Species | Ciona intestinalis |
Gene Name | RPL30 |
5' Upstream | ataagcgctgaacaagggaaagagatgggaataaataattgaagagcataagcaacgaaa
cgaacccgtgtatcgatcgtagcttacctacatgattatacggtctactgctttatgtac
ccactgaacctcaggagactatgactgtgcatttggcctattttatgaaacaaaatatca
attgagtaaagaaacatttcgccttttgaaagccaaaatatctacttgttttataaacga
cgcatctgtatataattaataataatttttaagcattggttaatttatttatataccttt
taatgtttatttataaaatgaacctatctgaagagattccacaaactaccgttaaaccga
tttcgtcacaccagctcggcgtcttacctcacgaaagtatgcggtaaaggaaaacgaatc
gcgctgtagaaaaacaccaacatagaaacaacattttataaaaaaaatggttagcaatct
aatacttgctttgaacattaataataaaaagttcacaagacttttaacccaaagagattt
aaacctttagcccgaatagattggttttattttttgcctgtctgggaaatttaaaaaagg
cagtatagtattttaaattcagatttgcgccaagctgctttaaacttaaattaagtaatt
aggaggcccgagttggcgtatattataaacattactgaaatatttttacgcgttgaccag
tacattattatttagagaccatatatttgaaacggggacgaataaatatacaacgtgttg
atgatgcaattttgtcgccaccaaagaaatggcgaactctgacctctcctttttgagtgc
ggcgtgtgagaagtcagcaaggtatgtttctggataaacctaaacttagtttatgttaat
tctgcatggaattttctattaaaatgacgtttttatgatgtggtgtacttaacttaaagg
tttcgttgctctacatcactaccaacaacacacgagcaag |
Exon 1 | ATGGTCAAGAAACAG |
Intron 1 | gttagtttctgtttgaattaattaaaattaaagccatattgttgtttaaatgaccgtatt
tgttaatatattgtttctttataaaattactgcctagctgatgttaaaatttcaagtaaa
cagaaattagacgaaggatccactgctatgaaaacgtaacagaacaaaagcccaaccaat
tgttatataagagatatatattttgcctaacttgcatcattagtcttttcttcaaataga
atatcttgtgtgacatttagttggactatatttttgacttttatacatttttgtagcaat
gactccttgctatatttcttaacacaagaatcattcaactattatgagcaccagattaga
gtccgattagcagaatttatttcggttataataagtgtcataatattacattgaaggaaa
ataaaacataatggaatgagtgtcataatatttcatgctttatag |
Exon 2 | AAAAAGGCTTTGGAAAATATCAACTCCCGTCTTCGTCTTGTTATGAAGAGTGGTAAATAC
AACCTTGGATATCGACAAACACTTCGTATGTTGAGACAAGGCAAAGCAAAACTTGTCATC
CTTGCCTCAAACTGTCCATCTTTGAG |
Intron 2 | gttggtgtttatttgatattatttaaattcctttggaataaggccggattgtaatcaatg
tttcaagtcggtaaaagtagaaggtaaattaattcatgtttattcatttgtgcttactgt
acttcatcagttggtgcaccgaatgacatgaaacattggctagtttgtagtctgtacaat
atggtagcttcaatataatacaagttagcggtttcctaactggggttcgttgactaaggg
tctttacactagttttaagaggctccacaatgtacagcaatgattgtaaataaataaaaa
gctttctgctttttcttttgttggtgtgctttttgcattttttctatagcagtttttgat
ttttaaagggccgcgcaatatcagaataatcgcgaaaggtccaccagacaacatttataa
gattaaagtaaaatatttattccacaccggaaaaaaatctttctgcgagcacaaactgaa
ttaaatataaagattgttgcttgaatgaaaaggcgtgttttgtgcatgttttttaggtgc
tcggacgagatattttggtctgtgtgatgtctgctatattgtttgctactaacttactgt
gtagaataagaatagtttatatttagaactggtactactatagttgtattatcgaatgac
catctcagtaagtggatgtttatgttttagatataacagcggtttctactcagtaaatat
gtattggataaattgtttagaaatattggcttgagagaggttattgcaataggttatgaa
aggtcaaagatgatgatttatttttaaattttgtaatcgcttaaatttctgcagttcatg
taattaggtaatattgcgagcctaaatatggcggtatcttgtcgattctattctgaaaag
tttccagaagttgaagatgtggtgatggtgaatgtgcaatctattgctgagatgggagct
tatgttcgcttacttgagtacaacaatatagaaggaatgatcctgttgagtgaattgtca
agaagaagaattcggtcgattaataaattgattcgtgttggaagagatgaatgtgtggtc
gtgattagagtcgatacagagaaaggatatatcgatctttccaagcgtcgtgtttcgcca
gaagaggcaaagaaatgcgagaacaaatactccaaagcaaaatgtgtgcacagcatctta
cgccacactgttgaacttctacataaggcaggggtggaggtagattttgaagatctattt
gagcgcaccgcttggagctttgataaaacctataagcgtcctaatgagaaatacccggct
tcttatgatagtttcaaacgagctgttgatgaacctcagattctagatgagctggacatc
acagacactgagaaagatgttctgctgaagaatatcaaacgaagactcactccacaagcg
atgaagattcgatcggatgtggaagtttcatgttacgcatatgaaggcgtggatgcggtc
aagcgagctttgaagaaaggtctagaatgtgcaagcgaagagcataatatcaagataaac
ctcatcgcccctccactctatgttctcacaactcaatctctggacaggaatcttggcttg
gaagttctgcagaaagcactggatgcgattgaggagacgataaaagatgcggatgggact
ttcaatgttaaattggctccgaaaattgtgacggacattgatgagattgagttgcagaaa
gaacttgaacgactcgcggttgaaaacgaggaagttgacggtgatgatgaaccagatgaa
tatgaagaataaacatctaatataacatgcaatacgttcatcaacttttatttaaattct
ggtgtatgaaatttaattatgttattatgccttaggttaatggttataattaacaatgat
ttgttttaagatcaggttcagaaaggatcacattaaaatttttacagtacatttgtacat
aaaaccgctgattttgaagataaaaaagttctaacaaagattaactacttgtgttacttt
cagtcatacagctttgctttgttcttgtacagagaaaaatatatgttttcttttatag |
Exon 3 | GAAATCTGAGATTGAGTACTACGCCATGCTGGCAAAAACTGGTGTCCACCATTACACTGG
AAACAACATTGAGCTTGGCACAGCTTGTGGTAAATACTTCAGAGTGTGTACGCTGTCTAT
AACAGACCCAG |
Intron 3 | gtgaggcttacaaacactttttgttctgcttttaaaatgttaacattaaaagaattgttc
ttttacctgtatagctattagagttgtggcttagtgatgctatcattttaactgaaggat
aacgggtttgatgctcgatacagatacccgtaatgacacaggtgtctccaataatgttaa
atatgtgataagtgggtacactgtgtacaaaaccagacccgtatgttataagttctaaca
acagttgttggatcttggtacgttggctgaaataagtaacataatttggaaggcataaca
tttggaagacatttgtaaagtgtatttcctaatgttgatattgtgtatagcttgcttcat
gcataataattgctgtgttaatccatcacaggcagttgtttttatatgaagctaaaatat
aacaccaagttataactactgagataaatatttgttttatttgcagctttaagacttggg
gacaatttgtccagacttttacacaattactctatattttcagcatatagtaggttgagg
gaaagtgggacacctttttattctattttctcgttccatttggtagtgaacaaagaacat
tcaaagaattataaaccgtattctcacgactcccatagaccgttgttggttgtttgaaac
acgattagtatattgatatattaagtggtaaaaatgtcccgtcttccccaatcctactgt
aatatgtaaataataaactaatcataatttgttatacag |
Exon 4 | GTGACAGTGACATCATTAGAAGCATGCCAGCTCCTTCTGCCGGTGCAGGAACTGGTGGCG
ATTAA |
3' Downstream | aataaaaatgttgcttctacgtttgttgttgttggtacttactactaaatagttaatcca
gaaactctttgatcagtttaaaactatgtgttttgtttggccagtggcgcaatggccaaa
tgctcgttttaaacgcgtccgctattgtgggcgtggggcattactgtctttttaccccaa
tctagtgatgtttaagggtttcccaggctgccacccataaaaaataataggtaagtacca
atgggtaattactccaaaatcaaaattacggggacatctaaaaacagtattcagctattc
tgatagtgttaacgttagaggtacgtaacagtaatgtaggtcgccatggcttcagcgatc
gcttgtagtccaaactctaaaggttgtggtttttgtagggcctaacgcgctgcctgactt
ttctaacgtatgtgggtcccaagattgtaatccaaagtctgtcatttttaacatatttat
ttaatacataggctatatgcaccctgatagttcaataaattagcagttgtaagctatgca
aaatatggtagggtgctggaaagagatgtgacgcatttcgcacataatatgaaaacaatt
aaccacggtttatttgagttgtgaggatacggttttataatattttaaatgttctttgtt
tactaccaaattgaaagaaaataaaatgaaaaggtgtcccatcttcccccatcctaccat
atcacgagtttctaaagaaagtttttgaactcgatcgtaacaagttactgtacgatagga
atattttatttcttgaaccttagggaccaacttaagtagagcgtgacattataagatcga
gtgtctattggttgcattaaccacatgctggagtgtaaaattggaatcaacttaacaacc
tacacagcttgtgcttgttttaaagtcatttacaaaacgtttccaggagttagtcagata
ttggaggtttgcaaatccagtaggctacatatgttataca |