Ciona intestinalis - RPL3


SpeciesCiona intestinalis
Gene NameRPL3
5' Upstream
gtttacatttatagtttatacacacttctattaatcattttaaagtttttattaccattt
gtttcatttgcactgtatattattgtgccttaccttattcttaaaccaaagtgtttcaga
tatatacaaagactaaatatttatgcacttttgtacaagttagcactaaatccaaaccat
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taacgtgcgagattttagaaatctttccttttctcagcgc
Exon 1
TGTTGAAATG
Intron 1
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atatttgactagacatattcggagcatggtgctttaagttggttaggttaatatggagaa
caagtgcaattactggtgtaattactagcttttgaaaatgttcttacttgcag
Exon 2
TCTCATCGAAAGTTTTCTGCGCCACGTCACGGCTCTTTGGGGTTCTTACCTCGTAAGCGG
TCGTCCCGTCATCGTGGAAAAGTTAAGGCTTTTCCCAGAGATGACCCATCTAAACCATGC
CATTTAACGGCTTTCATCAGCTACAAAGCTGGCATGACCCACGTTGTTCGTGAAGTTGAC
CGACCAGGGTCAA
Intron 2
gtaagtagattatccatattttgtctacactatagtaaaaagcaatgctgttatatcggt
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Exon 3
AGGTTAACAAGAAAGAAGTTGTGGATGCCGTAACCATCTTGGAAGCGCCACCCATGATAG
TGGTTGGTGTGATCGGTTACATCGAAACCCCTCGTGGTCTACGAACTTTGAAAACCTTGT
TTGCCGAACATCTGAGCGACGAATGCAAACGCCGATTCTACAAAAACTG
Intron 3
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Exon 4
GTACGCATGCAAAAAGAAGGCCTTCACCAAATCGTGCCGAAAATGGCAAGACGAAGAAGG
CAAGCGTCAAATCGACCGCGATTTCAACCAGATGAAGAAATACTGCAAAGTGATCCGTGT
TATCGCACACACCCAG
Intron 4
gttggtgtggtaatctaaatgtcgcttctcagctactacagttgatgatttgctggcacc
tcttgtatgagagttcttaagaacccattgaacggattaagcaagcgtctgatgtataac
atacacacagctaaatccactgtaataaacccttcattttctctgaactgaagtatttcc
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Exon 5
ATGAAACTTCTCCCAATCACCCAGAAGAAGTCCCACATCATGGAGATCCAAGTGAATGGT
GGAACCATTCCAGAGAAGGTTGACTACGCACGAGACTTGCTGGAGAAACCAGTCCCAGTC
TCAAACATTTTCGCCAAGGATGAAATGATTGATATCATTGGTGTGAACAAGGGGCATGGA
GAGAAAG
Intron 5
gtatattttcattacagacccattattccttcattacaccaaaggtttatgatgaaagca
ttgctttgcccttgccggggcaacctgaataatactgtagataacaacaatgctgccttc
cttctgaaacagttttctgccacccttcatttacaataaagttttagacccctttttaaa
ctcattctttacacag
Exon 6
GTGTTACTTCTCGTTGGCATACAAAGAAACTTCCACGAAAAACCCACAAGGGTTTGAGAA
AGGTTGCTTGTATTGGTGCGTGGCATCCAGCCAGAGTTGCTTATTCTGTTGCAAGATCAG
Intron 6
gtcagtatatgttacttaaacattatgcaaatgatgattctctggaagtgccgtctgacc
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attttattaccttctag
Exon 7
GTCAAAAGGGTTACCATCACCGAACTGAGGTGAACAAGAAGATCTACAGATTAGGAGCTG
GTATCCATAAAGAGGGTGGCAAGCTCATTAAGAACAATGCTGCTACTGAGACTGATATTA
CAGATAAGAGCATCACCCCTATG
Intron 7
gtaagatttcgtatcttggaattattaatttagttcttaatgggtaaccacttcgtataa
agtttgcaatgaaatcaattaagtttcgcatcctggaattctctactcttggcttggtat
ttggttttacaatgtgaatcttattttttcag
Exon 8
GGAGGTTTCCCCCATTATGGTGAGGTAAAGAACGACTTTGTGATGATCAAAGGTTGTTGT
ATTGGACCTAAAAAGCGAGTGCTTACCCTTCGGAAGTCACTGATCACACACACCAAACGT
GCAGCTCTGGAGAAAATCAATTTGAAATGGATCGACACGTCATCAAAGTTCGGGCATGGT
CGTTTCCAAACACACGAGGAGAAACGTGCCTTCATGGGACCGCTCAAGAAGGATCGTCTC
GCCGCCGCTGCTGCTGCCGCTACCACAACCACAACCACCGCTTAAATTATTTTGCGGTCG
AATGGTTTATCGTGCATTGCTCGACAATAAAATAAATATGAAAACCCGGAG
3' Downstream
ttcgtccagatttatttttttgtagccgtcgcacgaggagacctatacctgtgaaccaga
agcacgtgtatccaaatatcggggtccctctgaaatgcgcgcgaaatatctacacgtgta
tccagaaggggaagcacgtgtatatccaaatattggagcagaagaagcacttttatatct
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tgttagaaaattctagcaggttgcctcttctgcattccagttagttaaaagtacccagcg
taaagccacgttcggcctttgaaatattgctcgcaaagtaagcgtccctcgtagtcttta
cgtgtattaaatacagtagacgagaatttgactaaatgaattaacagtcgtgtaaacctt
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