Species | Populus trichocarpa |
Gene Name | RPL7A |
5' Upstream | aaccattgtttactgttaataggacctaccagaatttgcaggcgcgtctgcgtgccgctg
aaagcagctccaagttgcttcaacctgtagacaatggagagtttcactacccactgttct
ggcccaatattgaatcgggtccgacccaattaaaaaaaattatgttatttttattttaat
tgtgttttattcgaaaaactagtgtttaacattattttatgacactacataaattaaaag
gagatcgcttgatgacgtaacatttgcagaatttgatcgcaattccaattttgttcataa
tgatattgtacctgatgttgttgcgcgcttatgaaaccaataaaactatagatagtttaa
tggaacaataaaaaatattttatattaagtattattcatttcatgatgtaatagcaatag
ttaaatcaaaaatatttaaattaaaaaccatcaatattaatatatgtcttttttagttat
tttataacctcaatttgaaaagtattcttgtaaccaaacacattaaatttctttttgttc
aactacagttttaacaaaacatatattttttcaaactaacctcaactaaaagtattttta
taaaataacttttttcaaactacaatcacaacagttaccacaataccaaacacactttga
cagaagttagaatttctaaaagttaggaaaaaatagttttttttgttgcaaatttatcta
tatttccactaattctaaagataaattttcccacttaatctattttttattaaaaccagt
ttttaatattttcccactatttaaaattaataaagataagaaaagttttggattgataaa
taaaaaactagaagaaactaggactatacttagataagtaaacagtatagtgacaaaatt
gaaaaaacaatttttagggtttgggaggcctatgggcttagccttactctctccagtcca
cgtaacaaagagaaaataaaaccctaacaataaaaggcaa |
Exon 1 | GCCGCTGCAGCTACTCTTCCAAGGTCTAAGGCTCTAACCCTTCATCGGCAGAGAACTACC
AGGGTTTCTCTCGATCTCCTCTTCCGCATG |
Intron 1 | gtacgatcttcacttcttgtatgcccttttcatattttcatgcatattatgttccctttg
ttctgtttggtttcttttgtttgtgaaataaatggtttattttttatggattttgttgtg
tgtgtgtgtgtgtgaatggagactctgtcatttttcctctctacgtggtatttttattct
tagtgacccaacagcttaaaaacctgcttcagtggtgttttgtttgtctgttgacagaac
tctttttttttttttttttttttggggggggggatgacagttcatctgggtggataattg
aaggtttgatatcagtgtatatgtagggctctttatagtggcaatgatatgatttagata
ttggtgaatgattgccaatttagtaatgaatctgcaattgatatgagtagccccagataa
gctatgtctattggcttaccatcgcaaccaatgcagagctgtagaagtttcaagatggga
ctgtaataaaatgcagtgtactggttagaagttaaactaaaaacgttgcatactactcat
ttcattttttagatggattttcaataagctcgggagcattatgtactttttgagaagttg
gaattctggtcattgtgtggaacagttgtttgtatttacaggctccagacaaagaatata
atctgttgcatgatcaataatgtaacattttgtcatgtaggtcctgctgcttttttatat
gctgtatgaattactactgttcatgcctcaaatattttgaaatggtgtattgattaaaat
tttcattgaaaagtttgtgttcttagtgtttctatccccacttttgattcattagcttgt
ttatgtacttactacag |
Exon 2 | GCTCCCAAAAGAGGTGTGAAGGCCCCGTTAGCAGCAAAGAAGAAGCCA |
Intron 2 | gtatgtctcctctctctctcactctctccattatatgcgcacacgcacacacaaaataag
catgtgcaagtgaaaagaaggcagtttaatttcccaagtgtggtagagtctttcaattct
tgggagtgttgtctacaacatttatctaagtagttcactgactaacctacttatagttta
gtgtgtaatggatctatattcttccatggaagtccctgttatttcctttttgaattttgt
agctagctagatatggctaatgtttgtctcaactatccccttaatcttatgcaattgcat
atatgaaattgctaaaagttgataatacaagttttcatagattatgcccagttcttagaa
ctcagatttgatgaatcataattctgcccccctgtcaattttggggccttatgtgctcta
cccttgcaactaaagatttggtgcattgatgctgattaattacag |
Exon 3 | GAAAAGGTCGTAAACCCTTTGTTTGAGAAACGACCAAAGCAGTTTGGAATTGGTGGTGCC
CTTCCACCCAAGAAGGATTTGACTAGATTTGTCAAGTGGCCACATGTTGTTCGTATTCAG
AGGCAAAGAAGGATTCTGAAACAGCGTTTGAAGGTTCCTCCTGCTGTTAACCAGTTCACA
AAAACACTTGACAAGAACCTTG |
Intron 3 | gtaaattttctattcctgttacagggaacttgacaaaatttgatgctaaaaatcacagat
gcattgttatcgatattgtagtgcattgatagagttcattttaactactgaaactgcaga
ttacttatctggtactgagatgtattttttctctcgtcattttgtgttacag |
Exon 4 | CTACACAACTTTTCAAGTTGTTCCTAAAATATAGACCTGAGGACAAGGCTGCTAAGAAGG
AAAGGCTTCTTAAGAGAGCACAAGCTGAAGCTGAGGGGAAGACTGTGGAAACAAAGAAGC
CTATTGTTATTAAATATGGTCTTAACCATGTTACTTACCTCATTGAGCAG |
Intron 4 | gtacagatgttgatttctagggctttcttgattaactatgtaaatatttaggtaatggat
gatttggtgatttgtttagctagtttgattgacctatatgggagttgtgttataatcatg
attgtgtaggagaagatggctttcaatttggttttctaccttttcttctctcactctctt
tcctctcatttcttcagttacttggctgattttgctgcacattgattttttatctccctc
gtttattttttgggtgccttcctttcaacatttttttttgtttgtttcatgttgtcatct
gacttggatggtgaacatgcatggcagattgatgtgtttttgtataggttatcttatctt
tttcctaagactctacttgattcatatag |
Exon 5 | AACAAGGCCCAGCTGGTGGTTATCGCACATGATGTTGATCCAATTGAGCTTGTTGTTTGG
TTGCCTGCATTGTGCCGGAAAATGGAGGTTCCTTATGCAATCGTGAAGGGCAAGTCACGT
CTTGGAGCG |
Intron 5 | gtgatttctctacaccttttctatgcattaaaagaaccattgatttttttggaaattgga
tcctccggtactatctttatgacttgtatgtttaaaaaacag |
Exon 6 | ATTGTCCACAAGAAAACAGCATCAGTTTTGTGCCTTACATCAGTGAAGAATGAGGATAAA
TTGGAATTTAGCAAGGTTTTGGAGGCAGTCAAG |
Intron 6 | gtaatattactaccatgtttttgcactttatatgtgatatctctaaagtgcatcccaaag
gagaaaaaaggtgtttcaatttcatatttgtaatcctcctagaagattagctttatgtca
caaggagaggcaactggtccttgatttgcttatcccacagtgaacttgtttgttctaaca
gcattgcttttgatgcttgtgtggtttattgattgaggtggtttctttctttgatttgat
attctataatttgttggccactcttttgaacttcattcttctttgcatatttcactttcg
ttccctttaactgcag |
Exon 7 | GCTAACTTCAATGATAAGTTTGATGAGCACCGAAAGAAATGGGGCGGTGGCATCATGGGT
TCCAAATCTCTGGCTAAGACCAAAGCTAAGGAGAGAGTCATAGCCAAGGAGGCTGCCCAA
AGAAT |
3' Downstream | gtcttgagcttcttctagcaagctattggagataagttttagtcagaaaggaacttccgt
ggatgattttagctcttctttttcccctgcaattgctctgtttgttgttgtgaacaagtt
ttgtattgattgggtagttaaaatattatcatgagtaacatttatagtttttatggaaag
aatgttttctaagtagttttttcccagtaatttcaaattaaaaataccttttcaaacaca
aaacgttcacctttttcatctaccctctcactcaatgcatggatccccggtttagatcac
gttaagccacgctgatgacttctttttgcgaaggcccatgtgtgagggaaacagttaaat
cataatgtcagccacattttcataggttaagtttttcgggtggcttttttccagaaatat
tgtcaaggaaacaggaactgtcaacaagaattagcaaaatcaccatcttaaagttcaaca
aaaaagagatattagaatagaactatatgaatttttattattgttaattatatatgtttt
atttaaaagtagatgaaatagttttattccgtgagaattatatgaaaattggcatgaaaa
tatctttattacttaaaaagtaatatgatgttgtcaataataatcatttgttcctaatgt
tttctatgtcatgcatgttaatattgcttgttgtctttatcatatcatgcatgcattatg
atttatcataaaaaaaagttatggattctactttcacattaacaaatagaaatatttttt
ttgtaataagaagaaatgatttctgaattaaaagcaaaacaatcaagattgttaattcaa
tttaattacacatgtattttaaatagtagaattgaatttaattatgtgatttagtatttt
atttcaaacataaaaattataatagattattaattaaatttaaattatatatgaaattaa
atttaattttatatataatttggttccaaacaagcaagcaattatgatttggaagtctat
tagttgagaacaagaagaagaaaaacaagaaccaaattatttaatttttttaggttgaaa
gtgaagcacattgtatatatgagagtcctcacggatgcagatttatgtgtgaccaagtga
tttcataatgcaaatctcccaacaacagagtgcacaagtatttctagagctaataattgt
cattgactaaaaggagtaaaaagacaactagatctttttgtccccactatactgtatgtc
aagttaaatttttcctgacataaaaaatatatattcaagaaataataacctaaatcaact
cgtgttaacttgtctagcacgtaacttaagatatgaaattaagatatcctcgtagaaaga
aaagtaacaaaaatcacaatactcaagggctaataacttaatttcaaaaaataaaattga
aaaaaatcaatttcagaaaagaaacttgaagaaaaaaactcgagtcaacccgagtttact
ctactaacccgccactcgcaatatgagatcggaataaaaaaaatttaaaaaaaaatgaac
tagaaaaaaggatcaaggataaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaactaaaaag
gattgcgaagcccaattctcaagtcaacacaattctgaaaaaaaaaaatctaaaaacatt
gacaaaagaaattattcgagtcaaccctagttaacttgcaaaacttacaacccgagtgat
gagactgtaataatctcatagaaataaaataaaaaaataaaaaattcaattctcaaccaa
caaaatattcaaggatgaaattgaaaaaaataataataattaaaaaagaccccaagaaga
aacgccccaagtcaacctagctcaaccttccgagcccgcgacctaggtcattaaattagg
attttcctataaaaagcaagttgaaaaaaaagactgacgctcaatttctaattagtcaaa
taataaaggatgaaattcaaaaaaataattcaatcaaaaaatcacctaaagaaaaaaaaa
atattaaacctaattccaaatcaactcaatgtcaaagaaataaatcgagaaagaaaatat
taaattagaaaaaaaaaaaaaaaaaggtgactcgagtcaactcgggtacacctgccagac
tcgagaaccacaagataaacttgtagaaaacagactgaaaaggattgtgaagcccaattt
ccaaatcaacacaatgccaactggtgaaattgaaaaacaattaatctaaaaaaattaaca
aaagaaatgactcgagttaaccttaattatcttgcaaaattcatgatctgaatcatgtga
ccatgataattctataaaaagaaaaacataaaaataaattaaaaataaattccaaacgac
caaatattcaaggatgaacttgaaaaaagaaataataaaaatgacccaaacagaaaagac
tgaagtcaacatgggttaaccttccaaacctgcaacccgggtcatgaaatcgagattttc
ccataaaaagaatagaaaagacacaaatgaaaaaaaatgagaaccagaattaagagagag
aaaaaacattgcacaaaa |