatcaattaagtttcgcatcctggaattctctactcttggcttggtat
ttggttttacaatgtgaatcttattttttcag |
| Exon 8 | GGAGGTTTCCCCCATTATGGTGAGGTAAAGAACGACTTTGTGATGATCAAAGGTTGTTGT
ATTGGACCTAAAAAGCGAGTGCTTACCCTTCGGAAGTCACTGATCACACACACCAAACGT
GCAGCTCTGGAGAAAATCAATTTGAAATGGATCGACACGTCATCAAAGTTCGGGCATGGT
CGTTTCCAAACACACGAGGAGAAACGTGCCTTCATGGGACCGCTCAAGAAGGATCGTCTC
GCCGCCGCTGCTGCTGCCGCTACCACAACCACAACCACCGCTTAAATTATTTTGCGGTCG
AATGGTTTATCGTGCATTGCTCGACAATAAAATAAATATGAAAACCCGGAG |
| 3' Downstream | ttcgtccagatttatttttttgtagccgtcgcacgaggagacctatacctgtgaaccaga
agcacgtgtatccaaatatcggggtccctctgaaatgcgcgcgaaatatctacacgtgta
tccagaaggggaagcacgtgtatatccaaatattggagcagaagaagcacttttatatct
atatctcgaaaaggcgcttttatatatttaaatgtaaatataatcgtgtctctaaaatgc
gcgcgaaaaactacacgtggacagcgcaaggtttttacggaaattcatagagacggatgc
tgttagaaaattctagcaggttgcctcttctgcattccagttagttaaaagtacccagcg
taaagccacgttcggcctttgaaatattgctcgcaaagtaagcgtccctcgtagtcttta
cgtgtattaaatacagtagacgagaatttgactaaatgaattaacagtcgtgtaaacctt
acataatatttactcatccgcatatttaaataacacgtccaaaagcaatttaaatcgtgt
tacgccagtatgtcaattcccattcaaaagtgattgataactatataggtagggaaatcc
ccaaatgaaaatcccattatgcggtaataattatgtgtatttaatacccaaaattcatca
tttttaattttaaactgatcatggtgtttaaattttattaaaatatggaaaccaatcgcg
ctgtgagcaagcgcaaacagtctctttcttgggcctctcttaacccggagcagaggaaca
tttttacagctaaccaactgagcgtacagaatcaaaaagtaattaaagatcttaacgtgg
taagtaccattattcgtttattttgcaacaaaaagtaagatttctgttttcagattaaaa
aaggaatcgaagatgaaaaacgctgcgaaaatgcggcgcatgctaaagaagaaatcatgt
tacagaatcgctacaaccgtatttcaaaggtttgaattta |
