Species | Nematostella vectensis |
Gene Name | RPL5 |
5' Upstream | ggttctttgacaaatctcaaatcgaacaaggagagaaaagcagaatcacccctctcaata
aaacgctcaaaataccacacaagggagagagatcagcaaacacagctcaagacacaaata
gatacctttattctgatcctccaggtacatttccatggctttaaaacacaatgtccactc
cttgaaggattgtacaaccacgaagatgtctttacgtattgcaaagcattctgggagatc
cagggaaaaattcacgaggggagggccagtcgacactcctctccccaaagtcagatgttt
ttttaccccgaagccaaacaaatcaattccaggtcatacagacccagaatagcagtgtaa
acaattttggaatcaatttggtttcagaaaagacagcatttaggagagctgtggtgattc
attagaaaattattttcagtcatccaggcaaagccaaacaagaaaaatcatcatgaatcc
acctttgcttgcaaatatctataagcaaagcactcaattatgccccaaataacttcatga
tgtcctgagacactctcctaatatgctcatagctgtatttttgatggaaaatacaagcaa
ccatcaacttgtgctggcttcagcacaacgacgaggaattaaaagtggggaccgcaaagc
actgttggaaagcttggataccgctgactaggtgcagctgtgtttgactttgacgggctg
tataaaactcagaataggggggaggtatctgttttcagtctgttttttgtaaattcagct
aaaaaaaaaagccaggagtcaatgggttaaaataaacaacttagcatgtttcttgatctg
agcttcctgtggtggcttgaagcctaggctgaggtacgtatctgcgcatgcgctgcgtca
cggggaatcccatgatgccacggggtcgtccccatgccttcctcttctctctgaatcatc
tttacatcggtgcaaacttcggttagcccgaaaattggga |
Exon 1 | CCCATATCCAACAAAATG |
Intron 1 | gtgagagttgaaatgatattattttacgattataataacaaaatattgttcaatgatttg
gtgaaaaaattctggtcaaaataaaccctgagtctgttattttttcaattttgtttgccc
gagtgaacggaatctcgtgcgatcgtaaactcacgtgttcgctcgtaaaaatgttctttt
cag |
Exon 2 | GGGTTCGTTAAAGTTGTAAAGAATAAAGCATACTTCAAGCGATTCCAAGTCAAGTTCAAA
CGCAGACGCG |
Intron 2 | gtaggtagatgaattattttctgataaatcgcgcaaacaatttggaaacttgctgttccc
gggattccacccatgcaacaagttaaactcactgagagcatgattcctgcgtaaaaactt
tgctgtgcgtgttattttcag |
Exon 3 | AGGGTAAAACCGATTACTATGCACGTAAGCGTCTCATAACCCAGGACAAAAACAAGTACA
ATACCCCCAAGTACCGGTTTGTGGTCCGCTTCACAAATAAGGATATTACTTGCCAG |
Intron 3 | gtaagttaacttaagttaattgtcattttggcttcataggaagcttgtatgcatccacat
tcctaattgtgttttgtaagtgtgtccttaaacataataagaggcttgttgaaatcttta
atcactggccacacactgtataatagaacatccatatggattactgcagcaagctgccta
ttctggtttatattattgatactcatacatgatgatattgatactgatacattgatgtac
tgttcaaattgatttataaaaggtcacacatcccatattttgtctcaaaagtagcaccct
taaataattgtcacacctccacaatattgtatagtatgttaagtttgagctctgttcatt
ctttttcacacattctttttgccatgaaccatgttagcctagtttttaatcatgtttttg
ttgtcatggttttaccggattcctttaatttcaaag |
Exon 4 | ATTGCCTATGCCAAGCTGGAAGGTGATGTTATCATCTGTGCTGCCTATGCACATGAGCTT
CCTCGGTATGGAGTGAAAGTTGGGTTGACCAACTATGCAGCTGCCTACTGTACTGGCCTT
TTGCTTGCTCGCCGT |
Intron 4 | gtaagttattgccataatctactatgcattaaatcaaacaatcttagttttattgcttga
ttgttgatgtccttagaaaaacagtatttcttttataaaacaggcaagatggaaaatctt
gtgcatatacactgccaagttaccatatgtactaaagaagccatgatttcatgcactgtt
ttgttgtaccctggattaagttcccctattcaaaacactgataccatgaggccggaaaag
cacaccttaagattttggattttttcctgatcgttcttgtcctgtttctaatggctaggg
caaaagctatcaatttcaacgtcattttaaaaaacttgcaccacttaccatacctttctt
tgagttaaaataagcttatttgaaaaaaattcctacttgtctacaaaaagccataacaaa
acagatttttttctgataaaatcaatcattatattttgtactgtatgaaaag |
Exon 5 | CTCCTGACCAAGTTGAACCTTCATGAGATCTACACCGGCACCGAGGAGGTAAACGGGGAT
GAGTACAACGTGGAGAGCATTGATGGCTCACCAGGTGCCTTCCGCTGCTTCCTGGATGTT
GGCTTGGCACGTACCAGCACTGGTGCCCGTGTGTTTGGTGCTTTGAAGGGTGCTGTTGAT
GGAGGTCTTGAGATTCCCCATAG |
Intron 5 | gtatgtacagtacataacacttttcagcatcaactgtacagggggggggggggggcaata
gtagttttgcttctgaaaactgcagaaaatagaaggaacaacgacatcaatttccacctt
gtgtagtcaactcattttctatactatatcttttttcacataaacacttttgacatttat
aaaattccataatctttttttttttcttgggcttacttaaagtgtcttttggtaacaaat
tgtatcaatgttactgatccactgactcatggatttcctacaaagatttaaactcctgga
caaattattgaatgttatagtgatgttattggtatttgtattttttttctctcaaaactt
acccaaagcatatcttcctttttatacagttagaactccctcttcccactctcatggtta
ttatctgcttcctcttgtttttttactcatatgttatattttgcatactgtattgtag |
Exon 6 | CATGAAGCGCTTCCCTGGCTATGACTCCGAGTCCAAGGACTTCAGTGCTGAGGTTCACCG
CAACCACATCTTTGGCCAGCATGTTGCCAATTACATGCGCCAACTAGCTGAGGACGATGA
GGAGGCCTTCAAGCGACAGTTCTCACTATACATCAAACATGGCATTGAGGCTGATGGC |
Intron 6 | gtaagtattatctccttttgtgatttagccggctctctggagattcgggattcctgtgaa
aggggggaagaagagccggcagcaagaccctatgtttttgcattccacccctttcatcct
tgacgtcacttgtcaaatgaaagtgacaagagctgttaaattgaaccaatcacagccatt
caaaaagtaaacaaaatggccaatgtgcaatagcagcagatcaaaatactcgcttgagct
gtgaacccgtgattttgataaaatactagcacaatgacaaatagatcgtatttacaaatg
gagagaatgtcaatttaaacaaaaacagcaattataagcacactccccacacaagttaac
gacttcagtcgaatttgtatggtgggattcccaagtgaaatgcggaattctaagaaagtt
ccaagtaattattcgacaacaaaatatttttcttccttcgcaaccgctagaaagaaatcc
tttgcttccttcacaagcaccagaaagaaatcctcctttaactttgaatgtcaagaaata
ttaaggtcgtctcatcaacagcagtggcacttgttttgaacagggaggtcacttcagcgc
tgatttaaactctgaggcatacacttcttcagctgaagcaaatatctttggcataaaagt
cattctcataaaagatcatcgggataatccaactcctttaccaagattgtgaatgcgcag
ttctggatagaggccaaacatctgagtggtttcaagtaaaaactggagtaaaacaaggct
gtgtaatttcaggctttctattccttcttgccatccattggataatgcatgaaacaacta
gcaaaggcaacactgaaattagatggaagttcaacgcccaactagaagatctagactttg
cggatgacattgcgctcatttcaaccaaccacagccaaatgcaaaagaagacggacaaac
tatctgagacagcccaaaaagtaggacttactaaaagtaaactgcaaggacccagagcca
atcaagctccaaaatggccaagccatcaaagaaaccaaggactttacctatcttggagcc
tgcgtaagcactgacggaggtgctgataaagacgtcgataccagaattagtaagccaaag
cagctttcaggaaactgaaaaaggtgtggggctccaaacaatacaacaagaccaccaaga
tcaagctatttaacaccctcttgaaacctgtcctcttatatgggagtgaaacatggaaga
ccaatgttaattttaaggactgcgaaaatcttgactcattccagtaccaatgtctaaaga
gaattttgggcatcttctggccatacacaacatcaaaagaggagctgaaccaagaatcgg
gatctacacggatgagcgtagaagtgagaagaaggagagggaagtatctcgggcatgtac
tcaggatgccgcgacaacaccattgcgcaactgcacttacatggcagcccgacggaaaaa
gcaaagtaggaagaccttagacaacttagaggcagtcggtggaaaaagagagaacagagg
caggatggaactcttgggaggaggcaagggtggtagctcgtgataggtgcaaatggagga
aaactattaaggccttatgcacaactgagcgcaaagaggataggtgaggtggtgaaaagt
cattctctaatttaagacttgtttctgaggttttctgactccttgatcttgtctcataac
aaatcttagagggaacaaatgactagaattgtcggactttcaccgccagactcgaagctc
atggcgcttttttaaaacagtaaataaagcttttaccaaagcctgttagtaaaatcccta
aagagcagagactctatagcagacttctttccgtaataataagacttaaaagtgattttg
aaatagatggggagtgcacagttgaaggacgaacgtaggcctatcttagattttgtcact
ttatttgatgacctgtcgaaataagccaatcagtgtgctccgttcgtcagcgaacggaga
acatgcataaacatggggtcttgctgccggttctccttttccctttacctcgccacagga
atcccgaatctcttgagagctggctatcaagctattcgtgattcgtaatcagtaatataa
ataaaaatgattgtgcattatggtattactttctgcaaaattgtttactaaaatggcgac
aagttttttttctgactcctacagtatgtagagtttgtagaatttgctacagtaagttgg
tttttctgaggatttttataacacaaatttttaacaccaagtttgttactggtttggtaa
accagtttcacttaaagatgagacacaagaccttgtaatcacaagccagtttaaattttt
gaagaatttccattagtgggtataaactatgatactgtatctctcaaacagggtcttgat
gcctacttactgtatttacactactttttgttctatggagtaccttccaaatttagtagc
ttgcataaatacttattcaagaatacgtcataaatatacgatacttcgtaaataatgaca
agcaaaacagactatactatcagataattttatgtacaaaaatatgctctgaaacaaacc
aaaagttaagcgtgcgacacactagtctattttgtttgctcctgtgagcgtagtcgatcc
ctagcgatcatcagcaaattcgattgccagtattgggcatatcagacgtctagatatcag
ctaattctccgctgcagcagacagaaatgacaattttcagtcgttaattgaatttctctt
gtataagtcatagttctaactatgtagtacaaaaccgccttgtgtgttgtaggctttata
caagctagacaaaaacaaaacacaaaatatgatgctccttaaattccttgcatatttcac
gtggttttgaccctgaagttgtagttgtgttatttgtctagttgtgtcaattgtcttcta
aatagcaataaatcacaagaggcaggagtagcatggggtaagcacaggggacacgggcat
caccattgagtgaaaaaaagcagctcatttctttttaaagtattaaagtatcctgtgatt
aaatacttttttttagaaaaattgcaaatcatggctgtgtgtctgacttgccacctgaat
tacatcccacctggaaaatgtttcagagtaacatgtcaatcttgttttttag |
Exon 7 | ATTGAGGCTATGTACAAGAAGGCACATGCTGCCATCCGTGAAAGTCCAGAGGCCAAGCCT
GCTGCTAAGAGGGAGGTGACTGTCAAACG |
Intron 7 | gtgagaacaaaatcccttcataccaccttttgtatggatgttttaccctgcacagtcaga
gcttttggatgattttatgcaccattccgtttttttaacatagtaaatttgctttagcca
tatatgatcgcagggggttgcactgcagcccccttgtagggcatttttctctgcaaatta
gttcccgtgtaaccctgccgaagtgcttttgtcggagtgtccgcatgtttatgttctaaa
tttaaaatacactattctagagaagaaacacattttttctcttatgtttggtgtacaagt
ccgtgacacagtttggtatgtatttcattaaactttaaagtgatgctttttgtcaatttg
gaaaactactaaaaaggttcagggtctgtcgtaatcttttttcggccgcagaaatcacac
gggaagacgaccgcaaagcgcacggggtctccgagcatggccttttcctgacaacagaat
gattgcttgattggttttattttccggccttgtgaaaacaactaacccttgtttgtttct
gcttttttttctttag |
Exon 8 | CTTCCACCGCAAGAAGATGTCTCGTCAACAGCGTGTGGACCGTGTGAAGCAGAAGAAAGC
GGCGTTCCTGCGCGCGCAGGGTGAAGACGATGACTAA |
3' Downstream | gccttgtatgaattgctcgagtaataaaaataccatcttatccattgagatttgtggctt
tctatagcacaggggaggggggggggtcatgcgtgtggggagaaaaaggaggttgtggag
agactattccgaaaagttgtagctttgtattgtttaattagcaatgcatttttcattcct
tcatcacatcgtccattgtgtttactctatctctgattttagcctactgttacaatctta
cacgtgaccttgctctgtaattaaactaatattacacctttagaaattaggtattttctt
ttgtgtaatcaaagacttcgttgtctactttattgaatagctcgttttgtaggcgcgtac
acaaggggtgcgcatacccccccccccccccccttggaggccaaaagtgaaaaagcttgg
aatcatcaaatcttaccaaatatatgggaatagcttcccatgatacctatgactaatcct
gtgtacgcacctgtttctggaaagctaagtacacttttttttaaaaaagaacctttttaa
agagaacgtctaagcctgctcgagcgagagcaacactaatttcgctccgctagcgatttg
ggcttcctgtgtaacaagccgctgccatcttgggagcgcaagactcccgtacgtcccctc
ccccaagagacaatgtttattctacatgtgtgctggatttggacgctgagagtctgtgtg
taatagatttgggcttcctttggcagtcagcgatacaaaagcgacaataatttttcgcac
gtgcccttgtttacgataatattgaaagcttcttcttcgatttataccgcgaatacgatg
ccgaaaacaaagaatagtcatttccttcgaagtttgtaaattaacgataaaacaactcga
agaagcggataaatttatgaagcgaataattaaactagttggtcgtctaagggcaaacag
ccctaatgccattgcctatgtctccatatgttcaattttg |