Ciona intestinalis - RPL17


SpeciesCiona intestinalis
Gene NameRPL17
5' Upstream
attggtgggaaccaggggaaatttcaacttccaccttgaaccgaggtggaagagatctca
gcaatcgaactcggattgcaagaccaattagagtggccatactgcagtgaggaatagtag
gtgtgaacgaaacctggaattaatggtatgtgcattggtaaataaaacactgatatgatt
tatggttcgaatacaaaagttttacagagatgaatgtcatttatttgttcttgtgtgtag
aggggcaagacgacattaaaagactgatgtgaagtatcataattattgaaccctcttaca
agttaccatgtatattactttattggtaatctcttgttaaaagacaaacactttacccca
gtatcatggtgtggaacttgtcagccaatacttgttgttattgttacacatggaaaacaa
aaaatgatgatagctttatagcagctacataataaaatccttacttttatgaaacttttt
tcatcatcaacttcaatgtcgttttcgctaaccactcttaagtcctctaaagtcaacgga
tgttcaggatcattaatatcccggattaaatcgaatatttctcggcgatcaaacggatcc
cgaacatcgttatcaagttctgcaggttgctttatccttgtgcggggcgttattcgctga
tgaaccagcgggttcaagttgtctttttgcgtttcattcatgactccgcaataaacaatg
tgtaacccaaagagtaaaaaacaagtctcatgtcgaggtaggggaagtccctttgtatta
aactaataaaaataccaatgagtgaaaaaaaacaataaagtaaacaatgaaatataaaac
ctttagccctacaaaattacacatttaaccttataaatatagtttgtatattgttcactg
ttctaatttttaccccgctaaagtaaaatctttgataaaacgataaatactaatatttct
atgtggctgacgcggtgtgaaaattacagtcgctgaaaaa
Exon 1
GTCTTTCCCATGACTGCGTGTCAT
Intron 1
gtaggtagttgttccttttttaactaattataatccaagttaatcgtggtttatcgtggt
tatagtgcagtataaagtatcctattgttacacag
Exon 2
AATGACGAGATACTCTCAAGACCCGGAAAATCCGGCCAAATCATGCAAGGCGAGGGGTTC
AGACCTTCGAGTTCACTTCAAGAACACCAGAGAAACCGCTCAAGCTATTAAGGGAATGCA
CATTCGCAAGGCTACTCAGTACCTTAAGGACGTTTGCGAAAAAAAGCGATGCATTCCATT
TCGTCGATTTAATGGCGGAGTGGGTCGATGTGCTCAAGCAAAAGAGTTCAAAACTACCCA
G
Intron 2
gtaagcgattcatttttgaaattatcctgtaaattgtgagacagctttgcttatgataaa
acatggctgagttgcgtcaatttactaaatatctggtaatactgtcgctggtgactacga
ccagtgaaacttttagtcttaaaatgttcctaacatctccctgatacccgctgttaattt
tcaacacgaatgccctagttttttcgaaaaataaattatacagcgggtatcagggagacg
taaggaacattttaagaccaaaattttcactggttaccagcggcagtattaccaatatct
ggggcatgcggagcgcacctgtgtgttgactatgatgtcatatgcgtcattggataagtt
aggtgcatacgtttttttttttctgcagaaatcacaacattaacatcacactgcgtttct
aaccaggtacaaaaaatataatttgtctagtaaacagatgacagcctaaatatgttttga
aagtagcactgctttatttttgcgccatttttctcagccaagaaccatgttttttgagaa
ataatagtaagtcaaacatttattatttttgtcatagcaattgacacgtccattgtttag
cctgcaggtgtgaggtgattaaagacaggttgaataattgccttttcacgtatatgatca
agtaaagtattgataggtttgcaaaaagtactttgtacgcccacaacataatactctatg
tctccacggctctggtgatgatcagcgtgcttgaagatgttatataaggcattttgcgtt
attaatattttttctacatttttgtcattgtagtcaggtatacaactgctgcttcttgtc
ttgattttttaatgaataatacctagttattctcgcaagcagcgaatgtaccggattatg
cgttaccacaactttgaggttgatctttttttgttatggctaaaaatttgaacaactcat
tagtgactaataggctggatcagtgttcgttaggtgttgagcttgccaataggtactaga
ggtaatcagtttataagagtaactgtctaattacaagcgacaatgcattaagaagcttgt
tttttgctaaaattttcctgattttaagccttacatacctttgcacttattttttattta
tgttattatactagtactaatgcagtccaatacacttattatgattaatccttttttgtt
tgaacag
Exon 3
GGTCGATGGCCAAAGAAGAGCGCCACATTCCTCCTGCAGATGTTGAAGACTGCTGAGAGC
AATGCTGATGTAAAGGGTCTTGATGTTGATTCTCTTGTAATAGATCACATCCAGGTGAAT
GCTGCAGCAAAGATGAGACGACGAACTTACAG
Intron 3
gtgtttgattgaatttatattgttatgcaattaacatgtattgctaaacattgatttacc
tcaatggatttcaaccttcagtcaaaatctttcaaaaatgttttttttttttttcgctcg
aagcaaagctttaaagtgaacttttctgttcacaacaacaaacattccacttgcacgttg
aaaaccgctgtgatagtttaataacttaaaagctgtgtgtatttgttgcgcacctacact
tgtttgttgctgttcaccaaaattcacgttctgtgttcttttggtgaactagtgtgctta
cacacagctaaaaataaactcagtgtcatagttccgatgtacttaacaaatgtagcacac
cggtctccaatcacttgaacaaaacaacctgcaaagggtgtttatattatttcagtgaat
ttaatacaaagataatataacaactttttctaatttccaattaattggggagcagaattt
gcggcccacaaacaaatcctgaagatttaggactgttttgaccctaaaagtatgaagcct
ttctgtataatatgcctatattccgcatatttggaattctgttacacctaggttaacaaa
tttttcatgtcataatttaacatttttttattgcataacagattgtggtgaattaacttt
tgaatgttttag
Exon 4
AGCCCACGGTCGCATTAATCCCTACATGAGCTCCCCGTGTCACATTGAAATGATCCTCAC
TGAGAAGGAGCAGATTGTTCCACGGGTTGAGGAGGAACAGAAAAAGAAGAAGGTTTCAAA
GAAGAAGATTGCTCGCCAGAAGTTAATGGGCAAGGAGTAGATCTCTCAATAAATTTACTA
TTGAAACCGAGTGCTTGTTTGTGTTGTGTATTGGTGAAATCAGATGATGATTTTATAGTC
TACTACTAACGGAGCAGTGTGCAGTTTATCTTGAAAATCTTG
3' Downstream
tgaattaagttactctgggttagggtgaaaaacacgtctatgattaaactagtaagcttc
ctttttagtgggcataaataaaattaggtattctgtactaagtaatgcacaggctaagtt
ttcccatgcactcctcttaccagtactaactttagtcattagatgagaatcacccttaaa
attaagtctaataagttatacacacaggctaaaattttagttgagtgaaaaaacacactt
gttgaaacccgtctataattaaactagtaagcttcctttttagtgggcataaataaaatt
aggtattctgtactaagtaatgcacaggctaagttttcccattcactcctcttaccagta
ctaactttagtcattagatgagaatcacccttaaaattaagtctaataagttatacacac
aggctaaaaaattttagttgagtgaaaaaacacacttgttgaaacccaattaagaaatga
gaatgtattaaaagaagaaccttatagtcaggcctacgtagctttgggaaaatcgaataa
cttcatcaaaaacggtttgaaaattcagtatttatcataaatggttttaaaactccgtat
tgtttattagaatgtaaatttgtttcaatgcctacctagcttttgaaaatcagaataact
tcatcacaattggttttaaaattcagtattgtttattgaagggtaaaatagttccaatgt
atgcacgaagatgttaagatttaaaaagggcaaactgtaactaacgtagaacaaaagata
aataaaactaacgccctgaaaaatacttaaaaccgtaacattcaggccaacagaagcaat
caataagaatttggtttctctcaatttaacatgataaatgcacagcaaaagttcgacttg
attttatagacataaatttggacgaatcgaacaaaagatttggacaagtcaaacaaactt
tgaattttaagacgaactaacattttgtcacaagaactgt