Species | Populus trichocarpa |
Gene Name | RPL18 |
5' Upstream | aggaattgtgtgaacatttctctgcgtgttgtcacctttcgttccttgtacactcgacag
aaattgcttttaccatgtagatcaatcctttaatgaggcgatcatggatattacttttct
cggatatcttgccaatatcggtggcgaaatcttactttcttttgtgattaactcgtctga
ttagtttgcatgttgagccccagtcaaatttcattgaaataaggcaattgagtgagatag
agttagcttcataagaactaacaatctagtgctggaaaaaggaaggccattgctgtcaac
tctctcttattacacagtaaagaaaatttaaaacttgtgtgtatctggtgaatcacagcg
gtagtgtttggttgctttattgggatagcttatgcaaagacaataaaaataaagacggaa
gtgcaataggataaaattatttcagagataaaattattttatatttatttatttcttttt
tctgttttaagacattgaccgaggctatttagctagggttacaacaattttttgcacttt
tgtacatgaatttgagagtggttataggtagcctcttccattgcatgattataattgaaa
atctaatataatttaaatattgttttattaaaattattaaatacacaattatctgatcat
gtgtttggtaatgcaatatataattttttttaattaaactatatttaaatatattttttc
agatttattttttatttttaatgtagcatgtcaaatttatgaaaaataatgtagaaaaac
atttttaaccactcttttaaattttatatctgttatgattattattctcgaccctaagaa
aaaaaatactttactcggtcgaattgggctgggaagtccaaaatccattaaatcttacaa
aatcatactacttcctagcccaacgttataacgattctctatctgatcaagcccaatcaa
atcaaaccctatataagatcacaaactttgttgcccacgt |
Exon 1 | GGACGGTAAATGATGCCTCTGCATAAACACCAATAGACCTCACCTACACACATAGATTAA
ACTATATAACTACTTAAAAACCCTAGCTTCGTTTTGTTCCCCTTTCCGTCTCCCATCAGC
AGCACCACTAGCAGTAGCGGCGGGTAGCTTTAAAGCTTCAAGAATG |
Intron 1 | gtgcctcccttctccctaggaatatacttatctttacgtatctgtgtgcatatggttcag
ttactgatttgttggtttttttttttttttttcatttccag |
Exon 2 | GGGATAGATTTGAAAAGAGGAGGTAAGTCCAAGAAGACCAAACGTACAGCTCCGAAGTCG
GATGATATCTATCTTAAGCTTCTTGTTAAG |
Intron 2 | gttagttttcaaaaacctatgtctacttttctataaagttttgatctttttgattatata
gtcctttttgtgaaggacagacgtgaataacccatgtctgtttttgctacgaagtttaaa
tcttttatgatcttttggaagtgttggctatgctaaggcctcagaccctttttttactga
atagtcaaaatccccatttgttttataatctttagaaggatgttatgtataatgtgattg
atttgaaaccgtggtcttttattag |
Exon 3 | CTGTACCGGTTTCTTGTGAGGAGAACTGGAAGCAGGTTCAATGCTGTGATATTGAAGAGG
CTGTTTATGAGCAAGATTAACAAGGCCCCACTTTCTCTTTCTAGGCTTATTACATTCATG
AAGGGAAAG |
Intron 3 | gttagcatttttttacctttaaagtgtttttgtattgtttgtttatttagcattttattt
cattgtttgtttcatgtatag |
Exon 4 | GAGGACAAGATTGCTGTGCTTGTTGGGACAGTAACTGATGATATTAGAGTCTATGAGGTG
CCTGCATTGAAAGTCACTGCTCTGAGGTTTACAGAGACAGCTAGGGCCAGGATTGAGAAG
GCTGGAGGAGAGTGCTTGACATTTGATCAGCTTGCTTTGAGAGCTCCATTGGGACAGAAC
ACA |
Intron 4 | gtatgtactccttttagtttgttggttaatttgttttattgcagaacttcatcttatatt
cattatgtttgttggtgattggtcttagtttaattgatctgatcatttgattttcttgat
tgctgttcgtaatctattactgcttttgggttcaagctgagtatgctttaaatgtttctt
tgctttggagtttatctatcgtttaatatgatttacatgttgccacttgctgtgattttc
tctgttatcttggtagtggcaatgccaaccatcctctgaattctggcaattgtatgaatt
accgaacttcattcttgagttggatgtttgttcatcccttttttgtttttctgttttata
g |
Exon 5 | GTTCTCCTCAGAGGTCCGAAGAATGCTCGTGAAGCTGTCAAACACTTTGGCCCAGCTCCA
GGTGTGCCACACAGCCATACCAAACCATTTGTGCGCGCCAAGGGAAGGAAGTTTGAGAAA
GCTAGAGGAAAGAGGAACAGTAGGGGCTTCAGGGTTTAATTTTGTTTTAGTGAGAGTGTG
AGGCAGTTTGTTTTGATTGACTGTTCCAATTTTTGTGCAACTCTAGGTATCCAAGGATCA
TTTTCATGATATTTTAACTTTGGTTATCTATTTATCTGCTTGGATTGTTTAATGCACAGC
AATCATGCTTGGTCATGCACAATGAGTTTTTGAGGATCTCAATTTTCTCAACAATATTTA
ACTAAACTCATGGAACATATGATTCTCTTC |
3' Downstream | ctataacggcccaaagttttgttttctttatacatccgtcagtcaaaatttgtgcccatg
ccattgtcatggtagtagtctgttctagtcttggttttgagcctgtcttgtgaacgagct
tctctttgacgtttcgcttgagccaattaagctttgatggctaggagcgggatgaacagc
ttgttaaacgtccagtatttgtgaatgtacagtaggctagtagctaagttggcttgttag
aactttagtcggctcagtatagaaaaggaacacaggcttcatttctgttcatctcgtgtt
ttaaagttgcaagagacagtaatggatgattgttcagatcagatcaaagcattttaatcc
caacccacattaaaaaggttctgcaatttaattattgaagccagtgaatgaaaaggtaag
cctgattagattgatagaaatcaattatcagctaccaggtgaattgaaacatgtatttct
tgtaaatcaataatttgcaatacaacaagattattctagtttgataatcttgtgctctgg
aaccgagttcttctattcaagggagatcccaaagcgtggagggttgcagaatatggttct
ggaagcgttcttgaacggcaagaaaacagatcagtatatgctaatgtagtcataaatgtg
attgttgatctcctctgccttctcttggttaatgaaatgaccgactccttccatcacaac
aacttcctccaacaatggcatgatgcttgaatcctccattgtttacaaattccttcgccc
ctggagtagtatagaccatgtcaagatctcccacaacaaactttacaggaacttccacca
gtgtcccagtccacggtgctgtgagctcccagttcctacaaccaccagattgtaactgtt
agaccaagttgttaagggtttacattcggttcagctgctagttaggaaaaggaaaaaaca
tacagatccagagctctgtagtagttcaaccctccagtga |