Species | Oryza sativa |
Gene Name | RPL38A |
5' Upstream | agtgcttaggcaggcttttcgtatgcaccttttgaagtactgtaggccaacaagttggaa
tttttcagcagaattttattgtgcataacagcaatctcaagcaggagttccattggatta
cctggggactggggtagtagatttccaacataataactagtgatgtgcttctactgtttc
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gttcccgtctcgctcgcctcctcgatcgtcttctccacctgcgccgccgcagcctcctca
actcaactctcttcggcagcgagcagcagcgccttccacc |
Exon 1 | ATG |
Intron 1 | gtgagttcttctcctctcctctcttccccgcggcgatggctacgcctgggctagcggcgg
atgcgcggtgcggtgcgattgaccccgttgttgttttggtttgtgttgttgctaccttgg
caacgcag |
Exon 2 | CCGAAGCAGATCCACGAGATCAAGGACTTCCTCCTGACGGCGAGGAGGAAGGACGCGAGG
TCGGTGCGGATCAAGAGGACCAAGGACGCCGTCAAGTTCAAGGTGCGCTGCTCCAAGTAC
CTCTACACCCTCTGCGTCTTCGACGCCGACAAGGCCAACAAGCTCAAGCAGTCGCTTCCC
CCGG |
Intron 2 | gtccgtattccgttatccactgcctgtgtattctcttcctttcatttttattgatgctgt
tcttaagtaaggaaacgtccgctgctgtgtgcgaaatcacgtgttttgttggaacgaatc
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tcaagtacatcatacttgtctatctggtccagcagacaaagccagcaccaactaaggttt
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tatccttggaccataagctgttcatccagaaattatacacgttttgcactatgtatctat
gcattactgttctgctgttcattcagtacaaaatttctttttgttcaattgatcatcatt
gctaactcaatgattgtgaatttctttcttcag |
Exon 3 | GTTTGACTGTCCAGGAGGTTTAA |
Intron 3 | gcatcaaagccagaccatgctgtttgtagcagcaggattgcttgctcccgttcgcattag
tagctattagatgctgaaattttatctgtcttgagttttgaatgtaacacccaaagttta
tgtgctgaaccttcttcgagtcagattgcgctgttactcctttctggagatagctaccag
tcgtactgtccctaaacacactgaattttgctccatttctctctaattgctggagtgttt
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gtgttgacacatccacacgtgagagcatgaacacagtgacacgtgagagaggaagaacga
tttttgtggtattgctggaatcttttcggcttgcag |
Exon 4 | GTTCTTAATATCTCGATTCTTCAGTTGGAATATCTGCTGCTTGGTAG |
Intron 4 | gtcagttacagaaatcgtggtgtgacgatgaggaaagccatctgtgggctatcctatgtg
tgcagtacttaacaaccgtgcagaacttgcgttcagattgtatttgcggcaagattgtca
cttcgacaaaattttgtagaaccaatttgtccttcagttttggttcatgtgctattcatt
tcaacttctatgaaatatgagcaaccaagaccttgaccagcatacccataattcatctat
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ttctcttacattttttttggcaattatattgttattactgattaatctccaccgtccgat
ccttatcatccccttcccggctacctccatcatccccttcgccagtcgctcgcttctact
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ccccacaccctcgtcggcgcgtcgcctaccggtggccatcttcgcccactcccgctccat
gtcctgtagccgaagtgcggcaatgattgactgcccgcggctgctcctggcggccgcgcg
cgcctctccgtaccccagctccgccgctcaccggagggtctgcaccgccggagtccctcc
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gttcttactttccttgtactcgtgcaagtattgcaggttttttttccttttttttttttt
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aatttcttgttttgcattgtgtgcgaactcgacaattggaagagatgctagcttgaatag
ggaaaaaatggtttcattttatgctttagttatcttatcctctggatgaaacattgacag
|
Exon 5 | ACTTGGGTCAACACAGTGCAATCTGCATCCTCTGGGTCAGGAAGCCAATCAAGCGTTGCA
GAAAGTTCGGAGGCTACCGAATGGGCCATGCAGG |
Intron 5 | gtaaccaatttccccaccacattctcaaatcaggatagcagattgtgtttctttcagccc
atgagaccatgaatgccagggttttgatccttatgcttag |
Exon 6 | AAGTTGGTGACAGATTTCTACGCTTTGCGGAAGGATGTCGAGCTGGCTGTAGCGCGCGTC
AGTGAAGTCAGGCAGTCTGCTGGTTTGGATCAGCTTGAGGAGGAAATCGCTTCGCTCGAG
AAGAAATCTGCAGATAGTTCCTTGTGGGATGATCCTTCCAAGGCACAGGAGATACTTGTT
GCTCTGACAGAGGTCAAAGACAGAGTCAAGCTTCTCAACGATTTGAAGTTGCAG |
Intron 6 | gtttaaccaacttgatattcttcttcatcccatactagagatgatacagaatgatgtaga
attctaattgttattatactatagctatatatattgaaatgattgtttaacacctcctgt
agtaaattagtaattctcattattataatgtggatttgccgcgttcataaatacaagtaa
tgataactaataaaaatatgtaccccctccgtcccaaaaagaaaccaatctaggtgggga
tttaataccactgtccatatttgttgtcctaggtggtgtgtaatcctcacctaggttttt
tttttttttttggggacggagggagtacagatttgctgcatatatccatactacagctga
gaattgacagaggctatccattttggttgaagaacatgacttctggaattaattggttac
caacactagttcttaattgtgtcctttccattgttatttacag |
Exon 7 | GTTGAAGAAGCTGAGACCATTGTAAAGCTTACTGAGGAGTTAGATTCCATAGATACTGGC
CTTCTTGAAGAAGCCTCAAAGATCATAAAGGCATTAAACAAAGCACTAGATAACTTTGAG
ATGACACAGCTTCTTTCTGGACCTTATGACAAGGAAGGTGCTGTGATTAATATTACTGCA
GGTGCTGGTGGCACCGATGCCCAG |
Intron 7 | gtatgctttcactaattctcatgcttccttcttagctcacaatgtaggaaagatgatttt
tgtcttagttttctaggatcttatgacttgttcatttagtcttgttgtgcttgtagaaaa
tttagcttttattattgtcgatattatacttctagtaccaaatatgtaccactgtcataa
ctttttcatacatgtcctatttctatctgttactgtaaaagacgacctaacatcagctag
aaaactagtgcaaatgtgaatgtatgatatgataatgaccttcttgatgattattaatcc
atagtgtacataactggatttccaggtgtcaggatttaacgcaaactttatatatgtagt
agtatatgtaattctaaagatgtgcagttcaacttacatgagtttatctcatataagaat
ggcgatagatgatgtttcgtgtttttctggagaaaaaacatattgtagaagagcaagttg
tgattataatttttttaatggcttatatttgtag |
Exon 8 | GATTGGGCTGACATGTTACTGAGGATGTATGTTAGGTGGGGAGAGAAGCAGCGGTACAAG
ACAAGAGTGGTTGAGAAATCCCCTGGTGAAGAAGCTGGAATAAAATCAGCTACCATTGAA
TTAGAAGGAAGATATGCCTATGGGTATCTCTCTGGGGAGAAAGGGACACACAGAATTGTT
CGTCAGTCCCCATTCAATGCTAAAGGGCTTAGGCAG |
Intron 8 | gtatgtgtagtttttcagttcctcttttgcgattcatatacatattctcgcaactttgaa
aggaaaagacatctactcatgctcagttttctgttcaatgtgctaatttctttag |
Exon 9 | ACAAGCTTTGCTGGTGTTGAAGTAATGCCTCTACTGCCAGAAGAGTCCATGGATGTAGAA
ATACCCGAAGAGGATCTGGAGATAAGCTTCACTAGAGCAGGCGGCAAAGGAGGCCAGAAT
GTGAACAAGGTGGAGACGGCTGTTCGCATGGTCCATATACCCACGGGCATCGCTGTTCGT
TGCACAG |
Intron 9 | gtttgtactcaaagacagtcagtgcagcttgcatgatgtgtcatatcttcgttagggctg
tggatctgaatatctgctaattcttggctctatgccttcacatatgttgcataaataggt
agttttgtcatgtttgggtaagacccccaatcttagtttgatatgatgtggtcatcaaaa
gacccaaaaaagaaaaagtgaaattggtaatcgttgaagtaaagtaaagaactgagcaag
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tgaaatgtatttgcaattttgcatcaagaactgtagctacatgagtaattttccacatct
tttccttgcgaaacctcgcag |
Exon 10 | AGGAGAGGAGCCAGTTGGCCAACAAGATAAAGGCCCTGAGCCGGCTGAAGGCGAAGCTGC
TGGTGATCGCCGAGGAGCAGCGGGCGTCGGAGATCAAGCAGATCCGCGGCGACGCGGTGA
AGGCGGAGTGGGGGCAGCAGATCCGCAACTACGTCTTCCACCCCTACAAGCTCGTCAAGG
ACGTCCGCACCGCCTGCGAGACGTCGGACATCACCGGCGTCATGGACGGCGAGCTGGACA
CCTTCATCAGAGCCTACCTCAAGTACAAGCTCTCTGCCGCTGCTGAGGAGCAAAGCGTCA
AGTGA |
3' Downstream | cagatttgcatccagtgtccgatgcaacaaccgtgcttgtgctataggcgcagaattttg
atgcagagcaagaaccccatcacgtagtaagcttgtaagaatagcctgaaattaaccgtg
cagaattcggtttgcttggctctactaagcacccaaattttattttggggcttcatgtat
tagtggatatattaatttcatttctacccaatatatataagcctctcacctgcctgacgc
tctcatgccatttctcattgcaaacctagagtcaggctagcggtccatgctcaaaaaggt
tactctacagattgaatgctttggaaccatttgaacttctctctctctctctctttctct
ctctctctctctctcatgcataaatctctctctctctctcttatgcataaaggccgagct
tagttccaaactttttcttcaaacttctaacttttccatcacatcaaaacttttctacat
acacaattacacaaacttccaacttttctatcacatcgtttcaatttcaaccaaacttct
aattttggcgtgaactaaacacacccaagctacaatcagttcaatttgctcaaaacatgt
gcgaacagatcatacgttgttcaaaaacgctctctcaattccctaagagcaagtttaata
gcatagcctactacttgctccaattcatctatagccaattttatagccaattcatacaat
agttgcttactatattattaatacatggtcccacttgtcatacacacattgcgtcttgga
gtccgtgctgtagctggctacatatttgtagcccactgctcttctctctcatcttttatc
tcattaaaatatgtttatagctggctaatagtctgctattgtacttgctctaacacgcat
ccaatccgcattcccaatccgtttggtggacggaggacggcggtggcggcctccgcagat
gggactacctatacatttgtcaacaaattttttcccaaaa |