Nematostella vectensis - RPL3


SpeciesNematostella vectensis
Gene NameRPL3
5' Upstream
tacctttgtccttgtatgccttaaatgcttgcatatactgatctactatagtgcggcaat
tctgtcttgcgttgacttcctcttgtctgtaacagtgagccacttggtctcttagctcct
taacggtctccagttcaactagtctgtctagcacccactgttcccgagcctccgagaagg
caacaggatcacgccgatcaatctcctcaaaggagggcgctcttgctttttcagtgtagc
gcttgaagtatttatcacccatttcctaaacagaaatcaagaaacaagttcaacaatctc
gacaaaatgaagctctaaagtaattattcacaacttctctgctgaacggctggcatctat
ggattaattttggctgtctagctagattagctctttagttatttctagacagcctgtacc
cgttttgtattaaagtattttatattgtattgtaatttcatcttatggtacaaatcaaat
atattgtattgtaattaacatttggtctacatgtttgacaatttatgtattcaacacgcc
aggaaataactaatagatgtcgaacctccatctacataagggggtcttgcaaagggggta
agccaacaggcaagaccaattacattcggttaaagacatcatataacttacttaatttta
ctgctaaaagtaacaaaagcccaatcttagagaagttactttgaattgcttgttcgcgaa
gcatgccatcacgtgatcaaatcaagctagcttcaaattttcttcattttatcaacaatt
tgaactttaccttccggcagccaaaatcgcaacaatcgagggaggtgattcaatcaagtc
ttagctccaagaaacacaaatcagaaaatccaagatggcggccacctcgactaccgctga
cctgagcctgcgttgggttgctgcaatttccaatctattgaccaccctctcacgatttta
catattcaagtgtcacgtggtttttcgttctctttcccaa
Exon 1
GTGCTCGAACCAAAGATG
Intron 1
gtgagttttgcgatcctgtgaataaaatccggcaaaattaaccctatacaattgccatcc
attttcaaaatttatttagaacttgagcttacatgtttctgtaccatgtagtccagttat
atctagtgtatgatcttttttcatgaagaattttgatcgggaaattaaagatctcgcaac
gtgtaaaccatcatagatcgaacttttttgttgaatcactagtttttagtttgtaaattt
tttatggcaggctttttgttgtttgtagcccttgtctaaatgtcatagttaggattttat
ttgaagatttaattaccgtacttattaaacaaaaaatggcaacgtttattgaacgtaggg
ttctttccaagaaattaatttctgtggaacatgattgtatttctaaagacttttatgatt
ttttaataataaaaaaagaacacgggtatttgattcgagtatcattactacaaagtaatc
aaatcatcacacagcgatcatattttgacatgtagcatttaatattttcctgtaacag
Exon 2
TCTCACAGAAAGTTTGAGGCACCACGCCATGGTTCTCTTGGTTTCCTGCCGCGCAAGAGA
TGCAAGCGTCATCGCGGTAAAGTCAAGTCCTTCCCCAAAGATGACAACACCCTCCCCCCT
CACTTGACCGCCTTCATCGGCTTCAAGGCCGGCATGACCCACATTCTCCGAGAGGTCGAG
AAACCTGGATCTA
Intron 2
gtaagtgttgcgcattcataatgataaaattacattcagtggatacagggaactcagcag
gggtaattgaccttttctgatgtttctctctctag
Exon 3
AACTCAATAAGAAGGAGAAAGTCGAGGCTGTCACTATCATTGAAACCCCACCCATGATGG
TCGTCGGTGTTGTTGGATACATTGAAACCCCTCGTGGTATGAGGGTGTTGAAGACCATCT
GGGCTGAGCATCTCAGCGAGGAGTGCAAGCGTCGCTTCTACAAGAACTG
Intron 3
gtgagcaatgacgtaccataaaatatatatatatatagtagaaatattaacaggttcctt
attacatacatacattatttaaaacagggatgctgaatcagctttttacccaactttgac
aaaaactgctgttgatagaggccctggattgcccattcctatggctagaaaattgctaag
atttaaagctatgactattctagtctttgtcgcaaagtctagcaatatattgttatttag
ttcaaaattcttgtccatgcccttctactagcctaatttgattactgcttcagttttgat
agtagtgatagtctaatggcagcattatcaccctagttctacttggcatcatattgtcaa
agtccccttgaagcatactttcattactgtattgacctctgtttcacacagtggcgcaaa
ttagggcacaatcctactagtcaaacttagtagcaaagtataacaatggattgtaattta
gtgcagattcttgtctactagctacagtattactgtggctgtaacacactctaacaatga
gttgcaatccagtgctgatcctccgctgagcggttcgatatcgctcatgaggcttggccc
ttctctctcttctctccccatgttacctgctgtctgctgatgaag
Exon 4
GTGTAACTCCAAGAAGAAGGCATTCACCAAGGCCAGCAAGAGGTGGGCTGACGATGATGG
CAAGAAGTCTATCGAGGAGGACTTCAACACAATGAAGAAGTACTGCAAGGTCATCCGTGT
CATCTGCCACACACAG
Intron 4
gtgaggaatggcatgaagtgtagtcaaaattactttcttgataacatttggagggttctt
gggaaaccaatagtccagtcaaaaggtttcccttagtttcctctgaagagtacaacaatc
ttgaaagactttctaagcagatttcgcgtgccctaagacaaggaattttaaaaatggttg
aaatcaaggaagttatgtaatttgacataaccaagaatccagtctaaatctattgtggcc
attgtgctgcagtacccaaataactctagacccatgttcatcatgcctcctgcgagattt
tgaggggagaatgtagtattcttatttaaattatatttttgctgatattttag
Exon 5
CAAAAGCTGTTGAAGATGAGGCAGAAGAAGGCACACATCATGGAGATCCAGGTGAATGGA
GGTAAAGACGTCGCAGAGAAGGTCGACTGGTGCCGTGAGCGCCTCGAGAACCCTGCCCCT
GTCCGCAAGGTCTTCTCCCCGGACGAGATGATTGACGTCATCGGCGTCACCAAGGGTCAT
GGATTCAAGGGTGTCACCTACAGGTGGGGCACCAAGAAGCTCCCACGCAAGAAACACAAG
GGTCTGCGCAAGGTTGGCTGTATTGGGGCATGGGATCCTGACCGTGTATCATTCTCTGTC
GCCCGTGCTGGTCAGGCTGGTTATCATCACCGTACTGAGCTGAACAAGAAGATCTACCGT
ATCGGCCAGGGCATCCACAAGAAGGACGGCAAAGTCATCAAGAACAATGCTTCCACAGAG
TATGACCTGACAGACAAGAGCATTACCCCCATG
Intron 5
gtgagtttattagtggctagggcacagagtatgacctgacagacaagagtattaccccca
tggtgagtacattagtggctaggacacagagtatgacctgaccgacaagagtattacacc
catggtgagtacattagtggctagaacacagagtatgacctgacagacaagagtattacc
cccgtggttagtatattagtggctagaacacagagtatgacctgacagacacgagtatta
cccccatggtgagtacattagtggctagggcacagagtatgacctgacagacaagagtat
ttcccccatggttagtacattagtggctagaacacagagtatgacctgacagacaagagt
attttccccatggtgagtacattagtggctagaacacagagtatgacctgacagacaaga
gtatttcccccatggtgagtacattagtggctagaacacagagtatgacctgacagacaa
gagtattacacccatggtaagtacattgagtggctaggacacagagtatgacctgacaga
caaaagtattacccccatggtgagtacattagtggctagaacacagagtatgacctgacc
gacaagagtattacatcgatggtgagtacattagtggctagaacacagagtatgacctga
cagacaagagtattacccccatggtaagtacattagtggctaggacactctagtcacggc
cagaagcacttttcccttaagcggctacactgagaaaaaaatggttattcattttaacaa
aaatcctatctactttactgttgtctggacctgattgtaatatctgagttttattgtcca
ttaggctctagtttgcaggactaaaagcatttttgattatctctgcctctcgatttacat
ttacagtatctagtgtatttgatgggaagtagtcttagattgattcaatgttcttgttgt
tgtag
Exon 6
GGTGGCTTCCCTCACTATGGACAAGTCAACGAAGACTTCCTCATGGTCAAGGGATGTGTT
GTTGGACCCAAGAAGCGTGTGCTCACCCTCAGGAAGTCCCTTCTGGTTCACACCAGCCGT
GATGCTGCAGAGAAGATCACCCTGAAATTCATTGACACCTCGTCCAAGTTTGGCCATGGC
CGCTTCCAGCACCCTGCTGAGAAGCGTGCTTTCATGGGCATGCTCAAGAGTGACCGCGAA
AAGGAGCTTGCTGCTGGCGCAGAGTAA
3' Downstream
acccttgtaacaacttggagaataaaatgaaactttaatttaaaaaaaagttgttattgt
cttattggaaatgtctcattagttaggatcctaaaagatgctactatgtcacaccaaatc
acggttttggttaaagccgcattgtcaccagtttacttctggtcgattacgttacaatct
ccgatgatttttaacggaaaacgcgaaaaatatttcaaaatattgaaagcagtgtgtata
ttgcaagtttcttcgacgatgtgattgataatttagagcggatggcatgttaagtatctc
ggattctaatagattcttttaacggttgaggtttgcgtcggacctacggaagtgaactgg
tgacaatgcggctttaaggacggtaaccaacggaataggcttcaaacggcaaaaaaaacc
acaagctagtattcacaatcaacaacggcgtgaggcttattttcaaaaccctataggctt
tgaacccatccccagcctctatctgctatttttgtccacaggtcggccgcgtttttcaac
tactgtaagttgcctaggaggctactttggcaatacgagggtttgagatgcgggggcgaa
ggggcacaaggcctagttcttccccacgtcccttcaaactttaagcccaaatctaaaaac
atttatccatccccaggcccattgtttattgttgggaataagagcgcatagagtatgcct
tgaaaatggccgtagtcatggaagggtggcgagtgccttcaatttaacatttccatggaa
tgaaaaagtgtaatgtggcgccagtgatgaaaaatgggtctcgtgttactgccgaatgca
ttaatatatgtacctgacaataaaagaaatcactttccgaaatttacagtaatattgaac
tgtcatcaaatgacaaatgacccttttatacagctatagtgcgcgctttcattggctgat
tagcggtctaaaacgatggaaacattctcagataccaaag