Species | Populus trichocarpa |
Gene Name | RPS15A |
5' Upstream | caaaggagtcaccaagaggattaaaatgtcaccctgtaagctactatttgaccactaaaa
aaagctgtatatgcccactcaaacacaacaaacaacattaacgcattgacgtgtgcatta
gctatttttttgtaataatatttattatatagtaaagtacaaatctatcccctggtatac
ttgataataacaaaaaaaaccataataaaatgacaaaaataactctggaccaaagttaaa
gttttttttttaattcaagagcaatataataaattcaatgtgcatttaaaaataaaaaga
aaaaaaagcctttatacaccaactctaattttttttgcatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnca
tctaagatctttttaatttattaatttttaaaatttattttattaaaaataagcattatc
tttttatttttcaattaaaaaaatcatgatacatgaaaatatatctataatattgatgtt
ttttttgttacaacttttgtattcgtcttttattatcccatcctacctcgtctgcttgca
tctttttcataatttcatcaaaatttattaaacgagagaggaagttgacactttctatgg
actctagataatatagaattacgaatattttgcgttttctttgagtttatatatatatat
atatatattatggtcataaatattattttcaatataaatatgttataatacatgtcatta
aaggtataatttcatttttaagcgatttatgattttcacaacatgtccttaatctatttt
cttctaaagattaataaaaaaataaaaaaagagcttacgagacgggctagaatgggtttg
tatctacgatgccaacccattcgtgttatgatggacttgtaacagaaagcccgaatacct
aagcctcatttaaaaccctatttctcatcaacgtttcaca |
Exon 1 | GCTCTACTTCCACTCAAAAACCCTAGCTAGGAAGGCGCCTCTGCAGATCGCTCTCTGCTT
TTGCTAGCG |
Intron 1 | gtacttcttttattcttttctttcttcatatgattttgattttccgtcatctatgcttct
ttcgatctgttctcatcaataaatcgaatgtctctttcaaagaaatctatcatttttttt
ttaatttctcactcatttttgctcaaaagaattaatcttgactattgattcttataagct
cgtgtatgtttccttgcttcacagtccggagctctaggtatggatatggtgatttatgtt
ttgtttggttgctgggaattgaaaaaaaaaagatgaaaatattgaaagcagtcctagagc
ttgatttgattggtttggatatagctacttgataggtgtaacttaaaaacaatttctcta
atgggtttactatgcttctgaagcccctaatggagtcgctgaatggctaaagatattaat
tgttcagattagcaaatagcttgattcaaggttggctgataagccgcttatatcaagaaa
aactaggattttatggtggggctttgttcatcctctggccttagttgaataaacattatg
tcgagtggaaaaccaaaggtcgtgtagccattttggttttagaatgttaatttgtattct
cttagacatcgtttgctagttgttaacaatttttcttaacatacatgtttagcagc |
Exon 2 | AACAATGGTGCGAGTCAGTGTCTTGAATGATGCTCTGAAGAGCATGTACAACGCAGAGAA
ACGTGGGAAGCGTCAGGTCATGATCAGGCCTTCCTCAAAGGTGATCATCAAGTTTCTTTT
GGTGATGCAGAAGCACG |
Intron 2 | gtacaatgtcattttaaccagaattctatttctagttgtgtaattactttaaaccagagc
ccatagtttgtttggttttactgcag |
Exon 3 | GATATATTGGCGAGTTTGAGTTTGTAGATGATCACAGGGCAGGTAAAATTGTGGTCGAAT
TGAATGGAAGACTGAACAAATGTGGTGTTATCAGTCCACGTTTTGATGTGGGTGTCAAGG
AGATTGAAACTTGGACTGCAAGGTTGCTCCCTTCAAGACAG |
Intron 3 | gtcagctccaaactttctattcagttcaaattcaatttgtagattcagcttcttgtgtga
agtttgaatggtaagatattgtaagcttatgaatggatgttcagaatcatgttgtttaga
gtttactgtctgccaccaagtaacctcctttcagctttataagtttataccaacttcaat
tttgtcagggtgttttaattgcatccattttcatgaaatatgttgctcctgtttagaaat
atttgttcatctgagtaccgaattagttcctcatggtggaatatcttgcatgacctcaca
ttattggctgaattttgcag |
Exon 4 | TTTGGATACATTGTCTTGACAACTTCTGCTGGCATTATGGACCATGAAGAGGCCAGAAGA
AAGAATGTTGGTGGTAAAGTGCTGGGTTTCTTTTACTAGGATAACTTTAGTTGGATTGAA
AGTGAGTGAACTGTTCCGATTATAAGTTTTGGCTTGTACTCTGGAATTTCTCTTACAATA
CAAGTCGTTCTAGGCGTTGCTTTATCTTATGTTTTTTCCTTGTTCTGATGGTGGTTCTTT
ATTATTTTAAGACACTGATGTTTTTGTAGTTTCTGTTAATCGAAAGGCAGCTTGGTTTTG
ATCATCTAAAATGCCATGGTCCAA |
3' Downstream | cctcattccaggttgaaattacacttttgaaatcaatttttcatcattaaagaatacttt
actgaactaaaaatgatctaatatatatatagttttcactataaaactcaagatttgaac
taactgttcctgttcaaagaagattacttttgttttggtccatatgtgatcgtaatacgt
tttgaaagaaattgacaaatgctctccctcatctggagaagtaatctggaccatgaccta
tactccaatttttaaataagcactggatggatccgcaataaactgtgttcctttaaattt
gggtttttttttttaatcgatttttcatagactaatatgaaaaataatttttaaaaaaat
aaaaaaatattatttttaaataaaaaatattacaattttaaataaaaaatattttaaact
gtaattattacaattttaaacagtccaaatacaacgaaggctacaaataatgctcatcac
gctgctaaaagtttggctaggatttgtttgttaagactaggagccgatatgaatctactt
ttaatctcatgttgtgtagcttttatttttctattttttatttaattatagataaaaatt
tatttggttagttaaatattttttgtattttatactaggcctaatgtataattgcatttt
aaatcttgattttataaaagttaaaataatgtttttttgttaatgaaaacttgcttttta
atcattttacatataaaaattcatcctataataattttaactaaacatatttttttaaat
ttatttttaaaaaattacaattttttttaattttaaatttacttaaattgcaactgcgaa
aaccaccaaattatcaaaccctataagccaggactcaatttgcattgctttttatatata
tatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatataattgtgcaac
ctatatcgtcaacaacttccattaataattttttaaaatc |