Species | Oryzias latipes |
Gene Name | Rplp2 |
5' Upstream | tcattttgaagtgtctcagaaaggcttttttgcagctagtttttgaaagcagtgctggac
caaatgtagaacaagaacagtaaaaacacaagcatggaaaatcaattgtgtatgtttgaa
accatgtctatgtaaactactgagataattactgctatgtgaaagaccatatggatacat
taacattgtgcacaaataaatcaaactttgaatccttaacaaatgaatgacatatgtaaa
tgcataagtaaataaaaaccaaacagtttgtttctttgtgtctgtgaaaattgactaaag
aaaggaatttggaactgtgaataattctgataaatgaaagtttactggtctatttggttt
ggcaaagatgcccttcctgacacaagcctgtgtatttatctgggcttgggacaagcagaa
tgagaccctggcttgggccccctcgtggctacaactgaaagattttgaataactttgtca
aaatcgtttttttttttatgtcaatcaccaagaactaatccaataataataattggataa
gttggaaaaatgctgttattgaaaacaaagtatgaactggttgataaataaacaatcctg
tttgacaaaaactgtttgacttcttttgcttcttacatccttatagaacaataaccttaa
taaacaacactgataatatcagttgctattttgtgtatttttaaatagtaaacaatatta
ccaaaggctgttaaagtaaatgaaattaatagtatttaggaattgtaacaagagctctca
ataattgttataaaaaataaacttaaacatttatttacatatttaaaaaagactttagga
gaatattaatcgtaatgagataccaaaaagcatcgtaagtaacagtacgtttaatttcta
ccatcacgttcaacgccgctaaacagtttgattttcaatttgaccaataacattgaggca
cggacttattactacttccggttccgcctctcgtcctctt |
Exon 1 | CCGGAATTTCCTAGCGTGACCGACGTTTCGTGTCTGTTTAGACTTAAA |
Intron 1 | gtaagattaagattattaatgtcgtgttgtcgtatttgcttgttttctttgtatattaat
ttgtaactgaaacaacactctccagttttgtgtgttgttgttgtggtatgtgtgtttgta
aatgaagaaaagatgtctgctgctagtagcagcagcatgtcgcgccatgctgcggcctat
catctcgcatgagtcatgacaaatgtcgcgcagttaggccttaaaaagctctgatatgta
aaagcaaaacgtacccaacttgtcattacgtcgctccttgtcacagttttgttggcgttt
gttatctaagtatgttttggttgaagagggggcgaagaaaagagaactcaagctaacacg
aattaaacctgacgactttcaaaataaaccgtagacgagtacttaaagtatgtgagcgaa
ccgtttgtaattttattcgtgtttgtaatgtttcttgttttttttaatagaccggtgacc
taagttttttttttttttcgtggaaaggaagggaggaaaaaaaaccccgaatttggaaac
ccaacaagnnnnnnnnnngtaaagtaaggaggtaaatatagcccgtaatttggaatccga
ctagtggccataataagtagtgacttacaaatcaatcaatatttacctttttttttttaa
agtattttattttaacgacgagaattgaattttacgtttgtaaattaattcaattttaga
agttgtatattgaggctgctttgtacattcattacacaaatgaaacttgtttaatattaa
gttgtttctagattcttgaaatcaaaaaaaaaaattaatgggtgattatacagtttgcat
agacttatccactcaattcccaattttaatgtattatctgtagcctttgggatttttgtc
attgtgttttttcttttaaatccag |
Exon 2 | AATGCGTTACGTGGCCGCTTACCTCCTTGCCGCTCTTGGTGGAAACACCAGCCCCTCTGC
AAAGGACATTAAGGACATCCTGGGCAGTGTGGGAATTGAGGCCGATGATGAACGCTTGAA
TAAG |
Intron 2 | gtaatagcagcttattgtaatgttcagtgggaagtgggaatttgattttgattaactctg
tcctgcaacag |
Exon 3 | GTAATTGGTGAGCTGAATGGGAAGAACATCAATGAAGTTGTGAACTCAG |
Intron 3 | gtaaaggctgcccccccccggtccatctctgtaaatgttttcctgtgtgcctacagcgat
gctttgctggttcattttggtttccatgtgaactaatgcttggcatgcacatagccttca
tatccacctttaccacttgccaccacacacaacactgaccacagtacaagttaatttttt
cccctctaatttgctattttgatttttaaaaaatccttttagaatgtgtgctttcgagtt
taaacttaaacgttttttttctttatttacaatgtgttacagttttttttcattcacttt
aagccgattctgatttgaccatacacatggaactgcatgctgtccatcgtttatagttgt
tttaaaataaaaagtgcactaaaaggtgtttttttttttttttaaaaaacttgcaaaaac
caaaaaaaaccctttcccctcccccaccaaatttggcatttttttaaattgggttggaga
attgacgaannnnnnnnnnttttttttaaatacatgtcaaaatcacaacatacacatgtc
cctccagcaccagatattgcatttattttaagttggtttgaggattgacggaaagccact
tttgtctttgcag |
Exon 4 | GCCTCTCGAAGTTAGCCTCTGTCCCAGCAGGTGGTGCTGTAGCAGCTCCTGCAGCTGCTC
CTAGTGGAGCTACTGGGGCTGCACCCGCTCCAG |
Intron 4 | gtgtgtatatagttttaaatcttggcacaagcttataaagaaaaatgcttttttcccctc
cattataattacctgtttgtttttgcaacttttatactgtagcaattatgtactattatt
tctaattattattagcaaaggcaaactgatgttttttttaaacttttatactgtagcaat
tatgtacaattatttctaattattattagcaaaggcaaactgatgtttttttttgttgtt
ttttag |
Exon 5 | CTGAAGAAAAAAAGGAAGAGAAGAAAGAGGAATCAGAAGAGTCAGACGAAGATATGGGCT
TTGGACTCTTTGATTAATCTGTCTTTTCTGTACTCAAAAAGCAATAAAAAA |
3' Downstream | tgtaaaatgtttacacagaaaacgtttgtcccttcttctgttcaaaattcttggtacata
gttttgacaacgccaggtaataattctaagagtgcccacatgtgtttctaatatgaagtg
ttggggggtgtttaggaatattttgctgtaagtagacattgtgcaaccaaaattgtgtgg
tcagtctgttcaccagctagctaagcttatataatgacagtggtggtggtggatggtgct
agctgagtgtcacaggaattaaaataatgacacggtggtcagggcagcttttccactttg
tttgcaatcaaatagcttcatccaaaagattacttctttcttaggaacagaccttttcat
aataacatggagtatcatggagaagtgtagactcagagcccactctttcattaatttcaa
gtatttatttgttaaattttacatcaattgaggttccagctcagaaaaaacaaaaaaaaa
acaggatttcagaaaattatactgtggagaaatctgcccaaattttgcaggacatgaatg
ttttaaaccaagtttcaccaactaatcatctactaaagtcaaagcacctgctcaggttcc
ctacatgtcattaaaatagttcagtttggttcaactgtcttagttgggttcaatatgggg
gaagctcagagtagaggaagttacttctttgaaaacaacattcggatgatctcaggagat
gggcaacaactgtcgggctcctcggatcaaaccacttctgagtctggggcaatggaggaa
atgtctcagctgggccaaggaaaaggactagcattggcctgtggtccaaagtcctgatcc
aattaagggagtataattaagaaaaagaggggtgaaccagcacaaacgtttggtgcaacg
accttttcgaccacattgtctttaactcatcagttttatgtgctggcaatattggcattt
ggacttgaaaatgatgaacttacaaactggtaaacaaaaa |