Danio rerio - Rpl13a


SpeciesDanio rerio
Gene NameRpl13a
5' Upstream
ttctctctctgataaagttaggtgaactgggtaaaggtgctgggaaaggaggtggtggtg
gaggtgccgtgaggcaggctggaggtgcatttggcaagaaacaggccgctgaggaggaga
tgtacttcaagtgagtggttttgcttgagctgataattatgtaattgcttatacttgata
tctactggccattagctgagtattattgaaaaaataactgaatgtaaagcaacctaaacc
gttacttcatgacctattctgtcattgtatttccttcacaggagaaaagagcaagaacag
ctgtctgctctgagaagacaccaccaggaagagattgaccatcacaagaaggaaatcgag
agattacagcatgagatcacccgccacgagagcaaaatcaagaaactcaaacatgatgac
tgaggcattaagacagaaaatacaacacatgaattgtgaaactgctgaatatttgtaatt
gcttatttactaaacagtgaactctgtgattatactattataaaagcatgttataataca
gatatggttatataactgaaacaacacattgtgtattaacccagtgcattttccctcttt
tgacaataaacaagaaattgtctcgaatgtaaaagtgtgtcttggtatcaatacgtttgg
tgaaagctaactattagctaaactaactaaagctaactattggtttgagagctaaatgta
tcttaactgttactttcagtcatataaataggttatgtcatctgaccagacaattaaagg
ttctgacaccaatgaatgacccaatattgtataaatatgagatatattaaaatatgccgt
aatgctgggtttcaggatcagattgagaaacactgctttagaaaatgttcgagacaacac
ttctttattattatatttttaatattttaaaggcgttgtagctcattggagcccagctga
tggcagtagacataaataacaggcattacaaacgtcctct
Exon 1
GAAGAACAGCTAATCCTAACGTCATTTCCGATGACGCGAAAGCTCCGCCCTCGCCCCTGT
CTTTTACGCCAGGCGGCCCCGCGTGTCTTTCTTTTCCCACATCATGGCGGACCGATTCAA
TAAG
Intron 1
gtgcgttcgagtggcacaatttacattctcatatctcgcgtttcctcgccgtgggaatgt
agtatttggtggtttataagtagttaacgtcaactaccgccttttgcgtagtttggataa
tgtccaaaacgtaaaactatgtttttgggaaagaaacgtgtgtgtgtgtgtgatcacgca
tgatgtgaggctggacgtcgcaggcctgttagtgatcgtaacactcgtggtgctgtaaaa
cccggagtagcgttgatgtccacgctcaggtactttacaaatcaactgcttctgctttag
gatgaaattatagcgtgttcagcgtttataggcctttctcaaccagcggcgcaaatgggc
ttacgttctgcaccggtgtccggtccatagcacgcattgctctgttgtgcgatatatccg
aaataagttttttttgtatggcgttataatatgctaatattaactacttttaggttaacg
tcagattagctttttgtcggtgacgagctcgcaaccacagttcagtattcgagtttaacg
accatgagaatactttacgtgcactaccatctgagacaaaaagcttaattaatattttga
tattatgaactctaagtagcataagtatctaattaacttgggttttatttattaccag
Exon 2
GTTCTGATCATTGATGGCCGAGGCCATCTCCTCGGTCGTCTTTCCGCTATTGTGGCCAAG
CAAGTGCTGTTGG
Intron 2
gtgagtttacatatttaaggtagataaagtctggtatcaaatatttataaccattctttt
tactaatgaatctgcattgtttgcag
Exon 3
GCCACAAAATTGTGGTGGTGAGGTGTGAGGGTATCAACATCTCTGGAAACTTTTACCGCA
ACAAAT
Intron 3
gtaagtttgaccatcagcaagtgtgttgtcttggggtgtgttcacttgttgttttggtcc
tgactgaaaaagttatgcgttttagctctgttcatgtaatattatcactttattctgatt
agtccccccctctgccccaaaggtctttcctaatagggtcccaaactgtctttttttttt
ttgcttaacatgtttgtacatgtgttgagctttataaagatgttataaaatttaaagata
tttaaaactgcatcaagattttctgcaacatggaagcttgattcatagtatcaggtgttg
aagcattctgccttaaagtcccattaaatcacaccatttattttagtttgctgtgtatct
ttcagtctaaagtttaattggaagtggactgatttatatctgtatttttgtgagcatcag
tcttcagatggccacatgctcataactattcaaatttaattggaccaaaactgctgaatg
tgaacatgccctaaagcaatttgacacatgtgatactaaattacaagttttcaaacaatg
atgaactcctttatcccgaatctgagccaagtttgatgataccaatctacggatctgact
actgagtttgagtcttagattatttgtagtcagtaaagtcattttgattagttgaaacta
aactggatgttgtgtttgtgcag
Exon 4
TGAAGTATTTGGCTTTCCTCCGCAAGAGAATGAACACCAACCCTTCCCGTGGACCATATC
ACTTCAGAGCCCCCAGCAGAATCTTCTGGAGGACTGTAAGAG
Intron 4
gtgagatttatctttctgttgtagaagcaagcattggctacatttcaaacagtgatgaac
tcctttatcccgaatctgagtccagtttgctgatacccatctacggatctgactactgag
tttgaatgtcaatgcttgtctgttcggttacatctctacaatggatgagtgtctgatgtg
ttttttttttcttaatcag
Exon 5
GTATGCTTCCACACAAAACCAAGAGGGGTCAGGCTGCTCTGGACAGGCTGAAGGTGTTTG
ATGGCATCCCTCCACCTTATGACAAG
Intron 5
gtagatttattcggtcttgcacaatttcacagattaattctgtcaatgatgccacttttc
tgccttgtttgagtgtcgactgagaatacacaaaattaactgagacatctttacttctgg
agtcagcaattggtctttctcgtggtttctaatctctgattgtgttccacag
Exon 6
AGAAAGCGCATGGTTGTCCCAGCTGCTCTCAAGATTGTGCGTCTGAAACCCACACGCAAA
Intron 6
gtgagtgctcaaccctccccttaatgtctcaatttaagtgtacaatatgttctaacgttt
gctttttgtcagtgatgtttttccacagtaagtatgagtttaacgaccatgagtccactt
catgcactaccagctgagacaaaaagccacagatttacccattttagtttaaagtccaga
aagcttgaaccaatgtagactcatttaatacttgttttagtgctgcttgttccccgttat
aaattgtatttttcctgtctttcactag
Exon 7
TTTGCCCTGCTTGGACGATTGGCCCATGAAGTTGGCTGGAAGTACCAGGCCATCACCGCC
ACACTGGAGGAGAAGAGAAAGGAAAAGGCCAAGCTGCGCTATTCCAAGAAGAAAGTTGAG
ATGAAGCTGACTAAGCAGGCTGAAAAGAACGTTGAGAGCAAGATCGCAGTATATACTGAC
GTTCTTAAGAAATATGGTGTTCTTGTTTGAGCTGTCCCTGCAGCTTGTCAAAATAAATGT
TTATAAAAACTA
3' Downstream
tggtcttgagtggatggattgtgtttttgagtttagaatttaagttcatatccaatgaga
gggctctggtcgcagacttggtgcagtgcaatctgagctgcatccaattattattttttt
ttgtaataatgcactcacctaaccctacctattacagtgaggtcactcactccattaagt
gcattgtctgacattgcattgctgagtgatgcagtctcaacttgcgtcataaaggctgca
tccacatactattgtatccaatggcataattggtttgaacaatggttgtgttagtgactc
tgttctaacatttaaggatgttttttgtaataattaaaccaattgttcaccaaaaaagga
tgtttttgttatctaagcagcattttctaaaactggttgaccaatggtttattggagaac
ttttgcatttaatttaccatgtttataaaattgatgcttttttaattgcatcctctgtca
gacaagaatttgttcttcagttcagctaaatagctcaagtaaatctggccctgttcattt
tgatggttgactaacatctaaattttagaacagatttgctgaatatattgcttacgagtt
ttgtttttgttaaggcctagtaaagtaaagctgtacgtttttttttttagaactatacgc
actcgaagctaaatctaaaatctaggcccgaagtcgccttcgtcggacttttattttgac
accagatcaaatcgtgaattcacgtgactttcagtatcaaacatggctttcatgacacaa
gatcagttcactgctttgcaactgctgttaaaggtagtgtaatatcacatactgtttagt
atatcgctgaattacttggcttgattgagctcgtgtattctgccatcttttactttgatt
caggctccgtctaaagatgctgttcggcagatctgcacagagagtttcccagccggagcc
ttcaagagtcagtctgtagtggagaaaactgccaatgctc