Danio rerio - Rpl6


SpeciesDanio rerio
Gene NameRpl6
5' Upstream
gtgccggatgaatgccagcggtgccaaaattgggccagaattctttgctacttgggttat
ttcttgcacatgactacacagaacaaaattgtaggcatccaaagacttgtagacctttaa
cttctctcttgttatatcacttgggaggggagtttcaatgaggtgtatatttcaggctgg
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gcggcagccattactcaacatgcgcggcaataaaagcgtgtgtttctttaagagcaaaac
atgccggaagaagaaccccgagcgtaacacgtcacgact
Exon 1
ATATATACGTCAAATGCCCGGATGTCGGTCTTTTTTTCTAGTTGAAG
Intron 1
gtaattgtggcttccatgtctgttttctccacacacaatctgcattaatctcactcatca
tcgcgttgtatgtcaatctatatcgtatttaaatgctttaaaatattcatagcgctaata
tctgtgaatattagtggacgtgttgcgtgttttagcgttcattatgagtgttcgccgcgg
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gagctgtccctttaatataatgcttctcaatgcactaagcattgtctatttttctacatg
tgcacattttaatgactatttattgtgcctag
Exon 2
ATGGCTGAGGGCGATAAGAAGAAGGTTGCCCGTAAGCATGGCAGCCGTAACCCTGAGCTG
GTCAGGGGCATCGGCCGCTATTCCCGCTCCGCCATGTTCGCTCGCCGGGCCATGTACAAG
AGGAAGACTAAAGCTCCAGTGACGAAG
Intron 2
gtgcgtttttattttcatgatcagcatattgaagtgtcactccaaatcagtgtttttttt
tttttttaagatctcttttgatgtttcag
Exon 3
GTGGAAAAGAAAATCAAGGAGAAGAAGGTGAAGCAGAAGTCAAAGAATCCCACCACGGCC
ATCAAGACTGTCGGCGGAGACAAAAATGGAGGCACTCGTGTTGTCAAACTGCGCAAAATG
Intron 3
gtgagcaaaagatgtcatgagcagatcctgaagtgttctgaatgttttaagtcatgcagt
cattttaaaactgaacctttgtgtttgttcacgctttgtacattaagttgacttaaatat
ttcttttaaaatactaaggtgcaattttaacttgtccagttagtgttttatctccttcgc
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cacctactactcagtaggtgctgcatttgaaataaacgtactactcagccgttagaaaag
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ttatatgatgtgatgcattcccccacagtccaaagacataaggtacaagtaaattgggtt
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ttattaattggttcaggtgtgtttgatatgggtagcaactgaaatctgcagaaaggtggc
tctccaggaacagggttagccacccctggtccatagtgtatgagtgtgtatggatgtttc
tcaaagatgggttgcaactggaagggcatccgctgcattaaacgtgctaaataagttttt
ggttcattccgctgtggcgaccccggattaatgaagggattaagccgaaaagagaatgaa
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ttattattttcatataatataatcaatgtcttgaatttagagaagactcagttcagggtt
tactcttgttcattactctagctcatttacatattcagtctcataaatagtgtgttatta
ttattgatttaaaatcttaaatcaaagttgcatgcatgtttagtggcctgattcagtcat
ctgtctttaactgttttacattaccgctgatcttcatatcttgttgtttttttccatcca
g
Exon 4
CCCCGTTATTATCCCACAGAAGATGTGCGTCGTAAGCTGCGGAGTCATGGTATCAAGGCC
TTCTCTCAGCACCGCAGGAAACTGCGCAAAACCATCACCCCTGGAACTGTGCTGATCATG
CTGACCGGACGCCACCGTGGAAAG
Intron 4
gtacacaaatacacccttcatcaataattactgcattcttctgaagaaatggtgaagagt
gatgcaccacaaacacattaccaccagcctcccttaacaaaacattagaatgcaaagttc
taaagactactcaagattttttgaatagtttatacggatgttttttttttaatgcatccc
catatatcaaactgaataaaatgttcttattgaattaggaagtgatttacatttaggccc
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tttttttcaggaaatcactgaaggcatatattatgttatcataatgatctaatgtggcaa
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gtttagaattagttgttggggttagaaaaggggaatgtttcttttataacatagagaagt
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ttttacagggtttctgtaggtttttcactgtcaaatttaacaccaggcagaatgaaattt
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ttacccgattataaaatgtattctaattagttatttcttggccatatattttaaataatg
tcaaaacaagcagaccctagtacaggggtctcaaactcaatttacctgggggccgcagga
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tgacttattgaagtcctagggaaaaaagtgggggaactcactcaaaacttccattccctc
acctaaaaaaggcttatatatgtataaataaaacacccccaccccactccagtcacatca
gtctgtaccagtctgtatctacctataatatatataagatgcagggcaggcacgtgcaga
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cgcgataacaccgctcttgagtacgcacgcgacaacacagctgatcagaacgcgcgcgac
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tctgtcagtgtacagcggtcagcgcgggccacaaaatattgcactgagggccgcaaatgg
cccgcgggccgcgagtttgagacccctgccctagtacatagagttttacaacataacctg
aaaacacctttaaaaactaaacgcatgcacaacagactgctataatattagttatgaata
taattttctagatgtttgtattgttggtgatttcatgtgttggatcgattaggtagcttt
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tttaagaccatgcatataccctgtttttattttgttttttagatatggagtgattgtaag
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gttttctgcaggtggtttgtcaaggccactcacccgtgaggcacactcagatttacatat
gcttagattgtttttgattatgcatgatgttttttgattatgtaatgttgggaaatggca
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ttgttgtgcgaacatgctcataaatattctctgatccagcacaaatctggtgcttcattc
tcatttagtagcaaacaaaggcactctccagcaactcaatgggagatcctcctacatgct
ggattcagtgccctgtgcagatgctcttcacccacccacacacacacacaaacacacact
cttcatttcaacactcttctgctgtataggcttaataagatgcacttgatgttagagttc
ctgaagtgttgatgtgaggattgcagagacgtcagtaaccctttgtatgcgtttcctcct
gcag
Exon 5
CGGGTGGTTTTCCTCAAGCAGCTAGACAGCGGCCTCCTCCTCGTCACCG
Intron 5
gtaagtgttcaggagtcattttctgcaagatttttggaaataaaattaaaaccacagtaa
gaaatagtgtgagcaaatatgagcatttgtctttaatatatacatagctgggtttccatc
acgctgttttaatttttaagttttgcgagaaatcgatgaccgaaatggcttattttaaat
gaaagtagcttgctttgcataaaatattatgctctgttttgttttgtgtgtgtaaagggt
ttaatggagtaatggaatttgctgaataaactgacgtaaaggctgcattatgcttggcct
gtttacttttggttgctaagttaccaatacaataatagagctctaacaacctgttggaaa
ttaaactaatttgcttttgagtagtgttatggcgtagttatgttctgggttgggttgcac
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gtcgtaaagtcatgcgtatagttgcaatgaatgacataatatcctataagaagcatttaa
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tagttccgttgcgcaattctgattgagccgaacaaaaagtgtgctctcaattggctagta
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ttaatcttggtttttataaacgattaaataaaattatcttctgtaaactttatttatttg
aatctctgactccggctcttcttcatctgacagactggtcattctttaggttaaagtgta
taccatccgtacactattaaccacgctttcattcattagggttaattgtaattctcaatg
ccgcgtttgtcacatggaacaaaactgcaactaaaagttatgccaatacgcacgcacatt
ggattactatagcagcaagccgttcatatattgcgtcttttccgcacgcaagttcatcta
atcgagatgtgcgctattgggagcggtgcacatgcggctcgcaagcggactgacgcactc
gcacactccaggtgcacacggtagaaattctcacgctgtagtggtcagttgtgcgaggct
ttcagggcaatgtaaacaaaagatacgttagacgaattattaaagattattgaaatgatt
gattgtacgaacacagataataagtaatttaaattcttagcttatataaagcttcaatta
acattagttttaacatacgattgtttttttattaattctatcattaatcactcatgttta
aatcaaactttaatttatttttaagtccaaagagagtaatggactatggtttgattttat
taatattgtgtgctgtatttggttactgatcagcagtaaacactaatattaaaatataag
cagttttcttgtgatcaccgtgaaactgattattcttcagagtataatcgtacaaccaaa
atctatcatcgttgcatccctagtcccaattaggttttttttttttttgccctcgagtcg
gagttatttgcgtacctgccgataccgaaaccaatcaaggtgtcctcggggccttaaagt
attaagttgataaataaattgagaattaaggcccttgtaggttaataagtcttaatttag
acaacaatcttattggcttatttgagatgtcttctggagaatcctaatttataatttaac
tctgactctgctcttaccttaataataatgacgatagtgtatgacttaatatcacaccca
tactctatgctgcattagtcacagtgtaaagccctgtgaagaactccaattgatgatgat
tcttgctcaatgaatgctcttcagtgtttggactctcagtattgaatattaaaccacact
gaactgaacttcaactctgaaaactgcactggcactgtttcaatttactagaacgtcaat
gttaagctgctttaacacaatctacattgtaaaatccctataaaaatagaggaaaataat
tgtctggtaaaaatgtctgtttaatttctacgtcagaaaggaaaagtcatcctgtcagtg
ttgttctccagtatcatgcagccatactgggattttgttgcagtttaactccataaacac
aactctaaccttaaactaatgataatataagactttaaatattgcacccatactcaatgt
aacagtgtaaatgtgacctgttaaagactcatattgcagtaaatgtttctttctctaact
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tttgcttatcagtaaggtaaagtctccttcagtgagtttccccagtatcattcagccatg
ctggggttttgttgcagttttgcggtgttgaataattgattgtgctctggtgtgtctctc
tcag
Exon 6
GTCCTCTGGCTATCAACCGCGTCCCTCTGCGTAGAGCTCACCAGAAGTTCTGCATCGCCA
CAAACACCAAAGTGGACATCTCTGGCATGAAGATCCCCAGAACACTGACCGACTCTTACT
TCAAGAAGAAGAAGCTGAGGAAACCCAAGCACCAGGAGGGAGAGATCTTCGACACCGAGA
AGGAG
Intron 6
gtcagatagctcatttatttacttcttttatgggtcaccatttattttaatgtacaattc
tcactagtgcagcgcgaaaatgttagttattaccataatttcattacttactaataactt
aaaactgatcaactagtaactaatggctttaaacaattattataagcaaacatagttgat
aacctccagatatctgccatatatatattattttattatatagccattcaattcatctgg
tgacattattcataatcacaaaaaaaaaaaaatatatatatatatatatatatatatata
tatatatatatatatttatatatatatattttgttgtgattatgaataatgtcaccagat
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ttctatacagtgctttgcatgaaatgtattaaattacgaatgttttatgtagcggatgcc
cttccagctgcaacccagcactgggaaacacccaatacacagttggcgaccccccccccc
cctgataaataaagggaccaagctaaaggaaaatgaataaatattaaattacaagcatat
ataaattcaacagagcaaagatgttaaatatggttttctggagtctaatacagtgtttct
caaccatgtttctggaggatcaccagcactgcacgttttcccatgtctccgtaaccaagc
acccctgatttagatcattagcttattagtagagactgaaagactaatgagtgtgacaaa
ggagacatccaaaacatgcagtgctggtgatcctccgggaacatggttgagaaacactgg
tctaatagtattcaggtacagaacttgaacaatcaagcataaaataacatggtcattatt
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cttaacgtattttttaatggccatttaatagtgagtgaacatctacacttttttttgaga
cttttcaaaaacccatagaaatgttgatggaaatatggctactggttgtttttattttcc
cccctaatgttgtgtgtttctgtggtttgcag
Exon 7
AAGTACCAGTTGACGGAGCAGCGCAAGGCAGACCAGAAAGCAGTGGACTCTCAGCTGCTT
CCTCTGATCAAGAAGGTTCCTCAGCTCAGGGGTTACCTGCGCTCCATGTTCTCCCTGTCT
AATGGAGTCTACCCACACAAACTGGTTTTCTAAAATGCTAATAAAACGTCAACCCAGA
3' Downstream
tccgtttctgtgctgctttgtttcttgttgtcgttttctcatgttgaaggctggaggtgg
agaattatttcatgaatctgtttttagatcgctaatcattcattttgttaataaatattc
taaagcaggggtctcaaactcaattcctggagggccgcagctcagtttagttaagtgtct
agtagtcttgaacaccttgattagctacatcagctgagtttgattaggattaaagtaact
ctgcagagctgcagccctccaggaatccagtttaagacccctgttctgaagtatgaagta
tttagcctttttttttttttttttttttttttaaataaaatgagtgattgtgttttccag
caatggttacaaaaacaagtagattattgaaccccttggctgtctgtcttgagcatgaat
gtgaaaatgatgttcaagctttggtggttttcagagcacaggtttaagtttggtctttga
taggttgcatacattcaagattatgaagtgaatgtatataaaatatgtattaatctaaca
tttaccacacgtttaaagctaattatgagcaaattatccaccattttaggttgaaactac
atcaaataccatagtaacattttgtagtctttaatttgactgaacagtttaggacgggag
tccaaactcagtcctacataatttagtgcaagtccaattaaacacagctgaacccgccaa
tcaagctctttctaggtatactagaaccttccaggcaggtgtgttgaagctagttgagtt
aaactacgcaggatagcgaccctccaggacggagtttgtacatccctggtttaagctaaa
tcaattcactgcagtggtctcgagctcaattctttgagggccacagctctgtttagctcc
aacccctgttctaacgtatgaagtttttagcttaattgtttttcagtgggttataaaatg
agtcattgtgttttccaccattggttacaaaaacaagcag