Species | Oryzias latipes |
Gene Name | Rpl3 |
5' Upstream | aacacgtccaacctcgaggcagatggcctacagcagcagaagaacccaccgggtaccact
gctgtccgctaagaacaggacactgaggctacaattcacacagactcaccaaaactggac
ggtaagaaaaacgttgtctggtctggttagtctctatttctgctgccacatttggatggt
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aaatgcagaaccagcagtacggaggccctctttcattcgg |
Exon 1 | ACTGGAGACACGATG |
Intron 1 | gtgggtgtggatttcactatttcttcgtatcccaatccttcaattatcaaaagcatccta
catattttgtcacttttaaagtaatcggttagctttcttggggtccatcactaaattttt
aaaagttcttgcgggttaaattgtagggtgtctaaggtgcattcttgccatttctccaat
acgtgaaaggcaggtccattctttaaacttttattaattacgaacctatacattttaccg
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aaatgaaaacatggatgagagatctagtgaagttattggtgctaataaaagctctgggct
catggatgtctttcctccacag |
Exon 2 | TCTCACCGAAAGTTCTCAGCTCCTCGTCACGGATCTCTGGGCTTCCTGCCCCGGAAGAGA
AGCAGTCGCCACCGCGGTAAATGCAAGAGCTTCCCCAAAGATGATCCGAGCAAGCCCGTG
CATCTGACCGCCTTTCTAGGCTATAAGGCCGGCATGACCCACATTGTTCGGGAGGTTGAC
AGACCGGGCTCAA |
Intron 2 | gtaagtagttctgaataaagttattttgtgtctatgaagtggctcttttttagttaacaa
ataaggtaaccgtttagaatatggtgatctgctaatgatgagactctcgacgggcggaca
taatggggtttaaccccttgctgaatgtcgtctactgaaagcgttctgccatgataaatg
catgtacacgcatgctgtttggtggggacaaagggtttgtaaatgtttgtgttgtcactt
gcag |
Exon 3 | AGGTGAACAAAAAGGAAGTTGTGGAGGCTGTTACCATCGTGGAGACGCCTCCCATGGTCG
TGGTTGGAGTCACTGGCTACGTCAGCACCCCTCGTGGCCTCCGCTCCTTCAAGACCATCT
TTGCAGAGCACATTAGTGATGAGTGCAAGCGTCGCTTCTACAAGAACTG |
Intron 3 | gtgagttttataaacatggctgttaatgttgaagcagatgttagtcgccagtgagaatga
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tcaggtacctggtacctcgatgagctccgggctcctctggccagtggaaagcgcttctta
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ggctgtcgctttcgcactgtgttcttccgctgacccctatggggttatgaaggacctgtg
caaatgtttgtgttgcttgatgctcccag |
Exon 4 | GTACAAGTCCAAGAAGAAGGCTTTCACCAAATACTGCAAGAAGTGGCAGGATGAAGAAGG
CAAGAAGCAGCTGGAGAAAGACTTTGCCTCCATGAAGAAGTACTGCCAGGTCATCCGTGT
CATTGCCCACACACAG |
Intron 4 | gtcagtacgtccggcttggttcatcatttgtattttgtcagtgacgagaccacggaacct
gcgccaggcatggcgcctgatcagttatgaagatagtttccatgctgccttccttctgag
acgagttttcacggaactcttgtacagaatcggttcataagctttattttaacactgttt
ttttttttcctttggtgcag |
Exon 5 | ATGCGTCTGCTGCCGCTGAAGCAGAAGAAGTCTCACCTGATGGAGGTGCAGCTGAACGGG
GGCACCATCTCTGACAAAGTGGACTGGGCCCGTGAGAAGCTGGAGCAGGCCGTGCCCGTG
AACACAGTTTTCACTCAGGACGAGATGATCGACGTCATTGGTGTCACTAAGGGTCACGGA
TACAAGG |
Intron 5 | gtatgcattccctgttttttttctcttgcctgtagctttaaagctttccagatgtattaa
agatgactaaatgactcgtag |
Exon 6 | GTGTTACCAGCCGTTGGCACACGAAGAAGCTTCCCCGCAAAACCCATCGTGGTCTGCGTA
AAGTGGCCTGCATTGGCGCCTGGCATCCTGCCCGTGTGGCCTTCTCTGTGGCTCGCGCTG
GTCAGAAGGGTTACCACCACCGCACAGAGATCAACAAGAAGATCTACAAGATCGGCCAGG
GTTACCACACCAAGGACGGGAAGGTTGTCAAGAACAACGCCTCCACTGAGTATGATCTGT
CCAACAAGAGCATCAACCCACTG |
Intron 6 | gtacataccttcaaagggaaacggttcacatttaacaagacgagtgttggttattcagtt
gtggtttttctttag |
Exon 7 | GGTGGATTTGTCCACTACGGACAAGTGGCCAATGACTTTGTCATGGTGAAGGGCTGTGTT
GTGGGAACCAAGAAGAGGGTGCTGACTCTGCGCAAG |
Intron 7 | gtgagaactgttcctgaaaggttcacatgttcaagtcccactccagttatctttggtctg
cttcatattcacaagcatttatactcagaactgcattcttaagcttgctgttctttgagt
cctcatcactaacatccacaggggcttgttaagaacattgttgtgggttggaggaaccgc
tttctccagaactccttcggtgcagacgcctctcagatgctgaacgtgtcctcttttcct
cag |
Exon 8 | TCTCTGCTGGTGCAGACCAGCCGTCGCGCGCTGGAGAAAATCGACCTCAAGTTCATCGAC
ACGACCTCAAAGTTTGGTCACGGCCGCTTCCAGACCATCGAGGAAAAGAAGGCCTTCATG
|
Intron 8 | gtaaattttctgaatcatgcagaagtaatctgcatcgactgttccttcagcctctctgca
ctgttcgtaacctggttcatcctgcagtgtgaactctggttccattccagtgccatagta
acccccagtaggcaggggagcagtgcctccttgtggtggctccctgttcactctctggga
acacggcagcttctgagccagcagcagacctggcttttgacatcctgctgatgtagtctc
tcttgtccacag |
Exon 9 | GGACCCCTCAAGAAGGATCGCATTGCCAAGGAAGAGACCGCCTGAGGCCCCTGACTTCAA
ACCACATCTCTGCTGCGCTCTCTGTCATCCATGTTCATCTGCAGAGTTGTTTAATAAAAG
AAAAACCGA |
3' Downstream | gcattggcgtgtttgtaaactgttttctttaagagtacttttggagcacagaggagcaga
attccagcttctatgcttaaaagctctagacttcattttaaagttctcgctggatccact
gctgccttaagagtccttgtgctgcgattggcagtcaaaagacttattaagcccaaacac
ttttgacccatgattgcagagaaaaactcagtttcagcaggtaatgagaccctgagagac
tggtcattaagaacatgggttatctgcataaaaagcgaggaggtgggattgttgaggatt
ttcaaagtttctacactttcacctgcagctgacgggattcaggactgagaagcaaagcag
tttttacaccagaggatctttgggggcagttggccctgatagtgcagcgcggtgaggctc
ggtggtcaggagcttcatggagacggcccgctgttgcataagccgctccagaggctgcga
cctctgccacgccacacacaagcagcgtttggctttacataacggcattgctgaataagc
cgctcagaaccacttgacatggcctcgtcggtcctgtccactcgaggccggatgtcccag
cagcaggggtctgcatgacggccatgtttttgctccaacggaatagtatcgcccatgtgg
ttctgctcctgagggcttagtggaaggtcacgtctgggccttcaggtgactttatatttt
tattttttaagaggctttcgctaccttaattttaaactttttgttgacataactagtatt
ttgttggacgctgtaaataaagtaatttgaaattttaaaatgcagtaattgtgcagattt
tttttcttcatttgtttaaagcgtttgtcaaaaactgcagccaaaagtaaacatgtcaat
tgaaacatttttctccagttttagtctcatttggatattttgtggtaaaaagtacaatta
agtcacttttttaattcaagttgttttttaaacttcgggt |