Species | Danio rerio |
Gene Name | Mrpl39 |
5' Upstream | aagtatagttgaaacctaattaacttaaaggtgcataaaatgaatgatgtttactggttt
tagtgtgtgtaatatttaaaactcaatcccactgtgaaaagctaaacagacttaaaacat
caagtttaaatgtgtataaaacatatagtttaatcctaattaacttacttgatttataaa
agcatgactgaattagctgattaagctgctttagtggtgtttaatattcaaaactcaatc
caatctcactgcaaaacttacatttctgagttgaatctaataaactttacaagtcatttc
ggtttgcatcaattaaactgacttaaaacatcaaggtaaatttgtatgaattaaatatat
agttgaaatcgaattacatgtacatttagtcatttagcggacgcttttatccaaagcaac
ttacacatgaatgaatgaattaataaattaacttcaagtaaacatgaactgttttagtgg
tgtctaataatcaaaacttctcactgtaataaaacttacatttttaaaaactgaggaaaa
acttgtacattttttttttttgtaaacttgacaagtcatttccatttacatcaattagca
tactatttatgaattaaaacatttagtttaaacctacttgaattgaattaacataaaaac
atgggaaactatttacctgttttaattagctataatatctaaagcttctcactataaaaa
aatacttacattttaagttgaatctaattaactttacagtttatatcaattaaacaaagt
ttgaatttgtgtgaaacgtatatgaaacctaattaacttggacataaaagcatgaatgaa
cagatttagctgtttcagtggtggataatattcaaaacattcattcatttctgttcagct
tagtccctttaatctggggttgccacagcggatgaaccgccaactagcatgtgttttaca
cagcggatgcccttctgactgcaacccatcactgggaaat |
Exon 1 | ATTCAAAACATCTCA |
Intron 1 | ctgtacaaaactttaacttttctaattaactttatcagtcatttcagtttatatacagta
tatacatacaggtgaagacagaattattcgcccccttttaaatttttgttttcttaaata
tttctcaaatgatgtttattggagcaaggaaatgttcacagtgtgtctgataatattttt
tcttctggagaaagtcttatgtgttttatttcggctaaaataaaagcagttattaatttt
taaacaccattttaaattcaatattattaacccctttaagctatatattttctgatactc
tccagaacaaaccatcattatacaatgacttgcctaattaacctaacctgcctagttacc
ctaattaccctagtgaagcctttaaatgtctctttaagctgtatagaagtgtcttgaaga
atatctagtctaatattatttactgtcatcatgacaaagagaaaataaatcagttattag
agatgagttattaacactattatgattagaaatgtgctggagtaatctgctctccgttaa
acagaaacaggggggctaataattctggggga |
Exon 2 | CTTCAACTGT |
Intron 2 | atgtatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatat
atatatatatatatataattatttttgatattgtgggatagcataattttggctcatgca
atggatttttggcttaaataaagtcatgtacattaaaaatgacgttctttatggtcaaac
agtttttttacatttttgagatgttccttgtcctgaccatcacatcttcacactaataat
taaatatgcatttaaataataatccagtctcaacactcagatattttctcctctattgtg
ctgtttttccatttttgcatcaataacaaatgtgggcggggcttaattttaatgggttaa
ttggcttgtggtttgctattggttaatcttatgtaaatgacaggttgacaccgtcctcat
ttcagcaaacaccaatcagagagtagaatggggagggaagggtttttgatttgatattgg
ttgatcgcttgtgagtgacagtttgaccccgcccctattgcagtaaacaccaatcagaga
agatatgtacagtatgtatgcatgaatgttctactgagcttatgtatgctgtaatataaa
tgtatgtttaataatgtataatgtccttgaaataacttgtttcataatagtaaatattat
aagtacttcgtattagtaattaacagcaaaagcatattcctactatatggtttgtgttag
aatgaaattaaggtttagtattagttacttgtacttttgcataatacattattattatta
ctacagtaaatagacacacacacacaaacacacacacacaatatatatatatatatatat
atatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatat
atattacgtaaaataaattattgcacaaatatgtaataatgtattataatgtacttgtag
ttaaaatgtcacccaaagcagtatgtttgcaacacagaacggaactgtaaactcgcttcc
cctgatcgcacggaatgtttttatcgctgcactcggaagcagcgcaagcatgtcgccgat
ctctgacagttagcgacttgatttttctacgtttatttgtgtagtgtatgtttattc |
Exon 3 | TGTTAACATTGTGCAGGAAAAGTGAGCTGTAGATCATGGCTACCGCTCGGACTGTCGGTC
AGATGCTTCAGCGCC |
Intron 3 | gtaagtggatcataataacacacataacactgatcaaactgaccttcagagagtgatgat
gactctaataatacacgactacaacacacacacacgcacacacacacactgctcattaaa
acccactacaatatattgcaagtgtagctcattactatgatataattacttaattctaca
gccagtttagttgatcagttcctctatagcgcatgtgtttggactgtggaggaagcccac
gccaacacagggagaacatgcaaactccgcactgaaacaccagctgacccagccgcgact
cgaaccagtggccttcttgctgtgaggccagttctaaccactgagccagaattacaaata
tttgtttataaatgtatatgcaaatgaagtattgtttagttaaatgtgctaatttgcata
tatttcatgcacgaaaatgtgaatttagcttgaagtctgcttcaaaattatatatttttt
tgacacattggatatttatttttaacattttatcaataaaaaaaaaacagaacagccaga
aataaagatcattattttattttgagataacatttaacatagtatagtcatatatacagt
caggcgtgttatttatgaacttcagaatgtgtatatgaatggaattgtgaacttgtgtgc
tgctgatttatggtttagtccaggaggaaaagctaatttagagaaatcagcctttaagat
atgaattgtaaataaagtaattgctaaattatttgcattaaaataataataaatatgtat
attcagatgttttcttaacattatactcaaaaagcacgatgaaatgtgcatgaagagctg
ctttttcatcaggatcttgccttggggctgtatattatctttttcagtagtgtttagcag
ctggttttattcaaaatgagggaaactagtcatggtgctgctcatacagttgctctactt
ttttacgtgtcatgatatgtgtgtggcgaggcagtggtgcagtagttaatgctgtcgcct
catagcaagaaggtcgctggtttgaacctcagctcagttggtatttctatgtggagtttg
catgttctccctgcgttcgcgtgggtttcctccgggtgctccggtttcccccacagtcca
aacacatgcggtacaggtgaattgggttggctaaattgtccgtagtctatgagtgtgtgt
gtggatgtttcccagagatggtttgcggctggaaaggcatccgctgcgtaaaaacttgct
ggataagttggcggttcattccgctgtggcgaccctggattaataaagtgactaagccga
caagaaaatgaatgaatgaataatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgcactgcattgtgg
tgtgtgttttgtgtgtag |
Exon 4 | GTATGGTGTCCAGCGCTGCAGCTGCTCCTCGTCTGTCGTCTGCAGCGGTTCTGGCTCAGC
GCAGTGCTCAGTTCTCCAGAGAGCAGCTCCGCCAGCGAGCGCTGCAGCCGCGGGTGGAGA
AGGTGGAGGTGCAGCTGCAGGGGCCGGGTCTGCAGGGGACGCTGCTGGTGATGAACAGAG
GCCTGTCTACACCATACAGCTGCGCACGCC |
Intron 4 | gtgagtctcattcacacacacacacacacacacacacacacacacatatatatatatcgc
actcatactcatgctcctctgtagacccttcactcttgtgtgctgttgggtcattttcat
ccacagctgtctctgtgtttcagcaaatgtgatgatttttggtgacagacactccattat
taatcacagttattgattgtaaagtcaagacagcagataagcatgcacttttggtcgatg
ctggttttccctgttgtgatttagagggacgatctgtcattttactttatgaaattaaat
tcaaagggcatgaccaattatagactccaactgctctgattggctgacagttttgcatat
taacagggctaaacaggcagtgcagtaaaagtgggtggggatcatctgtggaggcggggc
ttatccacattgttacttcctagactagaacattccagaatctgtggtttagtaagactg
actttagtattagctgattttagaagaaacaagagttcttatatagtaatatatattgct
tatacactcaatggccactttattaggtacacctttctaactgcttgttaacacattcac
atggcagcagctcactgcatttaggcatgtagacatggtcaagaggatctgctgcagtta
agagactctgagcgtggcatggttgttgctgccagacgggctgctctgagtatttcagaa
actgctgatctactgggattttcacgcacaaccatctctagggtttacagagaatgctct
gacaaagaggaaatatccagtgagcggcagttctgtgggcgcaaatgccttgttgatgag
gccagaggtcagaggagaatggccagactggttccagctgatagaaaggcaacagtaact
caaataagcactcgttacaaccgagctctgcagaagagcatctctgaacacacaacacgg
ccaaccttgaggcggatgggctacagcagcagaagagcacaccgggtgccgctcctgtca
gctaagaacaggaaactgaggctacaattcacacagactcaccaaaactggacaatagaa
gattggagaaacgttgctgctctgatgagtctccatttctgctgacacattcagatgctc
ggctcaacaacatgaaagcatggagcatcctgccttgtatcagcggttcaggctggtggt
ggtggtgtaatggtgtgggggagattttctttggctccattagtaccaattgagcatcaa
cgccacagcctacctgagtattgctgctgaccatgtccatccctttatgagcacagtgtc
tccatcttctgatggctacttccagcaggataacgcagcatgtcataaagctcaatcatc
tcagactggtttcttgaacatgacgatgagttcactgtactcaaatggcctccacagtca
ccagagctcaatccaatagagcagctttgggatgtggtggagcgggagattggcatcatg
gatgtgcagccgacaaatctgcagcaactgtgtgatgctatcatggagcaaaatctctga
ggaatatttccagcagcttgttgaatctctgacaccaaggattaaggcagatctgaagac
caagaggtccagccaggtattagtaaggtgtgcctaataaagtggccagtgagtgtacat
tatagcagtttgagctctttctcacttcatgagtttttaaaatcagcaggcgtctccaaa
actaaaccaagatctcgctgtgctccacaaattgtgaccacacatgtcatcaggtgcagt
taactctgaaattaaacaaatacatgacttaaaatattatgtggtgttatattgatgcac
ttttggtactatgcatgtttattcagacctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgt
gtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtggataagttgtatatgtatccgcttg
ttaagtgtgacgtcaatcaaagcagctttcgagtccagtcgctctcaaactgtacaggga
gactcaacaaacggtaataataaatgtttacaaagcgctgtaatgctttcgaaaatcacg
atcacaatatatacatatatctatgcctaatatcaggtgaccagacagtgattagttttt
attattgttcaaatattgctgtttgtgatgcagcaagcccagagactgtagcgtacagca
tgatttgatattaaattctctttaatgtgtgatgtgactgaatagtggacattagttgtt
tattttcacagtttaaatgagtatcggattgaaacagtactccatatacatgcccgtagc
cagggggggtccatggccaaaaggtcctgaatttgtccttaaattatttcatttaattta
acatatttattatataattaatataatatatttatattcaatatttattgtaatagtgtc
attttaatcaactctggccagtaattggaatcccgtagagcctcaaagccacagtaatgt
gacgcgagtagcgtgacataacccactgagtggtcacatttgaatctttgatgcgacatt
catggatactgactgccaaacagggtaaggcaaaaggtactaacttcctaacagatgaaa
atctgcaccatccatgaggttctaggctaactggccccattagccgggacgtcctgtata
tttattgacttgtccagtacatgacctccctttccctatttttgccattcattttttttt
aataactgtctgacgaaagctttaaatgggagtcctcagtcccgtcacgtctgtgttttt
gaggcttttttttctcactttattcgttttgttctgatcggatataaacccaatcgctca
aaccacttcaggaggtgatctggatgcattccagatgaaactggatcggtctaatcattt
ttgggacgaaattaatataaacaaaataaattatgacctggagaaaatctgaccatgcct
gtaggggtaataaggctttatgttgttttagaaaaaatctgaagaataattaatattgta
ttattattattattattattataaatattattgttgtaattaatattatttttttattga
aatgtccaaattgtgactgaggacagttgcatgctggccagtttgtttttattctaatag
atgatagtagactacagtttttttttctttaagactttaacagatatttcctaatgatat
ataatataataattttatttattttttaaaatgaatcttattttaatttatttaatagca
ttttttgggaaatatttttagtacatcaaaaagtgtggttatgatcaaatctgactagcc
aatccagcaaaaaagtcactaaaacgcagtattgaaatctcatagttgaatagaaactga
ggcgtgtaactgcaaaaaggtccactttttgagaaaaaaagaaccaacctttcaccaggc
tggctgcgggcctgatatatcaccacttaacaagcgaataaccagctgtgaggacagtgt
ggagtttggagaatcactggcgttgttgtttcatgctttaaatgaactgtgatcaatgct
aaccagtgttgtgttgtgtgtgtcag |
Exon 5 | ACCTGTCCGAGTGGCATGTGAACAGCAGTGCGCTGGCACTGGTGGACGGTCAGCCGTGGC
ACATGCACAAACCCCTGACCCGCTCCTGTGAGCTCACACTGCTGACCTTCAGAGATGCAG
ACCCACAGACACTCAACCAG |
Intron 5 | gtagactccctcaccactaaacagattatcacaatcagaacaactgctggacgtgagttt
aaaggggacagattatgctgaaatcactttaataaggagttacatgtgagcagtgtgtgt
gtgtatctccagcagcctctaatgatgaacatgaactaattgtgtttattataaccagac
ttgatgcagacacactgtgattggcattctccctttgtacgcatcatcagaggggaaagc
cccgcccactagtgcccatctctccatctcattagcatctccagcagccctgagtgagaa
gcagccgtctgtccattcgccattagagtgtttgagctgctgaagatgatgtcagcatag
actaagaggagtatagatgtggagttctagatgaagcacacatgaacactgcagtaatgt
gcacatattgtgaagctgctgttaaatgataattattgttaaaaacactatacaaagaac
ttaataggtattactttacattaagactagttgatgcagtgtaaagtgtgtgtgtttcag
|
Exon 6 | GCGTACTGGCGCTCCTGTGCGGCTCTTCTGGGTCTCGTCCTGGAGTCAGCCTTTAAGGAT
CAGTTCAGTGTCGAGCTGCTCAAGACTCCTGAAGTGCCAG |
Intron 6 | gtcagactgatcctcactgtgtgtgtttattttcagcaaaggacatttaaaagaacttgt
gtttttattttatgctgaaatctaattgaatttgttctgttttatttaatttttatccgt
tttatttaagcatgtctgaaatttagtgatttttattttattttattttttaaattttat
tgttttcactttcatagttttattaatgaattacttactttataatgttgtgctttcctt
tttcatttctctagtttttatatttaaagtttgaatgtgcacaaataataaaccccctgg
ttgtgtttgcag |
Exon 7 | TGACGGCCGGTGCTTTCTGCTGTGATCTGCTTCTGGATCCGCTTCTGGACTCCTGGAAGC
CCACAGAG |
Intron 7 | gtcagaaacacctcctcaacactgatttattctcatctcactctgcatctcatttgcttt
caattatgattcagggttttctgtggaaactaaaagtattgaggaaacaaaaacacatga
tcattttgtaaaagtaatttgaataattgaataagtaattttcatttggctcagtccctt
attcatcaggggtcaccacagcggaatgaaccgccaactattccagcgtatgttttactc
agcagaagctcttccagctgcaaaaaaaatcttcttttgtgtttaaaagaaagaaagaaa
ctcataaaggtttgcacacacttgagggagagtaaatagtcaatatattgaatttttggg
tgaactgacccttaataactccaacatgaacacacacatcgaatacaaataaaaaagtca
gctgaaataataaaccagtttaaatgtaaaatataagagctgtttaaccgagagggtttt
tacttcattcatttattcattttccttcagctcagtcccttatttatcaggggttgccac
agcggaatgaaccgccaactattccagcatatgttttacacagcgaatgcgcttccagct
acaacctagtactgggaaacacccatacacactcatttacaccgtcacactcatacacta
cggtcagtgtagttgatcagttcccctatagcgcatgtgtttggactgtgggggaaacca
gagcacccggaggaaacccacggcaacacggggagaacatgcaaactccacacagaaaca
ccaactggcttaaaaacacatgcaaattaaaacatttcacttcattagagttaaactttg
cggtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgcgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgcgcgcgtgtgt
gcgcgtgtgtgtgtgcgcgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgt
gtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtttgctctgcag |
Exon 8 | GAGAATCTGCGCAGTCTGACGCGTGACGCGCTGCAGATGATCAGCAGAGATCTGCCCTGG
GAGCCGCTGGAGGTTTCAGCTTCTCTGGCCCTGGAGATCTTCTCTCAGAGCAG |
Intron 8 | gtccagcaaacacacactcatttagcagacgcttatatccaaaaaagaataatcataaat
gctgtaaaatgtaagttggtttagctgtaaaaaggtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgt
gttcag |
Exon 9 | GTGTAAACAGGAGGAAGTTGAAGAAGCAGCGGCTCAGAGTCAGAACGGGACGGTGACACT
ATACAG |
Intron 9 | gtgaacataacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacaca
cacgcgcacacacacaggcatgcatacacaacacacacatgcacaaacacgtacacaagc
aaactcagcacacatacacaagacataaaaatccaacacacacacactctacactcatga
ctgcacacaacacaaaatcgcacacacacacacatatatgcacaaacacacccaatgcat
actcaaacacagatacaccacattcaaaaacacacaccaaacatacacacacatacatac
acacacacaatgtgcacaaaaccaccaatcacacacaacacactcaaaaatatacacaca
cacacactacacaacacatacacacacaacatttcttggtgctcacaggagaacttgtgt
ttagagcatcagtgtgttatgtttatggtgtgtgtgtgtgtgtgttcag |
Exon 10 | GTGTGGAGATCATGTGACGCTGAGCTCCGCCCCACTGGTGTCCCGCACGGGTCTTTGCTC
TCAGTTTGAGGTCACGTCGATACACACACTCTCAGAACACACACGCGGAGTCCAGCGCAG
AGCTCAGGGGCTCTCACTGCCCGTCAACCTTACT |
Intron 10 | gtaagtacaacacacacacacacacacattctctctctctctctcttacacacatacata
aacacaaaatcacacacacatctactctttctctctctctctctctctcacacacacaca
tacacactatctctctctcacacacacacacacacacacacacacatattcttacacaca
catactctctctcttacacatacataaacacacacacataattacactcaaacacacaca
ttcatatacacacattcacacacaatctcacacacacacattctctctcgtacgcataca
taaacacacataatcactctcaaacacacacatacacacatatacacacattcactctca
cacacaatctctctcacacacacacacacacacattctctcttacgcatacataaacaca
cacataatcacactcaaacacacacacacacacacacacacacacacacacacacatata
cacacaatcttacacacacatatacacacacacacattctctctctcttacgcatacata
aacacacacacacacacataatcacgctcaaacacacacgttcatgtacacacattcatt
ctcacacatacacacacacaaacacacattctctctctcttacgcatacataaacacaca
cataatcacactcaaacacacacattcactctcagacacattcacactcactcacaaaca
cacatacacataatctaacttacaaacacactctctctctctctctctctctctctctct
ctctctcgcacacacacacacacacacacagcagatgctcaggtcagttgtgatgagcag
atctcctcattcttgatttaaagtccagttttcttcagcgttagtgtgtgtctgcttcat
tctcagtgttgatcccactttcag |
Exon 11 | GCTCATCATACAGTCTGGAGGAAGCTGCGGAAAAGAGCAGAGAGACTG |
Intron 11 | gtaagtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtggaatattgcac
aacatttctaaataaaacacagcatcagtcacgtgtttaagagcagaacacacagacgac
tgaaggtacagccaataaactacacttaaacaccaacagaaatcaagtgttcatcaagta
ttattgtgtttaattctctgccgcctagtgttggtcttaaatgagtggtacggttgggtt
tgatacgcttttatggccgtttccactatgaaaaggtgtaccgaactataccatagcact
ttttcagcactctttcgaaacggtactaaaaggcggagcgagacgggcagctgaacgcta
ttggtttacagagaaacgtcattcgcctgcgcaacaagccagaatgaaaacaaaagagcc
gccatgtttgaaatacacagcgagagattacagcggaattacatatacatttaataacga
gccatggtcgaccagcgctcaaacaaaccttgccgtcgtcttgatgaacagccacaaagc
catggagtagagcagatttaccctgtgcctcgtagtttttacgcaccaaaaggagaccct
tgctaatagccaacccgaaccgtaccgtactgtaccagtcagtggaaacgagccaaaagt
gaaagtttttgttcatctgtaccaaagacccttcaaggcagtcatttcacttcacgacag
aacgacagactttcatgctcaagctctagtctagtctgactacggcgttagttgactgca
agtgagaggcggagctcaaaaaataaaccccgcccctacccaatattaatattcagttgt
aaatacatcctcatactgaaataaaacctgcaacaacttcagggtgatgctttaacatga
cagaatcactgaaaaacgagataaattcaaactattcaattaaactattaatgaaaatat
taatcaataaagtaaaatgataaatctaaatgtgaatataaaactaattctacatggaca
tttctctgctcttacag |
Exon 12 | GTGGAGCTTCCCTCATCTTCAACAGAGGCTCCTCCTTTCAACACAGAGACTCCACCTGCT
GCCTCTGTGACTCCACCCCCTCTACCATAATCCCCGCCCCCTCTCTCAGCATTCAGTGTT
TGTATGATATTGTTGAATAAACGTGTTGACCACATGTCTAA |
3' Downstream | tactgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtttaa
atgtcagaggagctgctgattattgtaatccagcacagtttggggcaatacgctccaggc
tacttcattgtgtgtgtgtgtgtgtttgtggattttggcattttaattcagcaaatacta
cacttgtattctgtctatattctgatcacacacacacacacacacacacacacaccagac
gcttcagttgaatattcatctataatatgatcatgttcctcctggaggtttgtttagatc
attcacctcatttattttcaactgctagaaatcgtgtttctccatcagtttagtcttctg
gtttatagaggaatattgagcagagttgatcagcggtcattctcaaatcaaacagcagtc
tttaactcggtttatccagtgttcagtgtacagctctgcagatggagacatattcactca
gccattcattagtctttgttttgggttctcttaattagtcaggttgccacagtgtaatga
accgccaacaattccagcatgtgttttacacagtggatgcccttccagccagtactggga
aacacccatacacactcattcacacacacacacacacacacacacacacacacacacaca
cacacactacagccagtttagttgatcaattcccctatagtggaggaaacccacgccaac
acggggagaacatgcaaactccacatagaaacaccaactgacccagccgagactcaaacc
agtgactttctttgctgtgaggccactgtgctgaccactgagccaccgagtcgccaccga
taccaattattttctttctaaatcaataccaagtgtttcaagactgaaatattttactgt
ggtttgttttttaatcgtttttttgttttattaatgtataaaatacaataaacaaaataa
atttttgagtttgttaattagagaacattattaaacatca |