Species | Rattus norvegicus |
Gene Name | Lamr1 |
5' Upstream | ccttcaggatctgtggaatttgttccagaaccttctatggatgccaaacccaaaggtgct
caagtcactaatataaactggtattttctaataaccacaactctcccgttgactccaaat
catctctagattacctgagacacggaatacagtataaatgcactgtaaataaatgactca
ttcaaattcctccccatccccttcaatacttttgtaatagcttactgggtaaccaccatt
ttgttgtcccccaaatgtaggaaggagccagtgctttcttcaaggagcagagggcctggt
gggtatgtgctcctctaattagttctgacacaggtggcccaggcttgaagtctgttcttc
actcagctgtggtgctgatagtgtcaaagaaatgggggagaaaataccgtccatgcccta
ggccagccgtgagggaaaatactttgttttcactgaccgacctctttcacacacagggtg
tcatttttgttcgtagttgtcctctcgttccaattcttttgtgtcacaggacctatctat
ctttaaatggccgcatagtattccattagatagaataaacttacgaactgcattttctct
ttgaccaaaaactaattttatgcgtacagtcctgtactttatactttcaagaaaacatct
ctgcgataaagtctgaatttcccgtcggtaaaccgtcctccatagaccacacagcagtcc
ttcaggctgtgcttgctgtacacaggcctgatttctagaaatcttccatcaaaataagct
tcaggcttccaaccccacgatttacaccacgattggaaccgagcaggcgccggccacttt
aacttccgctccgcgcgtgcgcagcagcggacccgctcgctgaatctgcgcgtgcgccac
actccctttccgtaacggaagctctgccctctttctgtttaacgtgtgttgctattggct
ctctgtggcttatttaaggacgtcatttccggccgcccgt |
Exon 1 | CCTTTCCGCGCTACCCTGGAACGGGTCCGTACGGCGTTGTTCTTG |
Intron 1 | gtgagtctcatgtgggggtcctcggcgcctctcgacgccctgctctcgagcttcctgcca
catggatgtgcggggagggtcccgaggctgcgtgtgtcggagctgcttgattactggcgg
cggcgccacgtggtggcccgtggtgaggtggggcgggcgctactccgaggcccttctgcg
gctcgtgccaggctcgagaggcctgtcggcaagatgctgggaaaagtgttcgtggggcgc
gtagagatggggcggaaactttcgatcactttcaaaatacaaaacccgaagcacaccaaa
tatggctgccttctctgtgcatagacgaaacttctttagtaagtaccctttgaccagtgt
gccaacgtaagcgctaacttcctactggccagttttaatgcttgtgatttgctgcctaag
ccacttttcttagtgattaggtggccagaaaagttacaagcgacggaggaataagaatac
agtcagcttcactaagacgtaccgagccatgtggcatacaaaaacctttaatccctctct
ccggaggcagggtaatcttgtgggttctaatctaagagaaaaatggacgacattcctttt
ttag |
Exon 2 | GTTCCCATCGTAACTTAAAAGGGAAACTTACACAATGTCCGGAGGCCTTGACGTCCTGCA
GATGAAGGAGGAGGATGTCCTCAAATTCCTTGCTGCAGGAACCCACTTAGGTGGCACCAA
CCTTGACTTTCAGATGGAGCAGTACATCTACAAAAGGAAAAGTGACG |
Intron 2 | gtcagctgttgctcttgatagtcctgataagttgtcctagtgggtagtgctggtgctgaa
tgcttggagaaatactgccctggcttgtgagttgtattaaagagagttttgtaggaaggg
ccaggggtcatggaggattgacagaagggaagagacaggctgaacctgcacactattaaa
gctcagggtggaggccagatttggccagtgaacttctgagtgtcggaagtgtgctacatt
gaacatacggcaggattttcgctaacaccagtagagcttgcctctatgactggagtttgg
tagtggtcactgccacatacacatactctgctttcctgcagtgtccctttacagagcaat
gaggttagcaaatctgggccacccactttaaagatccacttgtggctaggtgtggtggtg
cctttaatcttagtgctcaagaggcagacaggcaaatctctgatcagcttgttctgcaga
cagccagggttccacagaccctgtcttggaaaggcccccacaagaatcccgtttgctggc
ctag |
Exon 3 | GTATCTACATCATCAACCTGAAGAGGACTTGGGAGAAGCTGTTGTTAGCCGCTCGAGCTA
TTGTTGCCATTGAGAACCCTGCTGATGTCAGCGTCATCTCCTCCAGGAACACTGGCCAG |
Intron 3 | gtgtgtgggagaggctgttttatttgggggcaaaaatgtgcagaatacgttgggagtgag
tacacaagagtttccaacgtggataacccgggaggtcactctccccgggctctgtcctag
tggcgtcagggagcagaggcattgcccagtgatgtacagtccctttccacaacgttggag
atgaagctgggcttcgtgctcgcacctgcatattcctacaacttctcagagtcctgtgga
cgatgactgaggaggcaaaccatgcaggaaacagtcctatgtcactcagtggcaggcagt
gctgtgtgtttaggaggaaactgttgctgactttaagggtaaagcaatgtcagccacaaa
atagccagccaagaagagtctttgctagcttgagtatatcggttgtaaaaaaaaaaatga
gatggagtgttaagacagtttttggtacactggtggctgagttggtaaagagtcgattca
agagtcccctagtcagttctgtaccttactgaggtggcttacagccatccacagttcagt
ttgtttcagtccagtaccagacctccgtgtgggtgtgggtgtgtgatacacttacataca
ctgaaagcaagccacccctacattaaataaaaaggaactgtccactacagggaaacgagg
gatgatatgcttgctctgtgtcctgataaatttgtccagaagtcagaggtgtttgctggt
ggtcctttgaggggcatggggcatgtgaaaagcttgaaatcaccaacatcatctgcttca
tagatgaatcaggtgcctcagactaagcatatggacatgcaagtgttacaattagcctaa
gaatgtgcttcaataaagtgctgctttggtgttgataggtaacttgaagtgagtatctac
agtttccctatgaaagcattcgtgataacgctgactcaatctcccttcaaag |
Exon 4 | CGAGCTGTGCTGAAGTTTGCCGCTGCCACAGGAGCCACTCCAATTGCTGGCCGCTTCACA
CCTGGGACCTTCACTAACCAGATCCAAGCAGCCTTCAGGGAGCCCCGGCTTCTAGTGGTG
ACTGATCCCCGGGCTGACCACCAGCCCCTCACAGAGGCCTCTTACGTCAACCTGCCCACC
ATTGCTCTTTGTAACACAGATTCTCCCCTGCGCTATGTGGACATTGCCATCCCATGCAAC
AACAAG |
Intron 4 | gtaacttggatttagagttgatgacagcactggggaagcctttgggctcccctgcacatt
gttagagcttggagttgaggtcacacgctggtcgatgaactcctaagtgtaggtagtgtg
ctaaacgagcggcaaggttttcgctaacaccccactctggtccagtgagtggggtctgat
agtaacctttgctacaagtttgatgtatgaactatgggcctgtgtattctcctaagtgaa
tgttagtttttggggggaggagtcaatttatgaggtgtgcccagtgctcctgtacctggg
gcagtgtgctgccatctgggtgtgtggaatgtgagacgtggttccaaggggtgttctgta
cagggcctgtgaggtaagggggtggccttatgtttagtgactccccctttcttgcag |
Exon 5 | GGAGCTCACTCAGTGGGTCTCATGTGGTGGATGCTGGCCAGGGAAGTACTCCGCATGCGA
GGAACCATCTCCCGGGAGCACCCATGGGAGGTTATGCCTGATCTTTACTTCTACAGGGAC
CCAGAGGAG |
Intron 5 | gtaaggcgctattaaatgctggtggccactaagtagatgggacaccttggtgtggttcag
tgaagctaaatttgtccattctgtgcttttaaaaaactag |
Exon 6 | ATTGAGAAGGAGGAGCAGGCTGCCGCTGAGAAGGCTGTGACCAAGGAGGAATTCCAGGGT
GAATGGACGGCACCAGCGCCTGAGTTCACTGCTGCTCAGCCTGAGGTGGCCGACTGGTCT
GAGGGTGTGCAGGTGCCCTCTGTGCCCATTCAGCAGTTCCCCACAG |
Intron 6 | gtgtgtatcaaggccagggcatcaggctgcagggagctgagcagtgtagactgagtaatg
gtgaagccttcagtggccacgagagcgttactgttctgactctgggtgtgctttgatgtg
tgtgccggtgggcgcagtgtgtcttgacacattgcttttgggatgacttgggaaaagtta
ctctgttcctagagctgatgaccttttttgtactttattaacag |
Exon 7 | AAGACTGGAGTGCACAGCCGGCCACTGAGGACTGGTCAGCAGCTCCCACAGCACAGGCTA
CTGAGTGGGTTGGAGCCACCACTGAGTGGTCCTGAGCTCCTCTGCAGGTGCCTGAGCGAA
GGGAAAAAAGGTGGAAGGAAAATAAAGTTCCTGAAAGCTG |
3' Downstream | cctctgtgctctttactgcagaatacacctgggttggtgttgggctatagaacaggcatg
agctagggaagggggcatttctctccaggttctactgacctgtttgtgttgactacttaa
gcttgggaatactaaactgcagtaacagtatgtatgtttaatgttctactgtgggcctta
gcttcacggtcatgagctgcttggtgcctctggaagtttcatacatgtgatctaggtggg
gtgttcttttaacacagggtctctgttctgtcatgactcatagatccttctgccttcaca
ctgagggaaggcttgtgccactgaacatgaccagattgagatatgtcccagaacaaagtt
aatactggctggcactcctagacaggactgtccagtggtcctgaggtaaggatagacagt
ctaccgaggctgtggtgtaggcatgacattccatgagctgcagtgaggtggcattgcaag
ggttaagtattcaggagtttagaaggagcctaaatttacccagtaaggggtgtgtgtgtc
catcccctactgagctgcctgtggagaggatctggtctggaagggtggtccttagcctgc
catgctgctgggggggggggcgctgggagggaagaatgaagaatgggccgataactcaag
actgggaaccatagttcttaagacaggtttgtggaaagtctgagaatgcatggggaaaga
gggtagataattctgtatcctgcgcacttcctcctgctgcctgtggaattcacaagtatt
tgtggtattacgggtacataaggactaactggctatgaagtgctttcctagcttttataa
agtttgttagaacatggcaaaaatagcattcttgtgtttgtggcattaaaatgaacagtt
taagacattaaatggtagtggggttaattctctagatgatgcctgagtccacagtcatgg
gtctcagtattgtctagtctggtatgttaggtggcaagtg |