Species | Danio rerio |
Gene Name | Rps4x |
5' Upstream | cacacccactatacatatacacttgtaatcatgcttatttatctgcatactactgactat
taatagcaacctgcacatatattcatatattgtaacatatacacttgtaatcatgtttat
ctatctgcacactactgattattaatagcaacctgcacatatattcatatattgtaaatc
tgttcatagcttatccaacctgtatataatgttcatagtacatccatctgtaaatatcac
catagttttctataactgcacttcataacttattcctgtatcctgcacttgctgctattg
cactgctggttagacctaaactgcatttcgttgcattgtacttgtacatgtgtaatgaca
ataaagttgaatctaatctaatctaatctaaatggcttgtattttataccatagtttttt
tataatggcactttataacaatatcctgctcttgctgctaatctaatctaatgcaatcta
atctaatctaatctaatctaaagggaagatgcagatttactcactgattgcaaacattca
tgattttcgtaaatttcttctgttgtaaataaaagaagttattttgaagaacgcgtgaaa
agctgtaattattgacttccatagaatgaaaaacaaatactatgaacattgatgttacag
gtttccaacatttttcaaaatatcttctttcatatccaacaacaaaataaagaaacccat
ataggtttgacacaaggaacgggccagtaggcctaaatgatgacagaattgtcgttttgc
gtgaaccatccatttaaatgtagttccagactgaaatgtctccactgaaagaaacttgca
gtgaccgaaccgctgctgtttttgcagtgtgactacagccctcgccacctgatggcacgc
gctcgtacggcttatagagaaaactccgactgtccttcttcggctccggtagttcagctt
atcttccgctgacaggaagtggctggtccttttccgcaga |
Exon 1 | CTCCAACATG |
Intron 1 | gtgagtgcatttcattcacgataccctccctaaataatccacaatcatcaacgttttaaa
agatcagctttctccaattagctcaaaatgttgcacattcaccccatctaagttgaacaa
cacacacattttgatgaaaaagagaagatgtgatgattaaaatgttaaaggaaaacgctt
agctccgccgctgtctgacactagcggcaaagcagactcgcgcttctcgatcatgtgaaa
tgtcgttttaagtatggttcggcggtcttatatgtaatttgttcaatagagagttggatt
tatacaataagtgcttatttaaaaatggcataacttcagtagtttttaagtcgctaggag
aagctaacgctaaaggcctcgccgtactatctttgaggtctgctgggatttatatgttaa
taaatgtatacagactgcacatgttgttactttgagctgacagatgtttatgttgttcag
|
Exon 2 | GCCCGAGGACCGAAGAAGCACCTGAAGCGTGTCGCAGCTCCTAAACATTGGATGCTGGAC
AAACTCACCGGAGTGTTC |
Intron 2 | gtaagtaacgttaaagggttccccccccataacgttaggtgtgcttagttatgcttaacg
ttacgtgtaaaaaaagtgaacagcacttcactgaaggcatcactgtttaagtaaacattc
actcatttgggatttaaatgtgttttagtgttatgtatgaagccatgctgggcttatgac
aagttcaagtatccacatgacatgtaataaccttattgttcagtgttattatattgcctg
gtggttaggaaagtaaaacctctactttttacctaatttcgatgtatctgatgaaagtgg
gttgattattagttttttaaatgtttgtttctgtag |
Exon 3 | GCTCCTCGTCCCTCCACTGGTCCCCACAAACTGAGGGAGTGCCTGCCCCTCATCATCTTC
CTAAGGAACCGTCTCAAGTACGCTCTGACTGGAGATGAGGTCAAGAAGATCTGCATGCAG
AGGTTCATCAAGATCGATGGCAAGGTCCGCACTGACATCACCTACCCCACCGGCTTCATG
G |
Intron 3 | gtgagttctgctgcactcaactgtcagtttatgattcggtatccccagtgaattgagtga
cttgctgtgtagatgatgtttcataagaggaatgattatatcaggtcaggtgtatcaata
tgaatattcaaataaagctggacttaaatgtagtgtcttagagtatatttaattttctgt
gcaagtataaaatgttttacaaacatttacaaacagtattttgcagttttctgtccagaa
tgtttggaaaataattttaagctaagtgctgcccaactctaacagcacatgcagcgggaa
aatttactgtaaattatgattcgttttaaagcaagggacatgtgcatttagtttcacatg
cagtgttggtgcttctttaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaagctctaacaatttaccaccac
tgtgcagcatacacatggaggacatgatggcagcctttatgcgccaaaccacacaccagc
tgattggtgaagaggagacagagtgatgaggtcaattatgatatcgggatggttatgagg
ccatgatggaaaggccagtggataaatttggccaggatgctggggttaaacccctactct
ttttcgaagaacatctgaggatttttaacaacctcaaagtcaggacctcagtttaacgtc
tcatccaaaagacggcactcgctgagcagtatagagtccccatcaatatactggggtgtt
aggacccacacagaccacaggttgagcgccctctgttgatctcactaaccacttttggca
acaacctagctttctcgtggtctcccattctggcactgacagggcacagccctgcttggc
ttcaatgtgcgaccatgtgagggttgcagagagatagcggctgatattgtgtaaaaccta
tattacagctaaaaatcttatctaatttatgtatttgtttgtgcaaatcgccaatttgta
atcatcagtgaagcacagattaaaatttgctcaaaagctcgtagcaaacttaaactggtc
tgtatgtcctctcatcccttatcaggatgacacccagttttggttcgtttatttggagaa
aagcttgagttaaggaaaatacagaaggtgatggttcatttcttgttcatattaatagta
gttgtattttcaaatctagctttcatatttgcctatccaggtgcaggaatgttttagtag
cctccactgtcaggaaaaagcacttctgctttgtgatatttaacagcaaaagtgaagcag
ttgtctccatctgttgtctttgtaaaaaaaaaaaaaaaccttaatccaccatatgtgcct
gtgaattctttaataaatgattaaaaatgagcctgtgattgagaacaaaagcttttacgt
catgtttatttaaatactcctatcaaaataaactagttacttgtaatgcactaccctcaa
cactagagttgcagaattacttttttcaaggaacatttttagaaaagcatcaccagttac
ttcacatttattgactgacagcttttctctttttttgagtttgttttttgagtgaatgca
aatgtttttgatccataaacagttctggattaaatgtgaacatttagtactcgcttgcac
aaatagtttagtaccctgaaaatgaatttaaaaaaattgaatgcagaatgttgacttcat
gcatcctccatgcgatttcatgaaggtcggtttagtttcaagcacaaataacaaaatcta
gcactgcttttctaaagtaataacttgtcctttactgaaaatagtcatttactcaccttt
tgctaatttcgaacctgtttggtactttgaaagctgaaaatctgtaactattgtctgcca
aatactattatataagtcaatggttactgtttttttatcaaatgttgtttaacaatgaga
gtcttataaaggtttggaaccactggagcgcaagtaaatggataatccaaaaattaatat
ttttatagtaacaaaatatcacattactgaagttactgagtcactgaaggcaagtttttt
tttttttaagtattacttttaaaaattacttaaacaatgatggagttgagattgtttttg
atttctgctggaaacattcagttggcttgcctgaatgtctgctgacacaagatagcttgt
catttgttgccatcttttaagtgttttttgctgttatgatggtacacaaaccacaacagg
tcaaaaggtcgtcataaattgtaggttcttaaacatgttttcccagtttacaccatctgc
acttagactggatttagttttggcttgttgcatagtaacgtacagaaaataagattacaa
ggtgataagaacactacaattttgctgaactacttattgagacgggcaacagcagcaagc
aatgatttgtttgcaatcctcagttaaatgaagcacagtctttttacatttaacctaaat
gctattcttaggagatttctagtttgactgagccatgcaatttattttattaccagaaat
atcagtcaaatggtttgagtttactgggttcagtataataaaacaacagtgcttctggta
tctgcactggcactcaattgagcttgtgagctgtagcttaccagatggttgaatggcaaa
cgtcacagagtgactaatccctcagtgttataacacactttcacatagcgtttccactgt
gcacccatacttacttggtgccaacaggatattaatctgctgtgactgattttcgagctc
tggtgatgaggcaggctgttcataaagatgcagtttgaaaacaaacatgagctgaggtga
caatatgatgcttatgtgttaatcaaatgcattgtgttttctttttttag |
Exon 4 | ATGTGGTCAGCATCGAGAAAACTGGAGAGAACTTCAGGCTGATCTATGATGTCAAGGGAC
GCTTTACAGTTCACCGCATCACCAATGAGGAGGCCAAG |
Intron 4 | gtgagcttaatgatcttctgtgatccaggttcccatgggtcatggtgttttctggaatgt
ccttaagtttaaaaaagtttaatccagacatttaaaagtcaggattttaatttgtccaag
ttacggaatttgtttgtcattttcatttcacgtcctatttatcatcttgccataaaatag
ccgagtgttgcaaatgtaatgcgataaactcaaacttgccatttatcaaaatgtattatt
tctaaatcttgtttttaacgttgtttcacatgttttgcttagttatggttgggccatttt
tattgctattttattcatttccttcatcaaccacctgttaaaatactttgaagctttttt
ttgtcagcacagtgctcaaccagtcaaatttttgtgttccactttttgtttttctgatgt
ttcagattattgccatctgaaaatatacagttatgtcttaatgttatataaagggagcac
tgagtgtttttaccttttactaaagcgctaatctctttaacaataatatcagagaaaaca
tggtaatttcacattttagcaatcgattcaaagagcagccttgttcaggtagaatttgac
tgaatgcacgctgcaatgtcacgttatgcatgtaaaggcggtcacacacttaagaagcac
tgtcccatgtgacaactcaaggtatcaatagattgctggtagtacagaaataatgagctg
tgtcctggctggcctcaattcacaggacaatctgcagaaataaaaaaggaagctgctttg
agccatttgcttaacttttgcatttaatccaacattcacagaatcacagttctggagcgc
tgttcaacgcagcagatgagttatcattataggtcatgagaattaagctttttagtcagg
gaatgtgacttagagcaggacccttgtgtagtgtattgaagtcagactagattaaatcac
ttcttgaacctgcagatcttttgacttgactgtgtcaatttcctgttttag |
Exon 5 | TACAAGTTGTGCAAAGTGAGGAAAATCCTCATCGGCACAAAGGGAATCCCACACCTGGTG
ACCCACGATGCCCGCACCATCCGTTACCCTGATCCTCTGATCAAGGTCAACGACACCATC
CGCATTGACCTGGACACAGGCAAAATTACAGACTTCATCAAGTTTGAGACAG |
Intron 5 | gttggtcagctcatggttttaaaattgagtggaaactgttgttcctgtatttgagttgca
catcactttttctgtttgtgaatag |
Exon 6 | GCAACATGTGCATGGTGACCGGAGGTGCTAACTTGGGGCGTATTGGTGTGATCACCAACA
GAGAGAAGCACCCTGGCTCTTTCGACGTTGTGCACGTTAAAGACAGCATTGGCAACAGCT
TTGCCACCAGGCTCTCCAACATTTTTGTCATTGGCAAG |
Intron 6 | gtgagaacagcgttgtatgccgtttataaaaatgccctcatgacaaacttgaatgtttgg
ttcaagtcttccataattgactatgtttgcacccttattcatatgtcaagagatgttgtt
taagcagtttgcttatttgcgtacttcgaaagtacaagttttatggtactaatacattgt
ctctgtcatcag |
Exon 7 | GGCAACAAGCCATGGGTGTCCCTGCCCCGTGGAAAGGGTGTCCGCCTGACCATTGCTGAG
GAGAGAGACAAGAGACTGGCTGCCAAACAGAGCAGCAGCTAAGTCAACAGGACTAGCACA
CCTTGGTTTCAAA |
3' Downstream | taaaacaaaactatttacaaaattctctgaatagtgtcttttgttcaaagaagtctagct
ctaacaatgagggtctcaactctttaatttgacccagaagtatttattttttcattaaca
gtgttatttgcatatcattgggagatttttgaaatgccattcttgtatatttagggttta
tatatatctctctactagtgatttaggtttgtttatgtggcttagcacatggcccttaat
gcacactaaatccacataacgccactttaatccatattacttcagatctgtgattgaggc
caagggaataggctgatttatgatttttattttatttttctttgctttactatattgaga
tgatgtaccagtgttgatgaatatattcttgttgaatacaagcatgccaggaattgaatt
ctgccaacattttgcatggtctttttggtcaaaactagagtcagacagaattgcagaaca
tttttagcaattttggggaaaattttgtaaaaataattgtaggttttgcaaaattttagg
attataatttatggcacaaataaagcgtttttaacttatttagtgtttacaatgcaaatg
caattagatccacttgtgtggtaaacagcaagtctcatctaccaaaagagagaaaatatt
acttttacaaactattgtaaatcatacgagcatttaatactacaatcaatatatcaataa
tgttggtgaaattcattttaaaaactgaataaacataaatttacacataaatgcataaac
tcaatgatgggctaaaaactgcagatttgggcctagttgtaacttgcacattttttgctg
accggacttttacaccttttattggtgcagtgatgattgtgaagtattgctgctcttgaa
tcttaatttgaaagcttacaattgctgaattttgtctgattcatacagtttatattgagg
ttcaggacaggtcttgagtatcaaactaaattagtaattaaataatgaagttcttggtgc
tgctatgtcttcattatcatttgaagattccggccaaatacagcactaaaagataagggt
tgtgcaagagcaattagtgtgggtattggtccttatgctggcagtattttagcattaatt
aaacttgcttcaattaagaaaaaaaattatgtccaaactttttaaaatacttcaatagta
tgaaagtaaatattaccaaaccataccctttgatttatttgagagctcagtaggagaaag
ttgtcttattttgggttaaacgtctctaagctgtgttaattagtttaagttagctgttgt
ttgtacttctactggcatctagcggtgtaaggtagtatagcagtagtatagttggtgtga
tcatgtgacctctaggttccataagacacctgctaatttaaaatagtctgcagtgtatta
gggtataaatctcacatctttagttatgtttattatttatatatatggctgttactacag
agttcagctccagttcagcttcaacacagctgtctgtaatattgatgtttagatcttcag
taggaccaggtgtgttgatgaggcttgagctgacctttgatatcccacaatcctgagagc
ttcattctcgactgttgagctaaaatgggtcaccaatctccgttctgaagggccggtgtc
cctgcagagtttagccccagcttgtctaaacttaacacgtctgactggacgtttaaagta
tacctagtaagagcttgattagcttgttcagatgtgtttgattaaggttggagctaatct
cttcaggacaccggccctcaagaaacaagtttggtgacccccgagttcaaataataatgg
catctgaaagcttggtggacattctttgcactttaaaacagccccaagatttcagtggat
ttaatgtgactttatttaaagggatagttcacccaaaaaataaaaattc |