Species | Populus trichocarpa |
Gene Name | RPL11-1 |
5' Upstream | aaatattaaatttttattttcattgaactaaaaaattttacaaaacccaatatcataact
attataaaataatctaaaccaaaatttataatagttttgtatttatcataatgtaactat
aaaacattgcttttatttcattcatattaaaggtcatcataaaaaaatctacttactatc
tctaaaaaaaggaatagcattttataataaacttttaatagaaaaataaatttatgacat
tgatcaaatataaataaataaaataagataattttagagtttcatgttactaaaagtatt
tgtatttcacacatcgcatagagtatatattatgtcttttttttttctgtgagaaaatgt
caaatttttaatttgtgttaacaaatgttttcttctccgttcatcattgtaggcgcattt
taaaaataatgttttgatgtgttaatgtaaaaaataatttgtaaaaaataaataaaaata
ttattttaatatatttctaagtgaaaattacttaaaaaaataactgctaccataccccca
aagattttcaaaaaacaaaattaaatggtttttgtaaatatttacatggaggactatatc
cataaaattataattcactgcagttttaccatctaatttttcatgtaggaaatttgcaca
tacgccagcacttttaattcaagtgattgtgtctattaagatatatatagtagtggacga
agaaagtccagcaatccgttgtagtctagctggtcaggatactcggctctcacccgagag
acccgggttcaagtcccggcaacggaatcttgatttttctattttatctcaatcatggaa
gggtaatatggtcacttgagtgagcaccctcaaccgggcaggcaagcagatcatagcaca
aaaccctagtggttgtccctcacttatatttaatcttcttgtagaaacaaattccacagc
ctttcctcctcctcctctgcctccatcgaaccagccaagc |
Exon 1 | TCACACACCATCACAATG |
Intron 1 | gtattgttattataattctgtactctatcaaatctctttctacagatgttgttaatgaat
ctctctaactatttcttttttctaaaaataaaaataaaaaaagcag |
Exon 2 | GCTTCAGAGAAGAAGCTATCAAACCCAATGAGAGAAATCAAGGTCCAGAAGCTGGTCCTC
AACATCTCCGTCGGTGAAAGCGGAGACAGGCTCACCCGTGCCGCCAAGGTGCTCGAACAA
CTCAGTGGGCAAACCCCGGTGTTCTCGAAAG |
Intron 2 | gtgcgtgtcattctaaaccctttttttttttttttttttttccttaaagtgcttttgttt
tagttgttggattgttttttactgtttttttaatgagcag |
Exon 3 | CTAGGTATACTGTGAGATCTTTTGGGATTAGGCGTAATGAGAAGATTGCTTGCTATGTGA
CTGTGAGGGGAGACAAGGCTATGCAGTTGCTTGAGAGTGGGTTGAAGGTGAAGGAGTATG
AGCTTTTGAGGAGGAACTTCAGTGACACTGGTTGCTTTGGTTTCGGCATCCAGGAGCACA
TTGATCTTGGAATCAA |
Intron 3 | gtgagtcttttccccatatatttatggttacttgttgtaaagattcgcataatggatgtc
ttttatccctctcttattttgaattatattagtattacttgtgacccagttgaatatgag
gcttgaacattatgccaattttgaaggtttaggctagaatacttgtggtttagatggtgc
cactagtttgctgaaatggggtttatataatgttgcaaccatggcgcatgaaacatggtt
agctttgtttgtggattatcttttttttttaaatgtggacacagttctaggttaggtttc
tgattttttttgtaactcgtatttaaatatgatttggcaattctagacttaaatggattt
tcaagaggtcttttattgtgcatatacgctgaaggaaaaattgtgcttatcctgatgctt
gggtcatcttttggatttttttgatgttggaatgaagatagacgatgtggtggatggaat
attgatcttgaagataacattcatttaagttgcagcagcactcaagggtcaagttatgcc
atattgttagtgctagtttgttttggattaattttttttccttcccatggagggatccaa
gaaggataatttggtgatacctaactacctgtcttgcaacacagttatgccgggctcctt
ttagctagcattggtataaaccttgtgattccactaggtagtcacattggcgggacaggg
tttcttttttaataacttgacctgtttctgtattgtatatgctcagcataatgttttatc
atcccttctcag |
Exon 4 | GTATGATCCTTCCACAGGTATTTACGGCATGGACTTCTATGTCGTTTTGGAACGTCCTGG
GTACCGTGTTGGTCGTCGCCGCAGGTGCAAGTCACGTGTTGGTATTCATCAGAGAGTTAC
AAAGGATGACGCGATGAAATGGTTCCAGGTCAAATATGAAGGAGTCATCCTTAACAAATC
CCAAAATATTTGA |
3' Downstream | tcttagatcttttcctgactttttttaagtttaaagcctgggaagtcgttgacctttggc
aggtttttatgtaactggagttataattttcatctagaatttcttgaagtggtagagaat
ctgaagttctatgtttttgtgttcttgtgtcactgcttgtgtttttatcaatataattct
gttcgattatgcagatatcaagtatccagtattcccaatcaaaatcaatgtggtttgttt
gtctataataattgtgaactgagctattgtagatgccttgtaggccttaccatttggatt
tggaatgcaatcgagttgaattgggtatgcaaatgtttatgttttggtcttacctgggaa
gaattttattgataatgatattgaaattgtcttctggattgggaaatcgttgtagttgaa
atcaatttatggcctcaatgggatttcgcccgtttttatattatgtttttatgttagatt
aggaatcaaatccaagaaattaatgttatgtgaattatacatacagaaaaaaatatgatg
taaattatgccttcagagtagtagattgatattatataaattatgcatttgaagtagagt
aaagatattaaatgaaaatatagaaaaaatgatatgaaaaggaatatgttttttgtggca
ggaacttacatgtgtgaaatgttaaattgattgcaatgacgtgaaaataggattaatcat
aatagtgagatttactccaagtgatgagctagtgaatcaaagggctaaacaaatctatga
agtggatcaaagtattgagcttagtgtaagaatgaaactaaaaaatccatatatacaagt
aaaacaagagtcatgaatattgatttggatttgatgaattcaatcataaaattgtgttag
atagggaaaaagattgggtaaaaaggtggatactatgataataaataatttttagatgaa
catatgtaaataatttttatgtaaatgagcaagttcagaa |