Species | Oryzias latipes |
Gene Name | Rpl11 |
5' Upstream | tttcaagtttgcttacatatatgaacaaatccttccatctcgctacattagaatagaaat
tcaacagactaatttgacctgtataaaagacactggggctcgagtaacagatttggctga
aatagagtttttaacatgtagcgaacaaaaaatctgaactctgaagatcgtatatttttg
ttctgatgttttgcaatttatgttatagtgattgggactgtctaattatttttttgattt
tctgttgtctttctaacagttgtttttcataaatcaaattagttattttgcaaacttcat
cagattcctttgttttctttttgaaacatgagataaaacaattttaaagtaagtttaaag
tactttgtaaagacagcataaaatttgagggagtacagccatctgttttgagtctacgtc
aaacttaccacaattttgatgttagaaatttcagaagacataagtaatcttaaacttggc
tattaattacattattaagtgcaatttaagcattataacagatattactttaactcagct
aaagatggaaatctatttgaaactgcaaaagaccaataggagtttgtaactttttgatta
aaaaatttcaattgctttttttaaaaattattcaactggtttgttgattatttttgacag
atttgctcaattatttttataaacccaagtttaatctagcctaatatgatttttttaatt
gaaatagggcttttcaaaatgaacaactgactttcaagaaaaaaataaagaattgtgtct
actattttaagaagccacacaacagatgagtgactgctttacagtccttgaactcgacat
gtttagaattttggtgttctctgaagcttttacgctgaaatatcacttattgcaccaggc
agaacctttgtatttgtttgagtgtgtttagccgagctactttacggggaacacagtggt
ataaaaacgcatcgccggaaacggaacgccctcttctagt |
Exon 1 | GATCCAAGATGGCG |
Intron 1 | gtgagtatagtccacatcgaagcgttctgtgctaacatgaactttcagttgaaatcctca
atcatctgcgttgtgacatcactttcacgggcgtatgaatttcagtcgattatacttaac
agtattaaaatgtatttagaaccatttagtttaaattttcaggcaaaaatagatttttgc
aagaattaactgcggctatgctaataggctaatctcagaaatgtccgcgtcatttgcttt
tccagttataaacaaatgttcgtagacttaacataatagttgatgccggtatatcttgag
cacggtttcttttgaggcttttattcagttcacagacaccttattgacggagcacagaac
ttctgtgtaggtgactgaagggatatatgtacggacatgtccaccgaccgaccggccggc
gtgttgtaaccccacgctgtcagtgggtgacatgagaccgactgcttcctggcgacattc
gggaacgtttagaatcgtatttttcagagtggagtttttgtttagctgaaatggttggtt
taaatgaacttggcatgttcaacaggtggtgcagaccacgctgtcactagtagatgttta
atgggattgtctgatactgcag |
Exon 2 | GAACAGGGTGAGAAGAAGGAGAACCCAATGAAAGAGCTCCGCATCCGCAAGCTCTGCCTG
AACATCTGTGTAGGTGAAAGTGGTGACAGGCTGACCAGAGCAGCCAAAGTGTTGGAGCAG
CTCACCGGGCAGACACCTGTCTTCTCCAAAG |
Intron 2 | gttggtgttgttgagtgtgaagagatggtgagggcttattgtgtggccgggtttcatttg
tgcaatattttgtttattttttcag |
Exon 3 | CCCGTTATACCGTTAGATCCTTCGGTATCCGCAGAAATGAAAAGATCGCTGTCCACTGCA
CCGTCCGAGGAGCCAAAGCAGAGGAGATCCTGGAGAAAGGACTGAAG |
Intron 3 | gtttgtgagctttgtcacctggaagatcatcaatgcacatgtagaagtctccaagctgac
ctgagaccatgtttagctattgaaagtatattttgtctttcaaacttatgtaggggattg
tgggaaaccaagtgatacagataccctctgtgccgttaatagagatttctgatagatctc
ctttggtaccaatgtattttggtttaaacacatttacagttaaaatagttaataaagatt
gatttaaggtgatacagaaaaagtttttagaagtcaccgttgcagcagaaaaccgattta
tcgagtcgctgtttcttggtgaaaatgtttacacgtgttgtggtctcctcctttagggat
cagaaaagttggtgtcaaggggtgaaattgttctgaactaacttctgtttagaccaaagc
aattatttgtttttcctttttattatcctttttacccgctttacatttaaataaaccatg
cccacattttcaaacaggatagaaggaaagattttttttttttttttgcaccattcccaa
aggttttttgcaaaaaaccttaaggttgttttattttccgnnnnnnnnnnttctcaaggt
tgtttgcagaaaagcttaaggttgtgttattttccgtcaaaataaaagcctccatacaga
ctctagatcctgcagaaccagctgtgggtgtttagttctttaattatcacatttattaaa
acttcagttcgcacgattagaagaaaatctgtttaagtttgtcttcatttaaatctcgat
ctgtcgctgggaatgttactgttggattatgtagatgttctgctctctgatttacag |
Exon 4 | GTTCGTGAGTACGAGTTGAGAAAGAACAACTTCTCCGACACAGGAAACTTCGGCTTTGGC
ATCCAGGAGCACATCGATCTGGGGATCAAGTATGACCCCAGCATCGGGATCTATGGTCTG
GACTTCTACGTG |
Intron 4 | gttagttcatctcaactttttcattcatctttttatcttctgctgctgaaattggtcttt
atacatcatcacatcgaaaagcatgtatttgataagtgtgtaactaggttggagccaaaa
gatcttctttaaaatgatcaacactgacgagctaaaactgaaacgctgctctctaccttc
ctggtcag |
Exon 5 | GTTCTGGGCCGACCCGGGTTCAGCATTGCTGACAAGAAGCGCAAAAGAGGCCGCATTGGA
TTCAGACATCGCATCCGCAAAGAGGAGGCCATGCGCTGGTTTCAGCAGAAA |
Intron 5 | gtgagtgctgaacgtttttacaacatactcatggtgcaaaagattaaataatggagcaaa
atctccattctgcttcaaaactgggcatttttctagtgattatatacagttttgtttctt
gtacatgatctcaattcatagaacgagattaaactctggttgtacacggtaaatgttaaa
gtaaaccttaaaaatgcttctaaggacttaattgaaaactatcagtttgattttaacaaa
gcttggattagagccacttctgcttaaatcaaagtacatatcaagttaacatcatgaact
ccataactggaattaacaggaaagatgtttttaagcaaattaaagctgctttttggctac
aaagcttttggtttttaaatattctttgattgggttgaaatgggcaagaataactgattt
gatgtgaaacaggaatgttttcagatcgtcagttatcttttgtgtcttgctgagtctttg
cttcattgtaggtggagaattttccacagagtttgagaatctgtggttctgctgccttca
gtgaaatgcctcgactgcatatctgttgtagaacgtctgtgaaatgtttcctgtcatgat
ttccatcattggatctgtgaataaaaaatgtacttttagttttttgagttaatatttctc
gttgaactccagaacatgtttgtttttacactgaactgaacttaactttttccttacttt
tcag |
Exon 6 | TACGACGGAATCATTCTCCCTGGCAAGTAAAGGACATCCTCTTTTGTTTGTAACAAAGTA
ATAAAATTATT |
3' Downstream | aaaaaacaaactgatttttttctgtttttattataatatacatctaattctgttctacag
cgagcagcaaatgctttctcggtgtccagagaagaaaaattcaaatgtatacataaaatc
atacctgaagtactgtatcggtaaaacatttttattcttaacccttgtgctatccttaac
attgggagttgggtcatctagacccactagagagtgcgctgaacctttattcttcaatga
tttgtgatcttcactggtgtccatggattacatgaaatctttccacctttatccaccttt
gtcatggtaggaagaacacgtcaatgtaagggtggggtcatctaagatagcacaagggtt
aagggagcatcaactagacctgctgggttcttgttcttggcactttgatcgcctgctctc
acatgaaaaccaatgaaaggagtttgccagagatgtccagtgtttagtagaaactagctt
aataagatggttttcacaaaatatgtaaatccttcctttctgtagtgtgagaacagcagg
acaccaattctgttttttacagttgccgtactcacctgcctccatttctggtttgaattt
atcaggttgtgcacctgtcgtaccacaaggtgacagtcttgtgaaacatttgtgtcactg
cactagtatttaaaaactagacgaggaccccttaacccaggggtgtcaaactcattttta
ccgagggccacatcagcataatggctgtcctcaaatggtaaatggcgtaaacttatatag
tgctttctaccctctttcaaaggcccaaagcactttacagtcacagtcccattcacacat
gcgcacacacacattcacacactgatggcggctccgctgccgaacactggcgccaacctc
ccaccagaggcttcagtgtcttgcccaaggacacttcgacacataggcgtgcaaggcggg
aatcgaacctgcaatatgcgtcgaccgccctaccgctgca |