Species | Nematostella vectensis |
Gene Name | RPL6 |
5' Upstream | taccgtcttgaataacacatgtcattccaccgcctccttgctggcgctcccaccggtcta
cctggaatttcttcccgtccaaatcagatagttttctgcaaatttcaccttgagccttta
gaatcataacttccatctcgtacgcatactgtccttatttttttccagcgtcttaatatc
agtcaacggctttcccataaatgtctgagctacatcagcgattctttcctcgcgggcgtg
aatcgccgtgaagccgatatagcttccgattcctatggctgaaatcccaaagcccgcaat
aactctgctggctttactaagacgcagtgtctgagctacacgaaaagaaaacatattgtt
tactcacagggacgttacaaatctgaaaaaatcaaaaagcaagtaggctgaaggaaacgt
gagaaaccgaacggagaagtttgcgcacggcgggtcatgcaattatcatcaggcgtctta
gtagagatgagagtgaaactggggcaagaataccgctggaagactaagatcgcggtctcg
gggttttagccgaactcccggatgtctctggtctcttcatctgtggctttggaaaggtag
gaaaagacagaaagtttgttgaataaaatccatcggatatctcttattttattagccatc
tggttgaattcatggtactcagagattccttattgtattgttaacctacataagggacat
cctttatatatcttttttctttacgttaatattttgctttttcgaaccctaactgagatt
ctcttcgacgccatagtcttgcacatgtaattggaaatttgttgatattttgataaagta
atatatttctatgactgcttgagtttattttaaatttaccttcaatcgttactgtaacta
cgtcgaagagcgtttacgagcgccaaaatttttagtgatgtgatgttgttttgtcgattt
aatgcttactgtctattcatgtgttttgttataaaaatag |
Exon 1 | ATGCCGGCCAAATCTAAGGATCACCCGTCTCGGAATCCGGAGCTTGCTCCCGGCATTAGC
CGATACAGCCGCTCAGCCATCTACAAGAAACGGGCGCTGTACAAACGCAAAAAGACAGGG
GTAAAGAAAGTAGTTCAGGATGAACCCAGAACTAAGACCAAGGACATCGGAGGAGATAAG
AACGGAGGAAAAAGAGTCGTCCCCGTCCAAAGAGAG |
Intron 1 | gtacgctagctttctctttaaaattatttacatttagaatatctgttatgtctattctaa
tgtaccttatgcacagcatagtatatgatatcattgatactatggtattattttggtatg
gtattgcttactgaaaaaaaactagtctgtactacaaggtaaacatgagattctggctac
aatatgtaacaggtgaattaatgctattttgagtatcgtgtaaactctttccatgtcctg
ccgctaaaccactgtttgatgtccataagttaacagtactacattttgtgctagctaatt
tgaaatagttattagtgttatttcaccctgccccaaataagaacagccaaacttcaactg
aaaaagctgatccacatctccttactctcttacatatgtgttacagtaagccactattgg
tgctaagtttttacctacttttcctgattgtctag |
Exon 2 | TCTCGCTACTACCCCACTGAGGATGTGCGTCGTCGCCTGGCCAACAGAAAAAAGCCTGGT
ATGGCTAAGCTGAGAAGTTCTATCACTCCTGGCACTGTCCTCATTCTCCTGGCTGGTGCC
CACCGTGGAAAGAGAGTAGTCTTCTTGAAGCAGCTCAACTCTGGTCTTCTTTTGGTCACA
G |
Intron 2 | gtaagtactgcagaacctctttactttggtcccaacttagttttttttactcagtacata
gaggatattacatggtcatgcgaagatacaaaatttatcttcaagttgtgatattttttt
tgcctgtcaaaatgtactaaagtaggcggctgcttataaaaaagtagccagttgtgagag
gattgatgctgaattagctctattgtttatttttaacagacaaaaagtagcctgtgataa
aatgtggagtagttggtggaccttctgtagtctctggtttgtttacaaaatgaaagaaaa
atatcataatttgcgtttttattattataaattattatgaacactgactctttagaagtg
aaaccttatttcgatataggtgttataaaaagcacatgactctttaaaaatgctcttaaa
attatgctgcaaaagtttggtatcacagactgctgtctttggtgccattgaaaggccatg
tgttgaccttttcaccaacatattgactgtttgttatttaccttaaaattcttggtgttt
tcag |
Exon 3 | GACCCTTTAAGATCAATGGTGTCCCCCTGAGACGCATCCCACAGTCATACGTTATTGCTA
CTAGCACACACATTGATGTCAGCGATGTAAAGCTCCCAGAACATGCTTTTGCTGATGAGT
CTTACTTCAAGGGTGAGCCCAAGAAGAAGAAGCGCTCAGAGGACATGTTTGAGGAAGCCG
CTGAG |
Intron 3 | gtaagttatcattgtgaaaaaaaatattatataaggtacttggcaaattcattatcagga
tttaacataacttgtttgtgtcacttcaacagttttcataccaaaaaatgtccctaaatt
ttgctgagtttaattgtaattttcactagctgccataatctataagggtaggtcgcaggt
gcttctaatgctgataaaagaaccacaaaatcctctataaatatgctgaaattggtcttg
ttttgtgacgtgatctctgtgttatttagaaaggaagggctttgtcatgtttatgtttag
ctcttataccattcactcctgtttacattttccag |
Exon 4 | GAAAAGAAACCTAGTGAACAGCGCATTGCTGACCAAAAGGCAGTGGATGACCAGATCCTT
CCAAAGATCTCTGCTGTCCCCAACATGAAGAAGTACTTGTCATCTCTGTTCTCCCTGAGG
AAGGGCCAGTTCCCTCATGACATGGTGTTCTAA |
3' Downstream | ccgttctaattcgagatgaataattaagaataattaaaaataccaacccctgaaaataaa
tgttgcattcctttttgtgggatccttagaatcgtttttggggtgcgttcgccccccccc
cccccccccccgggtacgggcctgatatatagcatcacctttatcaggttgacaacctgg
atttaattgcacctttaagaaattcactttttctgaattaatgtccatgtgcgcaggcgc
cgaagatggcggccacgggagttattgctctcctgattttcctatttatagttcaagcag
ggcaaaattccttctatctctttcaagccactaccagagagattttggtttagcttttac
caaaaaatcacaatgcatcggctaatttcttcgggattttgcaagcaagattagcagcgg
ccaagttcaccaagcacggtttttgacgtttgctataccaggacatgacccaccactgga
cataaccatcttctctgacattccttcaaatcctggccctgtcgacctctcctccatggt
ccatgatttgcatagccacagcaagatacaatattcaagggacgtattgctgggtctttg
ctctcgatcctacatgattgaccagaaccccactttattcactatattggaggatgctgg
tattttcaagtccgtggctgcagagctggtctcaatgtcagtcgacgccgagccagtggg
gagaatttaaacctccccctcctactaatttctactgtaatttcctatcacgagccacga
ctgcgtcacgcgaaggatcgaaatcgatcccgcacactcactgcagtaaaaatcgtttgc
gaccgccccaaacatcgacatttgttttgtttcggaatcgtggctcaacaagaaaattta
gtattacttgatttgccctgatggctacgtgatggtcaggaaaagatcgacctgggatgc
agattggaggaggagttgctattatatgtagaaataactg |