Species | Oryza sativa |
Gene Name | 11680.m03432 |
5' Upstream | atatgggatatccataatctccacactacctccgtgctcttgcctcaccatgttcatcgc
ttcttgtttcggtggtgagattcttgatctgaggtgttgaaatgttctgaccgtaatatc
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ctcgcttcgatcttcgatctctctccccttctccccacaccccactaaaaccccaggcct
cgccagccgccgccggccgccgccactccccgccatcgcc |
Exon 1 | ATGGCTCACCTCCGCCTCCTCCTCTCCCACTCCAGCCGCCACCACCCCCAGCCGCACCGT
CTCATCTCGCTCCTCCGCTTCTCCTCTAACACCGGCTCCGGCTCCGGCTCCGGCCCAACG
CCGCCGCCCATCAAGCCCGTGTCCTACGCCCCGAAGCCGCAGCCAGCGCCCGAGGAGGCT
CCCGCCGCCGCGGAGGAGGCTGCCCCGAGCGATGACCCCGGGTCTCGGCCCCCGCCGCCG
CCAAGGAGATCGCAGGGGCCGCCACAGCGGCAGCAGTGGACGCGGGAGGAGATGCGGTTC
GTGAAGGACGCGGGGCCCTCGATCACGCCGGTGTCGTACCCGGCCAGGGTCGCGCCGCTG
CCGGAGGACCGTCCGGCGGAGGAGGCACCCCCGGAGGGGCCGGCGGACGAGGGGCTGCGG
GGAGAGGGGGAGCGGATCGAGATGGACGCCACGCGGGCCAGGAGGAGCTTCTTCGGGATG
CAGGCGGAGGAGGAGCAGGCGCCATACCCGACGCTCATACCCGTCGAGAAGCGGCCGCAG
AAGGTCGCCATTGATCTCGTCGACGCCATCCGCGAAATCAAG |
Intron 1 | gtctgtcactcttgctcgtgatttttctccgtgcggtttgaattgcaattcgttttgcat
ttgaagataatacccatgatgtggtgatgcatttttctattacggtgtaattggcacctg
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tatgaaagatcaactggtattttagtgattgcctgatcggcgatag |
Exon 2 | GAAGTTCAAACATATGCAAATCTCATACCGATTTTGATGTGGAAGCCTGGGAAGTTGGTT
GAGCTCAGTCTAATGACTGTCTTCTCTGCTATACACGGAATAGCTACTGAAAATAAACAT
GATCATGCAA |
Intron 2 | gtattgtgtcatttttaaaacatacatctgtttacttctgaaagaactatagctcatcag
ataatttggtatggccacctcttagttacgaagtgttcaaaactttccactccttcag |
Exon 3 | TCCCACCCAGGGTTTCCCAAACCGCCGGGGCCGGGGTTACCGCGCCCCGGCG |
Intron 3 | gtaagcacggttaccacacggtaaccgtgaaaaaccgtacaaaaccgtgcaaaatttatc
aaaaattcaaattattttttaaatttatttgaatttaag |
Exon 4 | GAGGTTACCGCGGTATTTATATTACCGTACCCCCGCGGTAAGCTCGGTAACCGCGCGGTT
ACCGACG |
Intron 4 | gtaagtcgaaccctggtcccaccacttctttccattagttagtgagagaattatagataa
aacacttaaatttgatattggcaaaatcctgaaaatttctgcaaatttattcactaaaaa
atatctgttcaaacgttttaccatcttatttcctttgttgcttcaattttatgctatttg
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tgaaaatcaacctaattggctgatgaaaaatgaagttttcttacttttcgctcttctgtt
tccag |
Exon 5 | ACCAGTGCAAATGAAAAGAAGCGGAATTTTACCGAAACAGTTGAAGCTCATGTAATGTTA
GGTGTTGATCCACGTCGTGGTGACCAG |
Intron 5 | gtttgctgcgctatatgtataaactagataattttgtagtgctaagtttttattgcttac
ttctctaacatggaagtgtagcattgtcattagtcattacattgcatttctgactgccgg
cttcattgcttgctttactttcaagacaggttttcatagctggtttagtttccatgtcct
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tttcttctcattagtaggtaaaccccttaccgttcttgaccaccaattggcaaacctagc
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tcgagaaaacacacaagtgactaggatgtgattaatagtttcctgagcttgatcacataa
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ttatgacagcaaaaatgtcctaagaggatatgctgattgagataacctactacttacagt
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gtcaatcaatcaatcttatgatctcttttatctggttgtgattgttggattggtgcaaag
ttatactgaccatatttctccctgggttacag |
Exon 6 | ATGGTGCGTGGCGCGTTAACTTTGCCACATGGCACTGGCAAG |
Intron 6 | gtacctttctaaatgtaacatttaggttttcttgactgttttgtgctgaggtcttcttta
cttttag |
Exon 7 | ACTGTTAGGGTAGCGGTATTTGCAGAAGGTCCTGCAGCAGATGAAGCTAGAGCTGCTGGA
GCTGATGTCGTTGGTGGTGACGAGCTGATTGAGGAGATCCGCACAG |
Intron 7 | gtactttatttcctccaattgttgtataagcttcttttctttctaacgacagtcatattt
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gccctttttatcaggaaactttatcctactgcattataagtattagatatagatgaatag
tcatttacaaggttttaaaatacttaacatcttttttttcatgtataagttatagaaatt
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ttttgttactgcattgcacagtatgttttcagttaggtattttcgtagttttgcatcttc
aatattcaacatccctgttgattggaactttttcatctatggccatttatatag |
Exon 8 | GAGGCGGTAAACTGAGTTTTGACAAGTGCATTGCTACCCCTATGTACATGCCTCGTCTTT
CGAAG |
Intron 8 | gtagtaatgcttatttcttgatacaaatttatcttctgtttgctatattattaatttctt
gactgctttgctatttcag |
Exon 9 | GTTGCTAGAATATTGGGTCCACGCGGACTGATGCCAAATCCTAAG |
Intron 9 | gtaaatatctgtcctttttgtattgtatggtatggagtgttctgccttgatgttttttat
ggtaccatgaatcattaacgtgacatattgctctgtag |
Exon 10 | CTAGGGTCTGTGACAAACGATGTTTCTGGTGCTGTCAAAGCAGCAAAATCAGGCCGGGTT
GATTTCAAAATAGATAAAACAGCTATAGTGCATGTTGGTCTTGGGAAG |
Intron 10 | gtacggaagatcagcattgatggaaaattcgatatttgtgttgcagctttgttgcacgcc
ttattaatgtttgtattcttttgcag |
Exon 11 | ATAAATTTTTCTGATGAGAATTTGCGTGAAAATATTGGTGCTTTTGTACATGCACTTCTA
CTTGCCAAGCCAGTGGGATTAAAGAAAA |
Intron 11 | gtaagtggcctatttatatcgcgtatcttgcatctccttagtactctggacacctagcat
gaaactggcactttgatcaacatatgaatgtttaagcacacggtcttaagaaaatatgct
aaaaatttaatgtaaatatgctaaaaatttaatgtgattggacttgggtatttatggtcc
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tgttattatttgttgtttctctgaatctctttacaaggtattaatgttctccatttcttt
cag |
Exon 12 | CTTCAAAGTATGTTGGATACGTGAAGAAGTTCACACTGAGTAGCACA |
Intron 12 | gtaagttttctctcttttctttattttgtgaaaatagaactatgctgcatttttttccca
ttttattgggatatcatggaatatttcacaagaaatagtacaaaaatgctaaatgccttt
agctggacttctcatcttctcatggcgtccattatttgtaggctccctgagcaaggaata
gattccgttatgttaaatcatacagccgtaaaagctataggattggaggcaccaggaaac
aaagacctaggcttatctttagctatggccatattaggaaggaccctagtcaaactatat
cgtaattattataataatgtttagaaaagagtaaatttcacaaaattacagatatattaa
ctaaactatcgcaaaactactgatctaagatgattatcacaaaactacagatttagcact
aaatttactagaaaactatagatttgaggtgaagtatcacaaaactacacaggtttagca
ccaatttaatcacaaaagtttgatgtttataactcaagcataacatttgttctaaggatt
taaacctcaaaatctgtagttttgtcataattttattattaaatctgtag |
Exon 13 | TTTTGTGATACTTAG |
3' Downstream | ccttaaacagttaaacctgtagttttgtgataaattattgttaaatctgtagttttgtga
aatttactcgaaaagaaaataagattaaaaaactctgcactataaaaaaatgttcacttt
tcaaccttgaatgtgctgtttgcgtgaaagttctcagacatcttgaggaaagtttttggg
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cttcaaaggtagatgtttctctctagtggggagaaaggtggaaatactgctcggtacttg
agaacgttgctaatttattgggatctgggatgctgctgaagttttcttgacatgattcac
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