| Species | Ciona intestinalis |
| Gene Name | RPL4 |
| 5' Upstream | acatcgttgttagtaaatcaaggttttcaaagtgttcgcccttttcttgtttacacacat
ggacagtataagcacctttatcaacctcgtatttgcacgatgaaccagcttccacaatgg
tgccaggaagttctaatctgaaaattacatttttgtaaaagttgttaagacatatgctaa
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gttacatacacgaactattttctcacattttggcatatatccgccacgtggtgtcccttc
tttcttttcttcagcgaccgaactggtttgctgttcataa |
| Exon 1 | TTGTGGGATAAAATG |
| Intron 1 | gtaggttttttgtttattttatatatattttaactaacaacaagttgtataacgctaata
ttatatccgtgtagttataaactttagcgatgtttggttattacaaacaaaaactgtagt
attgagaagcatgtgtttcattttaacatttcactcttgtatctaaaacataccttgagt
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gtccaacatgcatatatttgttctgtgtattataattagaaagcaaaaaactaaatgtag
ctaatttagaaaatatttaattagtaacaaagtttatatattcattatgtttcag |
| Exon 2 | GCTTGTGCACGGCCATTAGTGTCCGTGTATTCGGAAAAGGGTGTTGCTTCGGGGTCCATT
ACATTGCCAGCAGTTTTCAAGGCTCCGATCCGTCCAGACATTGTTAACTTTGTTCATACA
AATATCAGCAAGAACCACAGGCAGGCATATGCTGTGAAATCTATTGCTGGTGAACAAACA
AGTGCAGAGTCATGGGGTACTGGACGAGCTGTTGCTAGAATTCCAAGAGTGAG |
| Intron 2 | gtatgtatggaacttataacatgttgagtttaacttggactattggttcatgttaaatct
gggtttccatgcatttcgttgaggctatgcaatttgtattgctaacaaagtttatccaat
atttccgccttctgtgtcatcctaagtagtttccatatcacttcaaaaggggtaacacta
aaagagggaaaagggaaaacagggaaaagagggaaatcaaccctaaaagagggaaatagg
gaaaagagggaaaaagggaaaacttgcattcctaaaagaggggaaaaggaaaacagggaa
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ttttcatcttatcccttgcatgttagtattgattttctgctgttcccttttttataatta
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ttccctgttttccctcttttccttttcccctcttttaggaatgcaagttttccctttttc
cctcttttccttctttccctcttttagtgtcgatttccctcttttcccttttccctcttt
tagtgttaccccttcaaaagtaaaatctggcatgtatgagctaatgtaaaaagtttgggc
aattaggtttaacagtgaagttctttgtcattttaggtgatagtagatctacttaaggca
aatgtttcaataagtctaaagttggttttggaatttccatttattattatttttcatcat
acag |
| Exon 3 | GGGTGGTGGTACACACAGATCAGGACAGGCTGCGTTTGGTAACATGTGTCGTGGTGGTCG
CATGTATGCACCAACCAAAACATGGAGACGTTGGCACAGAAGGTGTAACATCAACCAACG
TCGGTTTGCCGTCTGTTCTGCTCTTGCTGCATCTTCTTTGCCTGCTTTGGTCATGTCTAA
AG |
| Intron 3 | gtagatttatattacatagtaaatattgcatgtaaatatttaagcattttatggagatga
tgagctgtacttcaggtccgtgtttttgataccacttgatatcaattgaagttctgatca
attttgttatactgtaatacacgattagtaggactgtagaatcagtaagtgagttttaat
tctccaaataaccacag |
| Exon 4 | GTCACAAGATCGACCAAACACCAGAAATTCCTCTAGTTGTGGAAGACAAAGTCCAACAGT
TCAAGAAGACAAAGGATGCAGTTGTGCTTTTAAAGAAACTGAAGGCTTGGGATGACATCA
AAAAG |
| Intron 4 | gtctggtttgttttgtgttggcggtatatttgtctctgttatatgatcattggtggtgta
tatacgataatatccgataaatggtgcttgtaccaaatgtggtaattataaaggtgttta
cattaaaagtaaattaccaatctagtacatggaactaaataaagcaaacccacattgtac
cttggacatgcagtttcagggtactctcttaaggtaaaaaatagaaatggtagggaaata
tatatgtaaaaagtttggtaccaactattaacagttccaatttgcggaaaagatggaagt
attcaatataagggtgtcatgttcggttgttttacatcagcgttcttacag |
| Exon 5 | GTGATGAAATCACGAAAGATCCGTGCTGGTAAAGGTAAGATGAGGAATCGTCGTCACACA
ATGAAGCGTGGTCCTTGTATCATCTATGATAAGGATGAAGGAATCTCAAAAGCTTTCAGG
AACATCCCAG |
| Intron 5 | gtagttattcaatttttaatgtttctatacctcattgattaaaccctgttttctgctctg
ttcatgcttacaatgttcagatttcatacacaggggatattattatttgtgattcagtta
tgatacaaaacacatccagttctgtattaattctgttgcacaaaacatgtgactgttctt
aattctcctagattttggtaaaagtagcatttgaaacggtactcataaaatagaatatta
agctttatcactatgctgcatatttttcag |
| Exon 6 | GAATCACACTGATCAGTGTTGATCGACTGAATTTGTTGAAGATTGCTCCTGGTGGCCACG
TTGGACGATTCTTGATCTGGACGCAGAGTGCTCTCAA |
| Intron 6 | gtaaataactataaaaataaagattttatgttctattaaatatgatgaacttatactgaa
aatctgaatctgaaatgaagtgaaataaagttctgatagctgtattagcaaacatgcttt
taaatttaaaactagatcattctcatgtattgtgttttctcctttag |
| Exon 7 | GCGTTTGGATGGTATCTATGGGACTTGGAGAAAGCCTGCTGTCGAAAAGTCTGCATACAA
TCTCCCAATGCCAAAGATGACCTGCACTGACCTGAGCAAGATTCTTCAATCTACTGAAGT
CAAATCTGCCCTGCGTGCGCCCAA |
| Intron 7 | gtatgttgtccaatttagttattttgctctattacttgatgtgtgatgatgaggtaaact
tcaggtccgtgtttttgaacaaccatgataacaactgaagttctgaaacttaaaataaat
aggagttgaaatttttaccacacagtaccacgtacattaattttatttaacgttaacag |
| Exon 8 | GAAGGGAATTGCAAGGCGCTCTCAGAAGAAGAATCCTCTGAAGAACATTCGCGCAATGTT
GAAGCTCAACCCTGCAGCTGCTTCTGCCAAGAGGTCCGCTATATTGCTGCAAGAGCGACG
CGTTCGGGAAAAGGCAGAGCTCAAAGCTAAAAAGGCTAAAGCATAA |
| 3' Downstream | aatttgtactgacttattgaataaaagtacagacacaaaccgagggcatgtttaagcttt
ataaactatcaaagtaaaggaattttgaggtaatagttgtcccattgtagttcagtaaaa
aggcaagtgagaaagaaacgccattatgtactgagtgtaatagcgtttgtggtttaaaac
acgtggtgtgtttggtgtaaaaggtgaatataaaaccattgatttgaaaaggcaaatctt
aattttctattagcggattaccattcacatctgtaattttatcgagtcgcggtctggaac
cacattgtttgaagtaaagaacataagcaaaagaattggtccccgttaatgtaaaaaata
tggaaacactactgacgtcatcaattttaacgcttgagtgattgcgttgcgtggaatgtg
attctgaagtttgtcgtttgcaattttggagtaaagtttttttgtcaaaaattacagctt
gtaagacttaataaactgcaaggtgagtttattgcgatttaaactgtattcggttcatta
aaatactaatattttatatggttatactgtcggtaagtttacgtggttgcatttttatca
ttacactttcaaggtatgagaacattaaaaaagagttggaacgccaaagaatcctccaaa
tccaaggctgagcgaaggaaaagtaacaaagaagcatataacaacttctacaaaatagtt
gtaccgtttttggccatccttatttctttcattgtgctgtttgtatacgttagtactcag
ccagtgaaaaactgatacaatgattttgtgaatttagtttttaattcacttcttaccatc
atgtagagttgtgtcatggggactactgccatttggaagtttgcaaatgttaaaacattg
taaactttctaaattaccattggatatcaatcaatcatgctgtttttaaatccttgtggc
gctaaaatgtaattcatacttaaaagttgttttaacagcc |
