Species | Populus trichocarpa |
Gene Name | RPS13 |
5' Upstream | tggaattcattttttaatctcaatttgcagtcaaatgcaagttcacgtgaagaccttgct
aagtcacgaccatgttattatttgttgcatagataaaaaaaaagacattttattttattt
caagaaggtacatgagaatgtgctattggtttttttaaaggaattttttatttaaaaata
tattaaaataatattttttatttttttaaaaattatctttgatacaaatatatcaaaata
atttatttttttaaaatcattaaaaaatatgatttcaaccgtgactgaactctatgagat
tactgggctgatttctgaatgcatccaattctacaaacaatgctgtaatttggtgtaggt
tttatgggctcaaaaagcataacgtggttgggccccatttgatttcatcaagttatgggc
taaaatattgtcaagatagactgcattctaggagattgtaaacgacagctgacttgattt
ttaatcgatcacagccaacatattcgcttatatttctcactgcaagagtggattcctgta
cctcgactcatttcctaaatcaaaaacaataaatcagagacaaccttttcaagatttttg
atgttttatttaagaagaaacaattctaacacgatgaagttttggtcctgggattcctcc
gaaccaagtttaagttcattgcagctagagccatgacttgtcagtgctgctgctgctgct
gtagttaaagctctggagtaaaaaggaaaatattgtgccctgtgactagggttttgttct
taacaaactattaaacacaaagttacaaaataagattgtagtaatttcggtttattgcag
gcccaacccaaaataaccatgacctggaggctggaaagttccataaggtccaaaaaacag
aaacgaaaattccaaaggactaaacaaaagaataaaatccctacccccaccctcgttttt
ctttcactagggtttcacagggccaccaaggagctgagct |
Exon 1 | AAAGTGAATCTCCACAGTCGTTGCCATGGGTCGTATGCACAGTAAAGG |
Intron 1 | gttttttcctataccttgactgattccataaaacaattttatgattttcagtttgaaacc
taactcaagaacccatttgatttttttgtttatacag |
Exon 2 | CAAGGGTATCTCAGCATCTGCTTTGCCATACAAGAGGACCTCACCTAGTTGGCTCAAGAT
TTCTCCTCAAGAT |
Intron 2 | gtgagtaacccactaaaaccctacaagtttttcttacgcttttatttgtttttaatattt
agactatcttgtgtggtattttagttctttatttgatcggtgaaaactatggcttccttg
catacgtttcatggatgggatttctttgtttgtggagatttattttgttctttaaatgct
tattgaaaatgaatctttgcgcgcaatcgttttttttttcttcacaagagcagttgtttc
atctcgttactgaaaatataatctcatcactgaaagatcaggtcaagtttgcgacagtag
cattgcatcaaatgggaaacttttagtgaagtttatgtggaaattgcagtgctgggagct
tttacttttggccatcaatcgcaaccattggattgatttagttgttattcagacaagttc
tatgcgtttttttttttattatttgtttttgtcatggtcacttag |
Exon 3 | GTTGACGACAATATCTGCAAGTTTGCAAAGAAAGGTTTGACACCATCTCAAATTGGTGTT
ATCCTTCGTGATTCTCATGGTATTGCTCAAGTGAAGACTGTAACTGGCAACCAGATTTTG
AGGATATTGAAGGCCCATG |
Intron 3 | gtacatattttattcatgtactttttactacagtaatacactaacatttcaatgaggaat
gtctaacatcgttattgcatttaattgtaattaatatacttttgttag |
Exon 4 | GGCTTGCACCTGAAATTCCTGAGGATCTGTACCACCTCATTAAGAAAGCAGTTGCTATTA
GGAAGCATCTAGAGAGGAACAGGAAGGATAAAGATTCCAAATTTAGGTTGATTTTGGTCG
AGAGCAGGATCCACCGCCTTGCTCGCTATTACAAGAAGACCAAGAAGCTTCCACCAGTCT
GGAAATA |
Intron 4 | gtgagtatatatgtttctttctgcaatgataatttaaaagtgcattatattcagacaagt
cattattcattagcatggattcacctagcacaataatttggatcctaacatatgaatata
ggtggatatgtcaattactcatggaatggggcttgattatagcatggcctctacctaatt
caaggaaccactgtttatttttttcttttacattctaatttggagtgatgctgccctatt
ctaaactggcatgagttcatatgcaatgatttgagtgaatcaaactgtatgtccttaata
tcaaatgtgctaatggaattgggcacacaattgggtgctgactctgtttttggtcgttac
aattggtttttagcttatagattcaactgcattcatggaaacatatggctggaatactgc
attttcataagatctgcaatcgtttttcttcaagaatgacacaatcaaaattatcaattc
agattgattttgtgttttttcagcttgctaccatttcctggtcataaggtagcttgtata
ttgaaggcttgataaataattaatgtaattgtttttccctgacaaatgccctttctttaa
aattggtgattgaatcagcttataaaccctatctacagttcatatcctttggtctcatat
ttgtagatttttatcatgtttggctgtagtgctgattgagctcctcttttcctgcag |
Exon 5 | TGAATCCACCACTGCCAGCACTCTCGTGGCATAGGCAAGATATCCTTGGTTTTAGTTGTC
AGCACGTCCTTGAACTCAAATCTTGGATGAGCTGATCAGCATTTTGATGCTTGCCGATCT
CATTTTTGTAGAACTTAATTCATGAATATTGCGAGATACTTAGTCAGAATGTT |
3' Downstream | atcctcaatgtttcttaatttcagcttctggttcgatgtcttttatgttgcaagtactgt
cgggattccaaatttgaatagatgctgaatttaatcgttgtcaacttgggcaaattttgt
gccttgttgtcaatgtggaacaaattttaggtttgaatttgcggttcttgcctggaaatt
taaggctaggagctacacgtgcattttcagattatcgaatgaaaagtagcctttgtttct
taccgcaagtacttcgcggcttctcagtttcagtgaaagataagtgttttaactgaaaat
tattttgcttgttggaattaagcacgcctttaatcttaccaaaactattatttaagttgg
tgaccaaaacataggtgacctgcggtaagttttaaaaatatttattttagttttttaact
taaacaatcatataaattatataattaagtgtctttaaaatttttctaattttattttga
tacaaagatttatttttattattttttggtttttggttgaaagaaaggtgagagaaattg
tatattttagtggtagagagagaaacttattattgacatcatttagatcactaaaataaa
agatttttgagtcaaattgtttcatttgatgtggagagtttatattaaatgtttttattc
aaagtttgtgaaaaaatagatccgaactcgggttgatttttgatttcgggttgagttcgg
tttttggagcggttttttgaggttatgaatgagtttttcatagtttctaaggtgttttgg
gtaaaaaaaaaacgtgttgcaaaacaagtttttaagttaaaagagcatagaccttaattt
ttcagtcactatagtagctgaaatctggataaaacaaacatatcatttgcctcgacaggc
aacgtgttgtatgttgccggtatgactatcatatccaagattcttggatctggcatgatt
gcctatcccaaggcgtattgagtctgacatggtgggtctg |