Species | Danio rerio |
Gene Name | Rpl6 |
5' Upstream | gtgccggatgaatgccagcggtgccaaaattgggccagaattctttgctacttgggttat
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Exon 1 | ATATATACGTCAAATGCCCGGATGTCGGTCTTTTTTTCTAGTTGAAG |
Intron 1 | gtaattgtggcttccatgtctgttttctccacacacaatctgcattaatctcactcatca
tcgcgttgtatgtcaatctatatcgtatttaaatgctttaaaatattcatagcgctaata
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tgcacattttaatgactatttattgtgcctag |
Exon 2 | ATGGCTGAGGGCGATAAGAAGAAGGTTGCCCGTAAGCATGGCAGCCGTAACCCTGAGCTG
GTCAGGGGCATCGGCCGCTATTCCCGCTCCGCCATGTTCGCTCGCCGGGCCATGTACAAG
AGGAAGACTAAAGCTCCAGTGACGAAG |
Intron 2 | gtgcgtttttattttcatgatcagcatattgaagtgtcactccaaatcagtgtttttttt
tttttttaagatctcttttgatgtttcag |
Exon 3 | GTGGAAAAGAAAATCAAGGAGAAGAAGGTGAAGCAGAAGTCAAAGAATCCCACCACGGCC
ATCAAGACTGTCGGCGGAGACAAAAATGGAGGCACTCGTGTTGTCAAACTGCGCAAAATG
|
Intron 3 | gtgagcaaaagatgtcatgagcagatcctgaagtgttctgaatgttttaagtcatgcagt
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ttattaattggttcaggtgtgtttgatatgggtagcaactgaaatctgcagaaaggtggc
tctccaggaacagggttagccacccctggtccatagtgtatgagtgtgtatggatgtttc
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ttattattttcatataatataatcaatgtcttgaatttagagaagactcagttcagggtt
tactcttgttcattactctagctcatttacatattcagtctcataaatagtgtgttatta
ttattgatttaaaatcttaaatcaaagttgcatgcatgtttagtggcctgattcagtcat
ctgtctttaactgttttacattaccgctgatcttcatatcttgttgtttttttccatcca
g |
Exon 4 | CCCCGTTATTATCCCACAGAAGATGTGCGTCGTAAGCTGCGGAGTCATGGTATCAAGGCC
TTCTCTCAGCACCGCAGGAAACTGCGCAAAACCATCACCCCTGGAACTGTGCTGATCATG
CTGACCGGACGCCACCGTGGAAAG |
Intron 4 | gtacacaaatacacccttcatcaataattactgcattcttctgaagaaatggtgaagagt
gatgcaccacaaacacattaccaccagcctcccttaacaaaacattagaatgcaaagttc
taaagactactcaagattttttgaatagtttatacggatgttttttttttaatgcatccc
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ttacccgattataaaatgtattctaattagttatttcttggccatatattttaaataatg
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ctgaagtgttgatgtgaggattgcagagacgtcagtaaccctttgtatgcgtttcctcct
gcag |
Exon 5 | CGGGTGGTTTTCCTCAAGCAGCTAGACAGCGGCCTCCTCCTCGTCACCG |
Intron 5 | gtaagtgttcaggagtcattttctgcaagatttttggaaataaaattaaaaccacagtaa
gaaatagtgtgagcaaatatgagcatttgtctttaatatatacatagctgggtttccatc
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ttaatcttggtttttataaacgattaaataaaattatcttctgtaaactttatttatttg
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taccatccgtacactattaaccacgctttcattcattagggttaattgtaattctcaatg
ccgcgtttgtcacatggaacaaaactgcaactaaaagttatgccaatacgcacgcacatt
ggattactatagcagcaagccgttcatatattgcgtcttttccgcacgcaagttcatcta
atcgagatgtgcgctattgggagcggtgcacatgcggctcgcaagcggactgacgcactc
gcacactccaggtgcacacggtagaaattctcacgctgtagtggtcagttgtgcgaggct
ttcagggcaatgtaaacaaaagatacgttagacgaattattaaagattattgaaatgatt
gattgtacgaacacagataataagtaatttaaattcttagcttatataaagcttcaatta
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taatattgtgtgctgtatttggttactgatcagcagtaaacactaatattaaaatataag
cagttttcttgtgatcaccgtgaaactgattattcttcagagtataatcgtacaaccaaa
atctatcatcgttgcatccctagtcccaattaggttttttttttttttgccctcgagtcg
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attaagttgataaataaattgagaattaaggcccttgtaggttaataagtcttaatttag
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tcttgctcaatgaatgctcttcagtgtttggactctcagtattgaatattaaaccacact
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gttaagctgctttaacacaatctacattgtaaaatccctataaaaatagaggaaaataat
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ttgttctccagtatcatgcagccatactgggattttgttgcagtttaactccataaacac
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ctggggttttgttgcagttttgcggtgttgaataattgattgtgctctggtgtgtctctc
tcag |
Exon 6 | GTCCTCTGGCTATCAACCGCGTCCCTCTGCGTAGAGCTCACCAGAAGTTCTGCATCGCCA
CAAACACCAAAGTGGACATCTCTGGCATGAAGATCCCCAGAACACTGACCGACTCTTACT
TCAAGAAGAAGAAGCTGAGGAAACCCAAGCACCAGGAGGGAGAGATCTTCGACACCGAGA
AGGAG |
Intron 6 | gtcagatagctcatttatttacttcttttatgggtcaccatttattttaatgtacaattc
tcactagtgcagcgcgaaaatgttagttattaccataatttcattacttactaataactt
aaaactgatcaactagtaactaatggctttaaacaattattataagcaaacatagttgat
aacctccagatatctgccatatatatattattttattatatagccattcaattcatctgg
tgacattattcataatcacaaaaaaaaaaaaatatatatatatatatatatatatatata
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cttccagctgcaacccagcactgggaaacacccaatacacagttggcgaccccccccccc
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ttgacaaaccaatgattaagactttcagctcaaactccttctgttgctccaaacttcaca
ctgcttattaatagttagggttatagttgggtttaggtatcatgcagaatctgtgcaaat
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cttaacgtattttttaatggccatttaatagtgagtgaacatctacacttttttttgaga
cttttcaaaaacccatagaaatgttgatggaaatatggctactggttgtttttattttcc
cccctaatgttgtgtgtttctgtggtttgcag |
Exon 7 | AAGTACCAGTTGACGGAGCAGCGCAAGGCAGACCAGAAAGCAGTGGACTCTCAGCTGCTT
CCTCTGATCAAGAAGGTTCCTCAGCTCAGGGGTTACCTGCGCTCCATGTTCTCCCTGTCT
AATGGAGTCTACCCACACAAACTGGTTTTCTAAAATGCTAATAAAACGTCAACCCAGA |
3' Downstream | tccgtttctgtgctgctttgtttcttgttgtcgttttctcatgttgaaggctggaggtgg
agaattatttcatgaatctgtttttagatcgctaatcattcattttgttaataaatattc
taaagcaggggtctcaaactcaattcctggagggccgcagctcagtttagttaagtgtct
agtagtcttgaacaccttgattagctacatcagctgagtttgattaggattaaagtaact
ctgcagagctgcagccctccaggaatccagtttaagacccctgttctgaagtatgaagta
tttagcctttttttttttttttttttttttttaaataaaatgagtgattgtgttttccag
caatggttacaaaaacaagtagattattgaaccccttggctgtctgtcttgagcatgaat
gtgaaaatgatgttcaagctttggtggttttcagagcacaggtttaagtttggtctttga
taggttgcatacattcaagattatgaagtgaatgtatataaaatatgtattaatctaaca
tttaccacacgtttaaagctaattatgagcaaattatccaccattttaggttgaaactac
atcaaataccatagtaacattttgtagtctttaatttgactgaacagtttaggacgggag
tccaaactcagtcctacataatttagtgcaagtccaattaaacacagctgaacccgccaa
tcaagctctttctaggtatactagaaccttccaggcaggtgtgttgaagctagttgagtt
aaactacgcaggatagcgaccctccaggacggagtttgtacatccctggtttaagctaaa
tcaattcactgcagtggtctcgagctcaattctttgagggccacagctctgtttagctcc
aacccctgttctaacgtatgaagtttttagcttaattgtttttcagtgggttataaaatg
agtcattgtgttttccaccattggttacaaaaacaagcag |