Species | Nematostella vectensis |
Gene Name | RPS11 |
5' Upstream | agccgaaagtccacttttggttctcaatagacaggctatttgtagtttgcagacaaaacc
caaaatcataagcaagatcactttggtatgtagccaaattcaacattaaatgtcacattg
atttcggggactcctcagtatcgtttcgggtcctgggatcatttcgggtcctgtacagaa
ctcccccccccccaccccaccccagaaaaattaggtccacttttttcggatttcgcactc
cctcaagaaaaatcatgcttacgggccagtatctggacctaacaactgatatatcatata
caatatcatacagactgtaaaaaaacacacatataagcttacctcaaagcctggggtttt
ctttaaaacggtttcaactctgttatacagctggttgacttttccattgacatcgccaca
aacaagtctagacgaaaaatgaggttgggtattagtgagtatttataatcgaataaaagt
tctcatatgttcaacatagattaagttatggaaaggaaacattcgaatcataataatttt
aagtataacttacattttcagtggttgcgacatttctttgcaatgttattattaggtaat
tccccggaatcactagccgtttaaagggactaattgtgtaaatatctctccaagactaag
gcgatcattattgaagcggggcacatatttcagaatttgccgccatcttgcaaaacctcg
tttttacactattaacttgggtttcctgtggttagggtaatcctgccgctgccggccaaa
gatatttcggcctcaacaaaaaaattaaccttgacatgtatcgatttatatatatatata
tataaattcattatattcctatgtatttatgaggaaaaaaaaagcggattttatgggtta
ttatagctcagaattgcattctgggatagatgaatatcgtaatgcccgatgggataggat
ccgggacaccacgtggtgcgtcctcttttcacccacagcc |
Exon 1 | ATGGCGGAACAA |
Intron 1 | gtaagtgaagcacatggcactactttacccgaacttatctcgctctaaaatccctattat
caaattattttcgaattgttaaataaagtaactcataatccttacgttaagatgttattt
gttcgtatatcccttttctttatgtgtaataatatgatatttcatggccaggccaaaccg
ctttctgccacattttttacagaattcgagcttctcttgaccctctaatatgaagatttg
ttattgattgttatatgaaacagaaatgtgtccttactttgtacacttttgatatttggt
tcgtaagaagctcaatttcaatgcaaaatactttgttaaaagcctattcgcctattctac
atgggatacactgagcttttatcagcgtacattttttacagggaaataagacctccatgc
taaaggttctattttatcaatttatttagaaaccagaagtttataaagatcaataacatc
ttcataaaatactacttcattgtttatacctgataaactaatctaatgacagctttttac
ttgcaccagtccaagtttattgaccttcgtgtttttctttccag |
Exon 2 | ACAGAGAGGGCGTACCAGAAACAGGCCCCCATCTTCCAAAACAGGAAACGTGTGCTTGGC
CAGGTCACCAAGAAGAAGGACCTGCGCTTTGTCAGGAATGTTGGCCTGGGATTTAAAACA
CCAAAAGAT |
Intron 2 | gtatgcaattgtacttacttactacctgagagagaggtcacgatgagagatatcaagctg
aggctttggcgcatcaaccaacctttgtcgttaaaaccaaagccccagtttgatatttcc
cagcatgaccgaatgatgatcgaaatgtgatggtagaaccatatgcaaataagagctcta
aagtgctgttgcaagtaatacaatcattattttatcatgctacaaacccttggggatcca
attctacaatgtgcaacacatttagacaaggcaccttttaaagaagcttttttgtgcttt
tgctcttaggcttgtttagggtatgtactatttaagtatttattgtactaaaaattagct
tttatctctttag |
Exon 3 | GCCATCGAAGGTACTTACATTGACAAGAAGTGTCCCTTCACTGGCAATGTGAGCATCCGT
GGACGTATTTTGACTGGTATCTGCAGGAGCATGAAGATGAAGAGAACCATCATCATCCGA
CGGGACTACCTTCACTACATCAAAAAATACAATCGGTTTGAAAAGCGTCACAAGAATCTA
GCTGCTCATTGCTCTCCATGCTTCAG |
Intron 3 | gtgagctgggcatgacgcaatagcatttacctttaaaattatagcatttctacagtcagc
atgccacaacctttgagatatttggtagccaaacctcgaagtgctagtatgtctcacaga
aaaaaatgttaagcaaattttccctgttgcgtagacaacactttgtcactgcacagttct
ttttattatttataaccaagatacactaaaattttttcctctgaaaaagacatatccctc
taatttctaagttcaagttaaagccgcattgtcaccagtttacttcccgatgagtaatct
cagatgattttttaatcattcatagcagtgaatactgtccattattctgagatagcgaac
taatcagagagcacgttcttatgaggaggttcctgccaagtatataataaatgtgataat
cagcttttcattttaatgcaagtgttttaacacttaaaagatctggaagttatggtaatt
ttcagttacttatttgtgttgtcatgttctttttcag |
Exon 4 | GGATATTGCACTTGGGGATCTGATCACAGTTGGACAGTGTCGTCCTCTCAGCAAGACTGT
GCGTTTCAATGTGCTCAAAGTCAGCAAGGGCAAATCCACTATGAAGGGAAAGAAGGAATT
TGAAAAGTTCTAA |
3' Downstream | atgtcatcaataataaatactcttgttggctgagattctgtgtcttcagtctttttatat
atttccaaataataatgagtgacctattacactttaacaattacattttgctgcacagga
ttttgaaaaccactctatcattccccttgaaaaaaagacctttgtgcccggggggggggg
gtctttagggtaaaagtgatagggattctcgtcaggaaattcaataaatacctgcaaacc
aaaaattgttacccttaaaaataacccggaagccattaaaaaataccaattctaagagaa
aagcctattattttcccagataccccctaaaaaatacctgaagcccgattttgaccccta
aaaaatacgacgagcatccctaccaggtcgacatgggaagaacccccctcgggccttgtg
ttttcgtgctcaagcaatgaaaaaaggggtgaaagagcgagaacatattacccagctact
agggatgtagcttgtacattgtagacttaatatgatactagaagggccaggtgctttctt
tcttcactgaagatcatgcctgaatgcgaaagcctccccacttgactgggtctgcgtgct
cgaggatccagcgtactttacgggcgctgcaaaggtcaataccgcaaaagagccgctggg
aaagtttcatagtaagactagttcttgggacttattctgacggaattaaatacagttcct
ttcttcgagataccaaaatggaacgtcagaaatgtgttccttttcggtcagtagacacta
tatcgttgtcttattttttattagattggatcccagccctgtcttagtcgttaacaggtt
aatccacgcacagctcactgagatgtagactgaaaatatcggggtctttttcgtgcttgc
gttgtgttggtgtggtaatttcgtcatcatgcacagcactctgtggccacgggcatcaat
ctacgacaacaactacaataaattggctttataagatata |