Species | Populus trichocarpa |
Gene Name | RPS25 |
5' Upstream | gatttcaagtttgatcctctccttccttttctgtgctataaatccatctctttctgtgct
tgtaagaatgatttccacgagattgagggttgacccatgtggatttacaattagattatg
aataatttaaaacttttttaacgcgaaatgtaccatcaattcatgatttattcttcagat
gattctagataagatttcacaaaacacgtacaacaacacttctgaatttaatggtaaatc
tattcaggtattgcacttcgttatcggtctcctccttcaaaatcttcttccaacattatt
agtaaaatcataattattaaatttagtttagtttgaaagattagctttagaaactctgat
tcaaagtttgacctgaatcaggtttataatttaattaaacataatattaattaagttaat
tttgttctattgagttatgattcggttgacctgtcaaatataaactaatataaaccagat
caataataataaatataaataaaatattatctctcagaccgcttaatttaataacttata
aattaactcaatgtccgaataatttaaattcattttggattattccccgtgttaaaatta
aatttaatgaaactaaaattcaattctagattctagaattattattatctattatatctt
ccatctaaatcacttattcaactaaaaagttggcatgaatcaaaaccaccaccgagcgaa
atttccataaaaatcttaattccctaaaaatactatccgaaatcacctttctaaagatct
aggattcgcccatttgaattttgaatagagtgtttggggagtttttaaagtgtaatgaaa
ctagcagtgctcaaggatatgggccgaaataaacttggtcatgggcttagcactggatta
aaatagatacgttgctttctaacaaatagcccatacaggccttttaacacaacttgaaac
aataaaagcagcccagtaaacaaactgaaactccacgtcg |
Exon 1 | TCGTTTGAATCAACTTAACTTCCCTAGAAACCCTAGATATACTACTCAAACAACAGCAAC
ACAACGCGTACCCCGCAGCAGCAGCAGCAGCAAACCTCTTCTCCCTTTCCTCTCACACAA
CATCAACAAATCCAATG |
Intron 1 | gtaatcctctctttctcaacaaaactatccaaatctcaacaatcccaattggattaacgg
tttctctttttgtttgtctgtag |
Exon 2 | GCACCGAAGAAGGAGAAGGCGCCGCCACCGTCATCAAAGCCAGCGAAATCAGGAGGAGGG
AAGCAGAAGAAGAAGAAGTGGAGCAAGGGAAAGCAAAAGGAGAAAGTCAACAACATGGTT
CTCTTTGATCAAGCTACTTATGATAAGCTTCTCTCCGAAGCTCCTAAGTACAAGCTTATC
ACTCCTTCTGTCCTCTCCGATCGTATGAGG |
Intron 2 | gtaataatacattttactacttttttcattcaagcttacggctttttcatgcttttagtt
atgtcaaatcgtggggttttaattttattttttgtttttgatcatgttagaatgtttcga
ttactgggtttaggaccaagtgcagtaacaatgtacgagtaatactagtttcacttataa
acgtccgaaaggatctcaaccgttgaatttgttggatccacttgtcaattgaagaggtgt
cttttattggaagaatctctgtaatattagcattatttcaaatatatactcaccaaaaca
attgtggaacctatctgccgtcagatggcgcgcattttttgctgccaggtttcaggggat
gtagcataactttaaggaatattttagctcttcaagtaaagtttctaacttggtacaagc
tgttgccattctatggaagataaagttttagctgtctgtagcaatatttttaatagttct
tgtaagttgtggtaacgtggtggaagagtttgagagaatgttttaaatatgcttaggtaa
taaaagattgaagttacttgatactatcatgaattagattgttgttttttaggtatttag
gtcccttattttgttgacatcgcaatgtcacttctggtgtgttgtatttagttttgacaa
ttagtcagcttaccttttgtctatttctcgtatgcttttttatgtcttggatgttttcga
gatctagtgagtttgcatttctgtacctaaaaagtttctgttctatggtcattgtactgt
tttttttttttctttcctactggggttgagaatctgtaaactattatacatgccttcgtg
tgttataccctggcattgttttgttaatgcattttcattagcttgaccagtactgatacg
actctgatttcatgttttatttaaatttgtgtacatgtttcatttgattttgtgttttaa
tgtatcttgcag |
Exon 3 | ATTAGTGGATCACTTGCAAGGAAGGCAATCAGGGAACTGATGGCTAGAGGTTCAATTAGG
ATGGTCTCTTCCCATGCAAGCCAGCAGATTTACACCAGGGCAACCAACACCTAGGTGTCT
TGATGTATTTGGTTATTTAGTTCTCAGTAGTATGTTGCCGAGTTTCTCAGCTACTATTAC
CTTTTTGTTCAAGTGATTGTGAGTACAATCTTAAGACGTTTCCTTATCTTTTGTGTTGAA
TGAATCTTTTGCAGAGTTCTTGAGA |
3' Downstream | tgttggatatgtatcttgaaaccatgttctcccatgtgacatgcatttccttgttccatt
ggtttgggtcttttgtgcatgacattgcatttgttgccttttgttttgagtttttttggt
tgtttgtggatgaagtcgcccatcgttggtttcagaaattagttgggtttcgatcagaca
caaatttcttggtgcttgttagactgcccatttgggaagcatgtttttgtgccagcctat
agcgtagagtttcttgattttggacatgcaattatggagtataaagtgtttcgtgagttg
acttgtagaatggtgttggttgccccaccctcctggttcattggattaactagtaatgta
tcaggcctaattccatttacctatcgataagtaaaatgtcgagtaaaataagggcttgcc
aaagggttttttctcacctagcgtaggttaatttcccaaagtcaaccctcttcacaaagg
ctgttcaggagaaaggaaatgattcgtgctgcttcggattgattccgaccattttccatc
cttgaatcaaatgatattactgaaaatctgagagacctacgatctccttccacgcattca
tttcctcaattgtttaaagaacatcccaacttgaccttaatggcccgggacagttcgagg
atggttttaaatggacatgcatgaaaatgacaattaaacattgaaattttcaggattggc
aatgctttattttctggctcttctcttcagggccccggtgaattttcaattcagtgtggt
tgagatggtggatcaagatttgatatcacccagagaacccaagtgggtgacttgttctcg
taatttactagcaggccacgtgaaattttgtcacttagcattatgcatttagcttttgct
tgtgtattcttgtttttttttagtgctgcctcttttctttaacagtcgcagactgcgact
cgaataaaacatgactgggttccttcctgtcatcaatccacaccacatccatggcgttcc
tgtcatttgattgacgattccaactgtggaaatttaaggtgataaactttaacctcatct
ggctggtttttcttttcctcttgcctggtcttagtacaaatactatgagaaaagggaatc
gttgagcatatatctcgtgtagttaacatgtcatatacctgtatagagaataaaatgaag
atggattcatccttttattatctctgcgtgtacattttgtcgtgtattaccatcgtgatt
aaggaaaatatactggcaattattattattattatcaaccaacaggtctatatctttatt
tttattttatttctcttaatggaggaggtaacttcctggataattaaatacatttaacaa
gctttctcagtgtcttttacgctaattaagtcagattttccattattatgctagtcacta
atcgtttaaaaaaatccaactccccgactgtttgaccattattataactgtagtgtacgt
cattatatcagacaattattacattcggaatgcatttcaaagaggttaaattttgatcac
cggacaagttgacaagataaaataaaattcaacttgtcaagaccactgttttttttttct
aaaaaactgtactaaaacaacattattttaaattagttatttaatctgtgttttgctgcg
agtaagaaattgttttagtaaaagaataaatatataggtttttttaatgtgtttttggat
ataaaaaattcataaaattaatgttttatcaagagacaactataattaagatatttaatc
tcgtaacacaagtcaagtgctcaatcacgttcaataaacatgtttcatggaataaatatt
tttatttaattaaatgattattcatgtcaatgaaaggtaaaataaaatggttaacaaaag
caaataaaataaaactataaagctcaactataaaacaacctagtattaaataataaaact
tttaaaaaaaataacttgaagagcacaagttgttcatgtgctttcatgtgtaatgcaaac
gtcaacatccttttttttaataatatttgtatatattaaattacacttaaaccaacctta
caaaaatatcatttcacgtgagctataaaaaattcattttcaagggaatgtaagtcattt
tattttccatcaaaaataaaaaagacaaatgcccctaaatgtaagctttaaattttcttt
aatcctaagaccaaaagtgtcattttagtatgcacaataaaaataaaaggatgcaattgc
tccttttaaactctggaatgtgaaatcaatcattataaaattattaaattatctccgata
acatattttattggatttgtttttttaaaaaagaaataaatatcaccccaaagttataat
tttttttttccattttggtctttatttttcaatatacactcctaaaaattttagcctata
atttggtcgtaataaaaagaaaaagaaaaggaaaaaaaaaaaacactgtaagcaatgcgt
tttgcacggtaaattcccccacacgttttagtatttcttacaatagtaatgtaaataaaa
ctgagacaagtgtgcggccaagaaaacagcaggccctattagactcgtgtcccctgtcca
ctgctgaagtcaaatgacccatcagcatcttgtgtctgtctggatgcatccttcattatt
attattatttcattattttaatcttagccatggtcgatgcagtcactgaaccacaatttg
ccaatcaatccctttcgccacctttcactttctactttagctgcatccatataatgcacc
cccctgttgatctttcctgttgatttttcgtgccttctctcgtcagatattagctccgat
ttgctaaccagcaaatcccatttcacttccatgtcgagtttttggatttcattgccttgc
atgtatgattattttctctttatctcatgtgtaagtttgatttcaaaacaacaattttac
agggaagcctctatttaaattctgaatagtcgagaccctttgatttctgagattaggaga
agatacatttttttttaataattatggatgtccggaccagtttatgcgtaccttaactaa
ttcccgagaccctgaagttaacgaccatgtaagtcttcagtgaccctgagatctgtggca
ctcgaaccggtgatttttgagcagcaaattcatagtctaatcagttgagctacacccctc
cgaattattaggagaagataatttatccttattctttatatttataatccattatattac
tgtttgatttgattttatagcggcggttattttttaaaatatttttataaaataatattt
tttattttttaaaatttatttttaatatcaatatattaaaaccacatcaaaatattaaaa
tatgattgtgagttttttatccttattttttatatttataattcattatattattatttg
atttaattttataagtgtggtta |