| Species | Ciona intestinalis |
| Gene Name | RPS4 |
| 5' Upstream | gtggttcccgcaaaagcttccaacgctgttgatgatgatggtgttgtttggagtcgatat
aattggagttggaagggacaagacgaccaaaaaggttggctgttatattttctactagat
taaattattgttgttaaaccgaatagttacagttactttggtttctgccgttatatggac
acgttaggcgggggcaacgttagtcgttataacacgggtgttctgtttcatacacctcgt
gcctgcttacaagttaccacatatgtaacttgtttatcctcgtatgacagggcaacgaca
gtcggtataacatgggtgttttgtttcatacacctcatgtctgcctacaagttaccacgt
atgcaacttactgagcaaccattattttgggaccggatttttttttataacttttggctg
acaattttggcaagggaccgctgggttgtagaaatatgaataatgattacgtttacgttt
ttgtttcagtcctagaagacgcaagtttggaagagttacacgatgctcttgattttctat
actctcaagaatagttaaatactaattagacgatcaaatacgcataaatggttgccagta
aaataaaccatctcggtacaagcgtgcttgtgttatatagcgtggaatgtgagtggtaac
taaggggcgaacaagggggaatttacccctctacaaactacattttaccatatacgtatt
aaacggcggagtagaaatattactttgtgatggtccagttttaccgcctatttttatttg
attgtttaagcttatatacaaatttgttcaatccagtggttccttaaagttgtttaatat
taaactttcagcccccccccccataaaatatcaacaaaattaaatattaaaattggtcgt
tttgcttttttgacaaaatgaaaactaggtttttttaccccaataaaaaacgatttgtga
cgtcacttaaaacacgctgcgaacgcaagttggtgctgtc |
| Exon 1 | CACGCGAGGCCGCTGTTCAATCTGGGGTTTTGTGAAAATTTTCTTCCTTTTTAGAAACCA
GGATG |
| Intron 1 | gtgagtgacgtcggattgtatctgtattcatcttatgctacgtttaatatccacaaacag
tttccgaacaactgttgaagtcagttatggaagtttagggttaaatagttaagttaccgg
aaagtttggtgtaaatattgatatcagaagcgaaagatttgaactagagatccgccatta
gacatggaacatacattagttaacctcggtctaattctttcag |
| Exon 2 | GCGCGTGGACCAAAGAAGCATCTGAAGCGCTTAAATGCGCCCAAGCATTGGATGTTAGAC
AAACTGACGGGTGTTTTC |
| Intron 2 | gtaagtaatattttatatttttctaaaaccgaataattttgggatatacgatataaagta
aaagacagaatatatcaaaataagattataactctcccttggtcaaatgtgtatatagat
aatttaaactgttgcaacattaatacaatatattgaatacctttaaaatgtgaaacctga
agttttaaaaatattattttgttgtagcgtttttaaactatctattagtaaagaaccctt
accccccccagttgcccaaaatctgatctgtaactcccgatacttcacttttacctcaaa
ataatttgttttaaactaaattcag |
| Exon 3 | GCTCCCAGACCATCCACAGGACCCCACAAACTGCGAGAGTGCCTTCCTCTCTGTATTTTC
CTCCGTAATCGTCTGCATTATGCTCTCACTTACGATGAAACGAAGCGGATCCTCATGCAA
AGATTGGTGAAGGTTGACGGTAAAGTTCGAACTGACACAACATATCCAGCTGGATTTATG
G |
| Intron 3 | gttagttgtaaagttttctgcagtatataaaagttcctgaacaattcctgtcaatccaat
tgtttaaaatctgccgccaaaataagtattttaacaaccgaagttctaaaattattcgga
cagcaaaatagtcttgccctgattgctttataatttatttgagaccggctcaataccttt
cacgcattttaacaggtaaattaatgttactagtttttgaaattatacgttgggtatcac
tgaaacttaacagaacttattttcaccgataaagttatacctagtgtacaattttgataa
ttgtatttatgctgtctttcaacaaaaaaagttttaaatttgccattttatttttag |
| Exon 4 | ACGTAATCACCATTGACAAGACAGCTGAGTATTTCCGTCTCATCTACGACGTGAAAGGAC
GTTTTGCTGTTCATAGAATTACTTCTGATGAAGCAAAG |
| Intron 4 | gtatatgtttgacactaccaagtattggtggtgcctaacatgggcacactgtgtatgaat
gacctagaatagcttaggttatgaatccgtttatgaagtatataaatttaggtacacaca
gtaattggcaaactcatggtaatgaatcaattaaataaagcagtagggcctaaagacacc
cctcatttttcaaaagttggcgcctatgctgccaagcgtgagataaattcaaaaatatct
gttggtaaaaagtttcaatgccctgctaagattgcagaggtttaatttcacttcttattc
atgataagaaatgttggtttaaaaactgaattgccagtgtggttgttttagaagaaattt
taagttaaaacaaacattgttgtcggttaatgatgagtcaacttcaggtccgtgtttttg
aaactaattcattaccatgaattagtttaaatcattttttttttttttttcaagtttaac
tattattgtgtttgattttaaaataaatcatttaagataacaactgaagttctgaatatc
gacgtattgttatatttaatacgctaatgtgagtgtggataatgtaacagacatagatca
aatccagtgaattaaatttatttaaaatgatatatagttgtctgaaatagcatcatcagt
ctcttatttacatagaaccacctaaatttaagaagttttactttggttattcaaataaat
atgtttaagttccatttactgatggaataataatgcagaaaaactcaatttggaaatatt
ttag |
| Exon 5 | TACAAGTTGTGCAAGGTGAAGAAGGTTGCCACGGCGCCCAAGGGAGTCCCGTACCTCGTC
ACCCACGATGCACGAACCATTCGTTACCCCAACCCCGATATTAAGGTACACGATACAGTG
GTTGTTGATATCGCGAGTGGAAAGATTACTGGTTTTGTGCATTTGGACAGCG |
| Intron 5 | gtgagtgattcaaacatttctctagtaatgcatagtctcttgtgtggaaattattaaaag
ttgtattttgcagctgtagtgaatattttattatgcgattagttggacttgatttttgtc
agttatgtttttgtagcaccggatccctataatattttttaggttttatgcttgtttggt
ttgaaacaaatcacagtacatttattactgcatgtttatctgtaacaaacttatagcacc
caagtgtgttcaagtctgtgatcatggagggaaaaatagccttttgcatatttggtaact
tgttaggcatgaacaaggtgtaataaacagtcaagtcaccattggaactattatgggagc
tggcccaccacgtggaatatatgattatataataaaacccatgtag |
| Exon 6 | GTAACATGTGCATGATCACTGGAGGTCACAACTTGGGGCGAGTAGGAACAGTTATGCATA
GAGAGAGACATCCAGGATCATTTGACATCATCCACGTAAAAGATGCGCTCGGCCACACCT
TTGCTACCCGTCTATCGAATGTTTTCATCATAGGCCAG |
| Intron 6 | gttaaacatgcttgctaaccaaatttgataatatagttttaatttttttaatgtttacct
gggttattgaacagttttattttactggctcccagattttagatatgttctgccacagta
aataccaaacttattgtgaactagattaagtagcatactgaagcttatttcttgtatgaa
aaatacagtttgagaagtgatggttaaaatgtctagcaatattacctacattatcaatct
gacaattcttcacccaagcaaactcattcacaatattttgttgtcggttaatgatgagtc
aacttcaggtccgtgtttttgaaaccaatgataacaactgaagttctgaataccgacgta
ttgttatattttactcgtacacaattgtggaagttttatttgaacattcaaatacatata
ttttgccagcttgtataagaatactgagatacagtttattgaaataacttcattaacatt
tgatgtggaggggtaaaagttacaccagctatagcctacctacctactactaaattcgtt
catacttaacaactaaacttttactgcaagaaatattaacacaatcatatttttaacag |
| Exon 7 | GCCAACAAACCAATGGTTTCCCTTCCACGAGGAAAAGGAATCAAACTGACGATCGCTGAA
GAGAGAGACCGTCGGTTGGCAACAAAGTAAATGCCATTGAATTGAGCATTTCAATAAATA
TTGAAATCGGATTTA |
| 3' Downstream | gttttgtttctttattgtgtatagcctcagattgcgtaagttctaaaagcaggcaatgca
gcctatatagtatgctgggaacagacttaattttatcccagcacagcataaaactctagt
ttgtattcttactttggcaattgaatctgaattacgagattttaaaatcaaaccctgctt
tttctggttggaaaaaaatgtcaagtgtttacacttatgtaggctgttggggatcgggtt
ttatttctagagaaagttttaaaaggcaaggctggctgttgttgaatgtttattacaatt
ttaatatgactttaattagtaagtgagctactctgccaactgagacttcatatgttcagt
agaataaacacaataatagttaaacttgtttcaatgttaattattcataaacatggaata
cacaatagacagtattggtttacaactttacagttattgcaccaaattgcaaaggttttc
ggaacaaatcaaagacacaaagaaattacttacaataataaacccaaaatgcacctaatt
ttaccacaaataaaaacacacattatcgtaacatcataggcgtcctacacaacgggcaag
tggattgattacttgtgtcaaaccacttgtacaagcattctgcatggtattttttcttgc
atgtcttgcattgtagttttggtaaggactgtgagttggagccgtgcactacagagaaac
atatcatgcattcctcaagcccatggagccgtttgtcaactttttccttccacaaataca
aagcatccagtatttggccgttctggtgtcgtaataacattgtcatctgtagaatccaat
atctccattgagttgctttcactcctgcttttctaaccgtgtttacttgtacagggctca
gagggtaatttgttggtagttgtattgaaataacaaactctgcgtcagtgatttgatatg
tcgcaacaacttctttcgaagctggacgtgcaacaacatc |
