Species | Oryza sativa |
Gene Name | RPP0B |
5' Upstream | ggcgacggcgagcgaggagaagatggccgtggtgaagggtgacaccacgccacggctgaa
gctcagcaggcacaagaagaagctgtccatagaagcatgatgatgatgatccgctgatca
ctcacactaccaatccttttcacttttcttcttctctgaattcttgataatcgagtgcca
tcagctcagtagatgtgttgccgtgttggtgtcgtaactgcgaacttagtgagttgttgt
tagagtgttttacatccatccatccatccagcaggaggagaatctagtgaaagagctgtt
acctgttcattttctggtgctaagtttttgacattttcatcatcatagtaaaaattgcca
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gcgtcgacagtagataaatcggcacgtttggttctttgccaatcctaacattatcttatt
tttgcaacagtaagagttatcattgccataattttggtagagttgtccgtttggattttg
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cgccacgaaaccctaaaaccaagcccatcaggcccaccaacccgaagccacacccatccc
tctcccactataaatacccgcaccccccaccctggaaacc |
Exon 1 | CTAGGTTAAAGCGACGCCGCCGCCGCAAGCCGTCCGCCTTGCTCCTCCTCGCCGAGAGCT
TGGTCCTCGCCGTCTCCTCTCCCCACGCGCAGATCTAAGCCTAGGGTTAGGGTTTGTGTA
GCTCGCAGCGATGGCGATCAAGAGGACCAAGGCGGAGAAGAAGGTGGCGTACGACAAGAA
GCTCTGCCAGCTTCTCGACGAGTACACCAAGGTGCTCATCGCCGTCGCCGACAACGTCGG
GTCCAACCAGCTGCAGGAGATCCGCAAGGGCCTCAGGGGCGACTCCATCGTCCTCATGGG
GAAGAACACCCTCATCCGCCGCTGCATCAAGGTGCACGCCGACAACACCGGCAACAAGGA
GTTCCTCGAGCTCATGCCCCTCCTCGTC |
Intron 1 | gtaagtccgactcaccgtgttcttgcggttgtttttgcctacgcgtgtttctggaaatcg
atgtgatgttcttgctgttttttttttgtag |
Exon 2 | GGAAACGTTGGCCTCATCTTCACCAAGGGTGACCTCAAGGAGGTCCGCGAGGAGGTTGCC
AAGTACAAG |
Intron 2 | gtataactggcattcaatctgtgttctagactgcatggatagtagattgtattgtggtga
ttctgtagtttttgttgaatgtgattcattgggttgcacgctcgcagttgattatatgtg
gaagatattagtagcgtgttatgtaaaaaaattgcaaatctgatgcttgatccgtttgct
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atgtcgatatttttgttgtatgatgctagatcttctgttagattttaaaggacatattca
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ggaagaatctcaattgttagtaggttgtgacagtttgatgcctgatgagtattgctagtt
tttgcaagcatgtacaactttaggacattatagtcaatgtcatgctcaatttatcgctag
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tgttatgttagatgtgatatcacaatatttgacctcgtcaccttttagtgtatgtctcaa
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gtgcttctcttttcattgcgaaatctcagtgcatacttgtgatgttatctgatgaatgaa
taaccctgatttgtttttgttataaaacag |
Exon 3 | GTTGGAGCTCCTGCTCGTGTTGGTCTTGTTGCTCCTGTTGATGTGGTGGTTCCCCCTGGC
AACACTGGTCTGGATCCATCCCAGACCTCTTTCTTCCAG |
Intron 3 | gtgatcatttgttgatttgttaataaatactatcttgtctgcttagtcaagtagtcaact
acatgttctcactgttcctatcttgttacag |
Exon 4 | GTGCTTAACATCCCCACCAAGATTAACAAGGGTACTGTGGAAATTATCACCCCTGTGGAG
CTCATTAAGAAGGGTGACAAGGTGGGCTCCTCCGAGTCTGCTCTGCTTGCCAAGCTTGGT
ATCCGCCCCTTCTCATATGGGCTGGTTATTACCAATGTCTATGACAGTGGGTCAGTCTTC
AGCCCTGAGGTGCTTGACCTCACTGAGGATGACCTGATGGAGAAGTTTGCTTCTGGTGTT
TCTATGGTTGCCTCAGTCTCCCTGGCAATCTCGTACCCAACTATTGCTGCTGCACCACAC
ATGTTCCTCAATGGGTACAAGAATGTGCTTGCTGTTGCTGTGGAGACCGAATACTCGTAC
CCACATGCTGATAAGATCAAGGAGTATTTGAAA |
Intron 4 | gtaatcttgtttctatttcactttatgatgatgttttcttaatgcttgataattggtcta
actaagataatcaatagatagtagattaccatactaaaatgtagcatgtccatgtcggta
cattaacatcttgtttggctgcttggtgcagcgctgctgcagcggctgcctagcagcatg
cagctagctggtgaactggtcatttttacttatctacataattgatttagtcgttgagca
ttattacatagtctagtgagcaattgaatttttatggtagcaaggagtatttcacttagg
ctgtttgtgcctttattggttcatccatggtagcaaaatgctgtttaccacactagaaaa
taagttaatgctgctttggaagcggttgcatcatggtttcttacatatttatctggctta
tatttctcag |
Exon 5 | GACCCCAGCAAGTTCGCTGTTGCTGCCCCAGTTGCCGCCGACAGTGGTGCTGCTGCTCCA
TCGGCTGCCAAGGAGGAAGAGAAGAAGGAAGAGCCCGAGGAGGAGTCCGATGGTGACCTG
GGCATGAGCCTCTTCGACTAAGCCTCTTGCCATATCGCTGCAAAGTTGAAAGTTTTGTTT
CAAGTTCTGAACATCGAAGTTTGTTTTTAATCTTTAGCATATTAATTTTCTACTAGACAA
GAATGTATCCAACAATGGTATCGTTAATTATGCATTTTGGTTGTGCCCGTATCCCCCTGC
|
3' Downstream | tgtttttggtgtgcctgtgcgatggttatcgacttcatcctcctgtgcatttcatctttt
tctttattcgaatgcatgtatcctagaattgcgcagcgatcagatcatgaagaaagaact
aatgccgtgcgtttaaccgccgtaagtttgcccttgttactggaaaatttatgcagattt
tcacagaaagtaactttcccatgtttctgtaaattgctgcaaaattttcacagaaatttc
tgtacatttcagctctattttcttgcagcaaggcaagaagtctaaagtcacttggtcaga
taatactactacttggtaaaataggtttttccaggcaagaagtccttaagtcagtcacat
ggtcagattctacatctcgataaaataggttatctgtctggatatgtagcaatcagtggc
ctcctatcctgaccacaaccatctctgctgctctgaacttcttatctcgaatcgaaagaa
aaaaagattcagatgtcacgcaatcacgttgacacttctccttcctcgctcgctcacgct
gttgcgttgcatgcgcaatgtcgcagcagcacggccgcggccacattgcccactgcctcg
gcggcgccctcgccggccgagacaccgtcgccgtctccggcaatcgccgcctgaccggcg
ctggcctcgccgacggggcgcgtaggctggccgccgccctctccaacctcggcgtccgcc
gtggtcacgtcgtcgccgtcgtcgccttcaacaggttgggacttgggagctagctttgca
ttctcttcagcttgcctctctgatttgagaaatgaaacccgtaattgtggcttctgattg
atgcactcatgtgttcatccatggcttcccttctgctttgcagcatcgagtacatcgagc
tgttcttagccgtcacttacatcggagggatcatcgctcctctcaactaccgctgggtaa
taattcaattccttcacctcatgtatcacaaattcaaggg |